More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0868 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0868  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 345 aa  677    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2125  rod shape-determining protein MreB  97.39 
 
 		 345 aa  665    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.55936  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0317  rod shape-determining protein MreB  93.62 
 
 		 345 aa  640    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.594365  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1397  rod shape-determining protein MreB  89.57 
 
 		 345 aa  618  1e-176  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0325  rod shape-determining protein MreB  87.57 
 
 		 346 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.208455  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1694  rod shape-determining protein MreB  87.86 
 
 		 346 aa  609  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0303  rod shape-determining protein MreB  87.57 
 
 		 346 aa  608  1e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0187  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  86.63 
 
 		 344 aa  597  1e-170  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00128251  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1352  rod shape-determining protein MreB  84.26 
 
 		 343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.261173  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1465  rod shape-determining protein MreB  77.39 
 
 		 345 aa  541  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28948  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  59.18 
 
 		 346 aa  421  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  59.41 
 
 		 347 aa  418  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5932  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  59.82 
 
 		 344 aa  421  1e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  59.41 
 
 		 347 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  59.52 
 
 		 343 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  58.82 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  57.52 
 
 		 346 aa  409  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 344 aa  404  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  57.18 
 
 		 343 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.27 
 
 		 344 aa  405  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3594  rod shape-determining protein MreB  56.89 
 
 		 348 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000028278  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 346 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1466  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  57.73 
 
 		 347 aa  404  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  57.14 
 
 		 343 aa  401  1e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  56.6 
 
 		 344 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1301  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 		 343 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.753188  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  55.39 
 
 		 344 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  56.01 
 
 		 346 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0540  rod shape-determining protein MreB  56.4 
 
 		 343 aa  398  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.172145 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5269  rod shape-determining protein MreB  54.93 
 
 		 343 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.558763  normal  0.287821 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  56.42 
 
 		 340 aa  392  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 		 347 aa  392  1e-108  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  57.61 
 
 		 340 aa  394  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 		 346 aa  391  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1211  rod shape-determining protein MreB  54.03 
 
 		 343 aa  390  1e-107  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.984944 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4598  rod shape-determining protein MreB  57.52 
 
 		 336 aa  386  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3465  rod shape-determining protein MreB  55.56 
 
 		 342 aa  385  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.23353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1540  rod shape-determining protein MreB  57.02 
 
 		 344 aa  384  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00158953  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  56.43 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7282  cell shape determining protein MreB  52.84 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356683  normal  0.20928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  57.36 
 
 		 347 aa  378  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  55.85 
 
 		 346 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 		 348 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  56.16 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1641  rod shape-determining protein MreB  55.26 
 
 		 340 aa  379  1e-104  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000187033  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  54.3 
 
 		 343 aa  381  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  56.63 
 
 		 339 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  57.4 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2658  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  53.89 
 
 		 350 aa  377  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.228643 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  57.4 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1388  rod shape-determining protein MreB  52.82 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4351  rod shape-determining protein MreB  55.09 
 
 		 338 aa  372  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00355227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1404  rod shape-determining protein MreB  53.94 
 
 		 348 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000135004  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  56.47 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  56.46 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  56.08 
 
 		 347 aa  371  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2820  rod shape-determining protein MreB  56.3 
 
 		 346 aa  371  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0748  rod shape-determining protein MreB  53.59 
 
 		 368 aa  373  1e-102  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.508167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0082  rod shape-determining protein MreB  54.28 
 
 		 366 aa  370  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4158  rod shape-determining protein Mbl  54.98 
 
 		 345 aa  368  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.53074  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  55.42 
 
 		 345 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  56.8 
 
 		 347 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  54.9 
 
 		 349 aa  370  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  53.04 
 
 		 346 aa  369  1e-101  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 		 348 aa  365  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  54.73 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  53.71 
 
 		 345 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1670  rod shape-determining protein MreB  54.46 
 
 		 358 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618582 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  53.69 
 
 		 349 aa  367  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  55.86 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17730  rod shape-determining protein Mbl  56.44 
 
 		 344 aa  366  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2398  rod shape-determining protein MreB  54.22 
 
 		 342 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2110  rod shape-determining protein MreB  54.52 
 
 		 342 aa  366  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  54.95 
 
 		 347 aa  367  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>