More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0789 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0789  inner membrane protein YfcA  100 
 
 
253 aa  492  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0160  hypothetical protein  80.48 
 
 
253 aa  412  1e-114  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00166845  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0770  inner membrane protein YfcA  65.75 
 
 
257 aa  343  2e-93  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00655401  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0722  inner membrane protein YfcA  63.64 
 
 
254 aa  315  5e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1372  protein of unknown function DUF81  56.57 
 
 
253 aa  279  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000140624  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0394  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  51.38 
 
 
250 aa  259  2e-68  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1432  hypothetical protein  49.59 
 
 
257 aa  251  7e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00341761  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1817  hypothetical protein  48.81 
 
 
254 aa  249  3e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1462  hypothetical protein  48.81 
 
 
254 aa  249  4e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1642  hypothetical protein  48.83 
 
 
254 aa  247  1e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.568277  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2504  protein of unknown function DUF81  48.77 
 
 
254 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1312  hypothetical protein  44.66 
 
 
253 aa  232  4.0000000000000004e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1516  hypothetical protein  47.08 
 
 
268 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1407  hypothetical protein  47.08 
 
 
268 aa  228  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0345183  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0375  hypothetical protein  47.08 
 
 
268 aa  228  5e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3372  hypothetical protein  47.92 
 
 
266 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.264198  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1715  protein of unknown function DUF81  47.95 
 
 
254 aa  227  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000213393 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2624  hypothetical protein  48.16 
 
 
269 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.754469  hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2571  hypothetical protein  48.16 
 
 
269 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2735  hypothetical protein  48.16 
 
 
269 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2611  hypothetical protein  48.16 
 
 
269 aa  226  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.692878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2875  hypothetical protein  46.72 
 
 
270 aa  226  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0415169  normal  0.12282 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2522  hypothetical protein  48.16 
 
 
269 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2591  protein of unknown function DUF81  48.33 
 
 
267 aa  223  2e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2846  hypothetical protein  45.85 
 
 
256 aa  219  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1347  protein of unknown function DUF81  47.15 
 
 
266 aa  218  7e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.340602  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2484  hypothetical protein  48.77 
 
 
269 aa  218  7e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02252  conserved inner membrane protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.563205  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1329  protein of unknown function DUF81  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.95844  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02212  hypothetical protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.53091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2622  hypothetical protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2479  hypothetical protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2705  hypothetical protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1325  hypothetical protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3468  hypothetical protein  48.36 
 
 
269 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2705  protein of unknown function DUF81  43.87 
 
 
256 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.142618  hitchhiker  0.000000969099 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1638  hypothetical protein  43.87 
 
 
256 aa  216  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0157393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1530  hypothetical protein  44.75 
 
 
257 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1653  hypothetical protein  43.87 
 
 
256 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1675  hypothetical protein  43.87 
 
 
256 aa  216  4e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102694  normal  0.253608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2451  hypothetical protein  43.87 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000200533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2613  hypothetical protein  43.87 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000000236157 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1585  permease  44.62 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2521  hypothetical protein  43.87 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000101647  unclonable  0.0000262337 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2453  hypothetical protein  45.12 
 
 
267 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2638  hypothetical protein  45.75 
 
 
259 aa  209  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.293414  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2809  hypothetical protein  50.21 
 
 
266 aa  206  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.104952  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1203  permease  42.74 
 
 
257 aa  206  3e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1455  hypothetical protein  49.79 
 
 
266 aa  206  4e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2642  hypothetical protein  44.77 
 
 
261 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3065  hypothetical protein  42 
 
 
259 aa  202  3e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.570217  hitchhiker  0.00363187 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2507  hypothetical protein  43.8 
 
 
253 aa  199  3e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1433  permease  42.15 
 
 
268 aa  199  3.9999999999999996e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1266  hypothetical protein  43.7 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.612634  hitchhiker  0.000168784 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1880  hypothetical protein  45.73 
 
 
272 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.531146  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004476  membrane protein  41.5 
 
 
259 aa  194  8.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.61152  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1837  hypothetical protein  42.19 
 
 
251 aa  193  2e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1748  hypothetical protein  44.59 
 
 
261 aa  193  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.179176 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1267  hypothetical protein  43.72 
 
 
272 aa  193  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1303  hypothetical protein  43.72 
 
 
261 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3956  hypothetical protein  44.4 
 
 
256 aa  191  7e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2122  hypothetical protein  41 
 
 
251 aa  191  1e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2248  hypothetical protein  40.48 
 
 
256 aa  190  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.71549  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2464  hypothetical protein  44.64 
 
 
254 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000359609 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0368  hypothetical protein  38.96 
 
 
254 aa  187  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.003766  hitchhiker  0.000586302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0278  integral membrane protein  44.05 
 
 
256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2454  hypothetical protein  39.92 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.250763  hitchhiker  0.00875229 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2721  hypothetical protein  39.53 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0294  hypothetical protein  44.05 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0308  hypothetical protein  44.05 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0339  hypothetical protein  44.05 
 
 
256 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0380  hypothetical protein  44.05 
 
 
256 aa  182  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0281  integral membrane protein  43.65 
 
 
256 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2880  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460718  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0337  hypothetical protein  43.25 
 
 
256 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3473  hypothetical protein  39.13 
 
 
259 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3627  hypothetical protein  39.13 
 
 
259 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.849731  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1810  hypothetical protein  38.74 
 
 
259 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.731275 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3018  hypothetical protein  38.71 
 
 
252 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3059  protein of unknown function DUF81  40.76 
 
 
251 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1843  hypothetical protein  38.34 
 
 
259 aa  175  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0289  hypothetical protein  41.11 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2072  hypothetical protein  37.55 
 
 
281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.112415  normal  0.0151048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3780  hypothetical protein  38.15 
 
 
263 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.779876  normal  0.855482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0354  hypothetical protein  41.43 
 
 
256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2881  inner membrane protein YfcA  41.94 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.752456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2491  protein of unknown function DUF81  42.41 
 
 
249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.33045 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2657  hypothetical protein  37.35 
 
 
257 aa  172  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2455  inner membrane protein YfcA  42.38 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4966  hypothetical protein  41.04 
 
 
256 aa  169  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4036  protein of unknown function DUF81  38.96 
 
 
263 aa  169  3e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.843514  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2127  protein of unknown function DUF81  40.26 
 
 
261 aa  169  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.745241  normal  0.0256004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2471  hypothetical protein  35.08 
 
 
257 aa  169  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00175338 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2631  hypothetical protein  35.08 
 
 
257 aa  169  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00352704 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2539  hypothetical protein  35.08 
 
 
257 aa  168  6e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.52018  hitchhiker  0.00169881 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1818  hypothetical protein  35.98 
 
 
257 aa  168  7e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2502  hypothetical protein  40.61 
 
 
252 aa  168  8e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.656569  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0883  protein of unknown function DUF81  37.34 
 
 
270 aa  168  9e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4074  protein of unknown function DUF81  38.94 
 
 
263 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003964  hypothetical protein  39.36 
 
 
261 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.224293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>