More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1007 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1007  50S ribosomal protein L17  100 
 
 		 99 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.168469  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1750  50S ribosomal protein L17  93.94 
 
 		 99 aa  191  3e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00132391  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  83.67 
 
 		 117 aa  170  5.999999999999999e-42  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0204  50S ribosomal protein L17  82.83 
 
 		 118 aa  166  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1768  50S ribosomal protein L17  79.59 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1583  50S ribosomal protein L17  79.59 
 
 		 117 aa  165  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0060  50S ribosomal protein L17  79.8 
 
 		 118 aa  164  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.927708  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1949  50S ribosomal protein L17  77.55 
 
 		 117 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0521234  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1941  ribosomal protein L17  76.29 
 
 		 116 aa  153  8e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0328  50S ribosomal protein L17  73.2 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3966  ribosomal protein L17  54.64 
 
 		 116 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  55.67 
 
 		 141 aa  113  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 139 aa  112  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0342  ribosomal protein L17  51.89 
 
 		 125 aa  108  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  51.02 
 
 		 126 aa  105  3e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 114 aa  104  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  43.43 
 
 		 151 aa  103  5e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  51.02 
 
 		 146 aa  103  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2346  ribosomal protein L17  49.48 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 190 aa  101  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 140 aa  101  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  52.04 
 
 		 139 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  47.42 
 
 		 137 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  49.48 
 
 		 112 aa  101  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  49.49 
 
 		 190 aa  101  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0210  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 130 aa  100  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000848705  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 169 aa  100  7e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  50.52 
 
 		 143 aa  100  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  49.48 
 
 		 112 aa  99.4  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 116 aa  99.4  1e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  52.58 
 
 		 141 aa  99.8  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  47.96 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0196  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00364658  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  50 
 
 		 136 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0174  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000106796  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  51.02 
 
 		 137 aa  99.8  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0345  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 126 aa  98.6  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.899411  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  51.55 
 
 		 172 aa  99  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0832  ribosomal protein L17  50 
 
 		 138 aa  99.4  2e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1839  50S ribosomal protein L17  52.17 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.501315  normal  0.68282 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  46.39 
 
 		 112 aa  98.6  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  48.98 
 
 		 138 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  47.42 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0965  50S ribosomal protein L17  52.58 
 
 		 176 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.537634  normal  0.269592 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  49.49 
 
 		 195 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0588  50S ribosomal protein L17  49.5 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.348029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  47.47 
 
 		 178 aa  98.2  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  49.49 
 
 		 195 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  49.48 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 180 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  49.49 
 
 		 195 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0262  50S ribosomal protein L17  55.79 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  48.45 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  48.45 
 
 		 129 aa  97.4  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  48.98 
 
 		 131 aa  97.4  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  48.98 
 
 		 131 aa  97.1  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  48.98 
 
 		 132 aa  97.1  7e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0630  ribosomal protein L17  52.58 
 
 		 183 aa  97.1  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  49.48 
 
 		 144 aa  97.1  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3135  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 156 aa  97.1  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0512545  normal  0.850986 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  48.45 
 
 		 137 aa  97.1  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  96.7  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  51.52 
 
 		 203 aa  97.1  8e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  96.7  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4371  ribosomal protein L17  54.64 
 
 		 183 aa  97.1  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0225  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000697417  unclonable  0.0000000000243576 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0220  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.827106  hitchhiker  0.00534003 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0225  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  97.1  8e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0682368  unclonable  0.0000000000471873 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  47.47 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 113 aa  96.7  9e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1173  ribosomal protein L17  50.51 
 
 		 219 aa  96.7  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  49.48 
 
 		 168 aa  96.7  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4144  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0430199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  46.46 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0222  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00692395  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  54.08 
 
 		 126 aa  96.3  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00755  ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  46.39 
 
 		 127 aa  96.7  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  49.49 
 
 		 202 aa  96.7  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0354  ribosomal protein L17  51.55 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.194755  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  50.52 
 
 		 129 aa  96.3  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0225  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00200452  normal  0.0638706 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 130 aa  96.3  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4030  50S ribosomal protein L17  52.53 
 
 		 131 aa  96.3  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.544073  hitchhiker  0.000000000826999 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 130 aa  95.9  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  47.96 
 
 		 138 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  54.08 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  49.49 
 
 		 202 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>