More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1019 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1019  30S ribosomal protein S8  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000503612  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1763  30S ribosomal protein S8  94.74 
 
 		 131 aa  219  8e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00017341  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0048  30S ribosomal protein S8  83.33 
 
 		 131 aa  195  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.580266  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0098  30S ribosomal protein S8  78.95 
 
 		 131 aa  194  3e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.578211  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0073  30S ribosomal protein S8  76.32 
 
 		 131 aa  187  5e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.200652  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1690  30S ribosomal protein S8  75.44 
 
 		 131 aa  184  2e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0798562  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1861  30S ribosomal protein S8  74.56 
 
 		 131 aa  184  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2067  30S ribosomal protein S8  73.68 
 
 		 131 aa  181  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1954  ribosomal protein S8  68.42 
 
 		 131 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0300  30S ribosomal protein S8  68.42 
 
 		 131 aa  161  2.0000000000000002e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.110485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2843  30S ribosomal protein S8  45.61 
 
 		 132 aa  104  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0403691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1510  ribosomal protein S8  47.71 
 
 		 134 aa  103  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.401558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3314  30S ribosomal protein S8  42.98 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000779299 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0729  ribosomal protein S8  47.66 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0947  30S ribosomal protein S8  42.98 
 
 		 132 aa  102  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00204596  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0640  30S ribosomal protein S8  42.11 
 
 		 132 aa  101  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000399724  hitchhiker  0.0000000361155 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0995  30S ribosomal protein S8  45.61 
 
 		 131 aa  101  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.159174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0856  ribosomal protein S8  47.57 
 
 		 133 aa  100  5e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1360  30S ribosomal protein S8  42.11 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000035487  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0844  30S ribosomal protein S8  45.79 
 
 		 131 aa  100  6e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.513324  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1731  30S ribosomal protein S8  44.55 
 
 		 132 aa  100  6e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000337802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0694  30S ribosomal protein S8  48.42 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.123033  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1080  30S ribosomal protein S8  42.11 
 
 		 132 aa  98.6  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0789269  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0781  30S ribosomal protein S8  45.45 
 
 		 132 aa  98.2  3e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00525969  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0503  30S ribosomal protein S8  40.37 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23330  SSU ribosomal protein S8P  43.12 
 
 		 132 aa  97.8  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000176447  hitchhiker  0.000000137084 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2697  ribosomal protein S8  44.55 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2215  30S ribosomal protein S8  44.64 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000186287  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2387  30S ribosomal protein S8  44.74 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000496692  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1569  ribosomal protein S8  45.54 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.737599  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2282  30S ribosomal protein S8  43.64 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000228338  hitchhiker  0.00320437 
 
 
-
 
NC_002936  DET0488  30S ribosomal protein S8  40.35 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000071854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0239  ribosomal protein S8  42.73 
 
 		 131 aa  95.9  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.363753  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0802  30S ribosomal protein S8  46.15 
 
 		 133 aa  95.5  2e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  decreased coverage  0.000681692  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_430  ribosomal protein S8  39.47 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000283482  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0465  30S ribosomal protein S8  39.47 
 
 		 131 aa  95.5  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000455878  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2760  30S ribosomal protein S8  44.95 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000679663  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2164  ribosomal protein S8  42.73 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00791541  normal  0.949084 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4928  30S ribosomal protein S8  42.11 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000649182  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0229  30S ribosomal protein S8  47.57 
 
 		 132 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000764714  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2319  ribosomal protein S8  41.82 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000478289  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1171  30S ribosomal protein S8  43.86 
 
 		 130 aa  95.1  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152092  normal  0.183963 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2825  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00378169  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0290  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000392794  normal  0.0211044 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2745  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000001061  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0281  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00164678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0341  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000242474  normal  0.012194 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0362  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000109852  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0299  30S ribosomal protein S8  46.49 
 
