120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0753 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  100 
 
 
296 aa  603  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  37.9 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0148  restriction endonuclease  38.49 
 
 
302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000609168  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  37.79 
 
 
302 aa  192  6e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  37.46 
 
 
310 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  37.14 
 
 
310 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  38.06 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  34.63 
 
 
305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  34.63 
 
 
305 aa  179  4e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1408  restriction endonuclease  34.31 
 
 
302 aa  178  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1084  restriction endonuclease  34.19 
 
 
304 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  35.28 
 
 
303 aa  175  7e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3601  restriction endonuclease  38.69 
 
 
293 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  37.58 
 
 
303 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1586  restriction endonuclease  33.12 
 
 
304 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  35.14 
 
 
306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0888  5-methylcytosine-specific restriction enzyme  36.69 
 
 
306 aa  166  4e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  31.73 
 
 
306 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1958  restriction endonuclease  35.03 
 
 
312 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.89806  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  33.76 
 
 
304 aa  157  3e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1609  restriction endonuclease  34.21 
 
 
297 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.355055  normal  0.341579 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  34.19 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0422  sodium- and chloride-dependent transporter  60.98 
 
 
128 aa  152  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.37197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  33.87 
 
 
304 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  33.87 
 
 
304 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  33.75 
 
 
310 aa  149  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4209  restriction endonuclease  33.86 
 
 
311 aa  142  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000116308 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4933  Mrr restriction system protein  32.15 
 
 
304 aa  139  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  33.01 
 
 
305 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  33.01 
 
 
305 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1502  restriction endonuclease  28.94 
 
 
307 aa  136  5e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.677027  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1873  restriction endonuclease  29.67 
 
 
297 aa  112  6e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0554  restriction endonuclease  30.54 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4287  restriction endonuclease  28.96 
 
 
291 aa  101  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.253945 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0036  restriction endonuclease  28.67 
 
 
325 aa  94.7  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0084  restriction endonuclease  26.96 
 
 
300 aa  87  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.243939  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0411  restriction endonuclease  33.33 
 
 
374 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2295  hypothetical protein  35.5 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3348  restriction endonuclease  26.22 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.26696  normal  0.0571713 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  34.59 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1615  restriction endonuclease  27.85 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3690  restriction endonuclease  26.56 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3744  restriction endonuclease  26.03 
 
 
291 aa  75.5  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.464694  normal  0.208515 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1132  restriction endonuclease  26.83 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.574602  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  30.22 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4639  restriction endonuclease  27.91 
 
 
286 aa  73.6  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000167857  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1406  restriction endonuclease  33.1 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000555478  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  38.24 
 
 
154 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  38.24 
 
 
154 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  38.24 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  33.58 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  32 
 
 
326 aa  70.1  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  37.98 
 
 
125 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  36 
 
 
421 aa  69.7  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1115  type II restriction endonuclease, putative  32.05 
 
 
333 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.162238  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1674  restriction endonuclease  30.28 
 
 
345 aa  65.9  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.890961  hitchhiker  0.000510843 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1858  restriction endonuclease-like  31.85 
 
 
349 aa  65.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1614  restriction endonuclease  28.57 
 
 
585 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000775525  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3007  restriction endonuclease  31.03 
 
 
454 aa  61.6  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7869  hypothetical protein  33.33 
 
 
250 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  30.34 
 
 
493 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  32.81 
 
 
349 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  31.03 
 
 
454 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0010  restriction endonuclease  31.93 
 
 
271 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.139024  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  30.94 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0538  restriction endonuclease  30.52 
 
 
314 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  32.54 
 
 
262 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  35.66 
 
 
447 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2388  restriction endonuclease  29.03 
 
 
327 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2769  restriction endonuclease, putative  29.03 
 
 
440 aa  58.5  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2898  restriction endonuclease  29.66 
 
 
454 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  32.81 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  33.02 
 
 
285 aa  57.4  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  28.26 
 
 
345 aa  56.2  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2603  restriction endonuclease  27.64 
 
 
342 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1131  restriction endonuclease  30.88 
 
 
450 aa  55.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.134013  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2515  restriction endonuclease  32.31 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  31.5 
 
 
520 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3380  restriction endonuclease  30.56 
 
 
453 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  27.4 
 
 
289 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2745  restriction endonuclease  30.58 
 
 
222 aa  53.1  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0325  restriction endonuclease  31.45 
 
 
196 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00383479 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3360  restriction endonuclease  28.33 
 
 
330 aa  52  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271395  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  27.5 
 
 
230 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4815  restriction endonuclease  32.69 
 
 
363 aa  52  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52400  restriction endonuclease  27.78 
 
 
271 aa  52.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.91 
 
 
355 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1312  restriction endonuclease  32.54 
 
 
455 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3258  restriction endonuclease  28.97 
 
 
454 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  33.05 
 
 
374 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4180  restriction endonuclease  30.65 
 
 
196 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  31.82 
 
 
348 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0488  restriction endonuclease  26.03 
 
 
317 aa  49.7  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  32.76 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3383  restriction endonuclease  31.73 
 
 
351 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  28.68 
 
 
169 aa  49.3  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2800  hypothetical protein  32.22 
 
 
313 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0352822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4097  restriction endonuclease  29.84 
 
 
208 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3871  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.8 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.821723 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3985  DNA topoisomerase type IA zn finger domain protein  28.8 
 
 
323 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>