165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0812 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  100 
 
 
271 aa  561  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  48.09 
 
 
279 aa  272  4.0000000000000004e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  36.68 
 
 
279 aa  186  4e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  34.51 
 
 
265 aa  148  9e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  31.64 
 
 
274 aa  125  7e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  27.45 
 
 
274 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  26.88 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  30.16 
 
 
270 aa  95.1  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  25.53 
 
 
283 aa  92  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.22 
 
 
269 aa  89.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  33.5 
 
 
287 aa  87.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  30.3 
 
 
279 aa  86.3  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
280 aa  86.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  29.43 
 
 
279 aa  82  0.000000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  27.34 
 
 
280 aa  80.5  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  27.38 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  25.4 
 
 
283 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  26.16 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
276 aa  77  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  27.24 
 
 
279 aa  77.4  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  31.4 
 
 
278 aa  76.6  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  24.68 
 
 
286 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 
293 aa  74.7  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.1 
 
 
278 aa  73.6  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  40.91 
 
 
275 aa  70.5  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  25.51 
 
 
293 aa  69.7  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  23.28 
 
 
268 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  31.17 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  27.23 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  24.07 
 
 
283 aa  67.8  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  33.33 
 
 
268 aa  67  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  35.25 
 
 
352 aa  63.2  0.000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  25.56 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  29.41 
 
 
291 aa  60.1  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  21.76 
 
 
287 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  21.01 
 
 
295 aa  59.3  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  25 
 
 
191 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  25.11 
 
 
254 aa  58.9  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  25.32 
 
 
277 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
288 aa  58.9  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  30.17 
 
 
263 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  33.05 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  24.5 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  26.89 
 
 
279 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  30.85 
 
 
323 aa  56.6  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  30.53 
 
 
298 aa  56.6  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  28.21 
 
 
319 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.19 
 
 
294 aa  55.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  32 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  24 
 
 
291 aa  54.7  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  29.14 
 
 
289 aa  54.7  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.91 
 
 
291 aa  53.9  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  24.3 
 
 
273 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  24.3 
 
 
273 aa  53.9  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  43.64 
 
 
217 aa  53.9  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  25 
 
 
268 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  30.17 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  26.98 
 
 
284 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1723  methyltransferase type 11  49.12 
 
 
174 aa  52.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.9969  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  33.33 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.13 
 
 
209 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  28.35 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  26.87 
 
 
273 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.36 
 
 
270 aa  50.4  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1511  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
208 aa  49.7  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.298686 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
180 aa  49.7  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2593  Methyltransferase type 11  38.81 
 
 
250 aa  48.9  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0558  Methyltransferase type 11  35.94 
 
 
188 aa  48.9  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0166016  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2978  hypothetical protein  38.81 
 
 
230 aa  48.9  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0736  tellurite resistance protein TehB  35.62 
 
 
208 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.304393  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  30.21 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0289  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.72 
 
 
281 aa  47.8  0.0002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1102  RNA methyltransferase, TrmA family  33.33 
 
 
446 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0040  hypothetical protein  31.03 
 
 
274 aa  48.1  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.25968  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1249  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
385 aa  47.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.419487  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02630  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase  31.08 
 
 
433 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00985329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02592  hypothetical protein  31.08 
 
 
433 aa  47.4  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00971306  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  28.69 
 
 
239 aa  47  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  28.47 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
255 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  28.18 
 
 
262 aa  46.6  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  38.33 
 
 
439 aa  46.6  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  42 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  28.78 
 
 
299 aa  46.6  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0428  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0438  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0218483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0415  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
278 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.670256 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
265 aa  46.2  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
256 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2030  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.35 
 
 
440 aa  46.2  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000223089  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  28.07 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  29.66 
 
 
277 aa  45.8  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3016  methyltransferase small  38.89 
 
 
317 aa  45.4  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0903  RNA methyltransferase, TrmA family  31.08 
 
 
433 aa  45.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000019395  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.98 
 
 
253 aa  45.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0660  RNA methyltransferase, TrmA family  28.05 
 
 
475 aa  45.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.107668  normal  0.988536 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2929  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  31.08 
 
 
433 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000010107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>