 		 130 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.541435 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0208  SSU ribosomal protein S8P  41.75 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0121954  normal  0.508174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0303  30S ribosomal protein S8  43.75 
 
 		 131 aa  94  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.20005  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0773  30S ribosomal protein S8  47.83 
 
 		 132 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.590694  normal  0.83484 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0491  ribosomal protein S8  44.34 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.263273  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0268  30S ribosomal protein S8  46.96 
 
 		 130 aa  94  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0501606  normal  0.446671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0927  ribosomal protein S8  47.87 
 
 		 133 aa  93.6  8e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000726812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4012  30S ribosomal protein S8  43.86 
 
 		 132 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000425242  hitchhiker  0.0000631247 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2605  30S ribosomal protein S8  41.82 
 
 		 131 aa  93.6  8e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000206402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3461  30S ribosomal protein S8  46.3 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000315626  decreased coverage  0.00455507 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0309  ribosomal protein S8  46.67 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000138309  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0333  30S ribosomal protein S8  47.62 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000752194  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0715  30S ribosomal protein S8  38.6 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000123217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3630  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000497619  decreased coverage  0.00000000000124793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4229  30S ribosomal protein S8  46.3 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00128443  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3981  ribosomal protein S8  46.43 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0328  30S ribosomal protein S8  48.57 
 
 		 131 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000354136  decreased coverage  0.00289436 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0598  30S ribosomal protein S8  44.76 
 
 		 132 aa  92.4  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0508893  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0263  30S ribosomal protein S8  47.62 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000657656  hitchhiker  0.00182938 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0423  30S ribosomal protein S8  45.71 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.376685  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3303  30S ribosomal protein S8  46.67 
 
 		 131 aa  92  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0633742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2141  SSU ribosomal protein S8P  42.98 
 
 		 132 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.210808  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0615  30S ribosomal protein S8  46.3 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0938448  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1850  ribosomal protein S8  47.37 
 
 		 133 aa  92.4  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.84535e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2446  30S ribosomal protein S8  40.91 
 
 		 130 aa  91.7  3e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.621263 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1354  ribosomal protein S8  43.36 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1938  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00217101  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3790  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.19991  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2618  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.00463445  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3762  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000826269  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0722  ribosomal protein S8  43.75 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1729  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3054  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000128186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1240  30S ribosomal protein S8  46.6 
 
 		 133 aa  91.3  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.455541  hitchhiker  0.000777173 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0375  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3732  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000192873  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3155  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0148132  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2520  30S ribosomal protein S8  46.96 
 
 		 132 aa  91.7  4e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3492  30S ribosomal protein S8  45.37 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.107985  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01310  ribosomal protein S8  43.62 
 
 		 132 aa  90.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.246341  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1837  30S ribosomal protein S8  43.12 
 
 		 131 aa  90.9  6e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.247256  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3010  30S ribosomal protein S8  42.61 
 
 		 133 aa  90.5  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0643705  hitchhiker  0.00964869 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2358  ribosomal protein S8  48.04 
 
 		 131 aa  90.5  8e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0195  30S ribosomal protein S8  41.96 
 
 		 131 aa  90.1  8e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.344258  normal  0.96211 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0881  30S ribosomal protein S8  40 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.242013  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0093  30S ribosomal protein S8  47.12 
 
 		 126 aa  90.1  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0407651 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2311  30S ribosomal protein S8  44.95 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0101074  normal  0.226186 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1893  30S ribosomal protein S8  41.07 
 
 		 132 aa  90.1  9e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000438805  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2409  30S ribosomal protein S8  44.55 
 
 		 131 aa  90.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0017474  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3165  30S ribosomal protein S8  44.76 
 
 		 131 aa  89.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000492861  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0419  SSU ribosomal protein S8P  48.57 
 
 		 131 aa  90.1  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00478629  normal  0.230191 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0605  30S ribosomal protein S8  46.09 
 
 		 130 aa  89.4  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.354431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>