More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0445 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0724  methionyl-tRNA synthetase  63.92 
 
 		 629 aa  833    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.27292  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0445  methionyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 636 aa  1323    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.465534  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0925  methionyl-tRNA synthetase  59.49 
 
 		 628 aa  788    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0673  methionyl-tRNA synthetase  64.85 
 
 		 642 aa  860    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.999123  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1065  methionyl-tRNA synthetase  56.7 
 
 		 644 aa  757    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.241007  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0855  methionyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 628 aa  784    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.411642  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0988  methionyl-tRNA synthetase  59.02 
 
 		 628 aa  780    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.502163  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0727  methionyl-tRNA synthetase  67.66 
 
 		 638 aa  906    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.163766  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0796  methionyl-tRNA synthetase  71.18 
 
 		 632 aa  946    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  unclonable  0.000000000458098  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1559  methionyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 628 aa  575  1.0000000000000001e-163  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0981514  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0066  methionyl-tRNA synthetase  46.09 
 
 		 632 aa  565  1e-160  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000521971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0307  methionyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 		 653 aa  561  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1659  methionyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000413814  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1732  methionyl-tRNA synthetase  44.53 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.210684  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1196  methionyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 		 647 aa  552  1e-156  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0033  methionyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 		 648 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.984575  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1622  methionyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 		 638 aa  549  1e-155  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0796  methionyl-tRNA synthetase  44.41 
 
 		 650 aa  546  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2096  methionyl-tRNA synthetase  45.76 
 
 		 654 aa  540  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0128  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 650 aa  539  9.999999999999999e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000783903  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0067  methionyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 		 647 aa  536  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000025899  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1239  methionyl-tRNA synthetase  43.16 
 
 		 645 aa  535  1e-150  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1187  methionyl-tRNA synthetase  43.35 
 
 		 634 aa  532  1e-150  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00127744  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0049  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 645 aa  532  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000287272  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1557  methionyl-tRNA synthetase  43.07 
 
 		 665 aa  529  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0048  methionyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 651 aa  531  1e-149  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000300514  hitchhiker  0.00000703201 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20300  methionyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 653 aa  528  1e-148  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000027518  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0485  methionyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 667 aa  526  1e-148  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 		 660 aa  526  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0128  methionyl-tRNA synthetase  42.73 
 
 		 656 aa  522  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0524  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 657 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0511  methionyl-tRNA synthetase  43.52 
 
 		 657 aa  523  1e-147  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0633503  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0033  methionyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 		 659 aa  524  1e-147  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.89538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0031  methionyl-tRNA synthetase  43.8 
 
 		 650 aa  523  1e-147  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 660 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0256  methionyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 634 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.744467  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5273  methionyl-tRNA synthetase  43.38 
 
 		 660 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0043  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 660 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0842  methionyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 		 666 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0205  methionyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 		 681 aa  518  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.31302  normal  0.0889763 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0034  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 660 aa  514  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0034  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0047  methionyl-tRNA synthetase  43.23 
 
 		 660 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0043  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 660 aa  514  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0037  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 660 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0210  methionyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 675 aa  509  1e-143  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0036  methionyl-tRNA synthetase  43.12 
 
 		 660 aa  510  1e-143  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2533  methionyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 		 645 aa  509  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2847  methionyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 		 645 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0043  methionyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 655 aa  502  1e-141  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1694  methionyl-tRNA synthetase  48.08 
 
 		 511 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00103031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2232  methionyl-tRNA synthetase  47.86 
 
 		 510 aa  489  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3204  methionyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 640 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3156  methionyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000108199  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1512  methionyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 648 aa  483  1e-135  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000547947  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3207  methionyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 509 aa  484  1e-135  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000597609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1056  methionyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 509 aa  483  1e-135  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000270708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2030  methionyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 671 aa  483  1e-135  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2321  methionyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 		 509 aa  482  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000064425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1098  methionyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 654 aa  480  1e-134  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1949  methionyl-tRNA synthetase  46.3 
 
 		 508 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0300  methionyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 		 702 aa  478  1e-133  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.157551  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1662  methionyl-tRNA synthetase  47.56 
 
 		 506 aa  478  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0988  methionyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 624 aa  474  1e-132  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3184  methionyl-tRNA synthetase  39.94 
 
 		 648 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0025  methionyl-tRNA synthetase  39.55 
 
 		 664 aa  473  1e-132  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0492884  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1746  methionyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 		 675 aa  473  1e-132  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0359  methionyl-tRNA synthetase  48.64 
 
 		 493 aa  470  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0154  methionyl-tRNA synthetase  39.6 
 
 		 636 aa  471  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1594  methionyl-tRNA synthetase  40.64 
 
 		 642 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.736389  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2115  methionyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 512 aa  466  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000589281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1171  methionyl-tRNA synthetase  38.58 
 
 		 663 aa  465  1e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0932376  normal  0.309916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0065  methionyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 		 518 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000885531  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0759  methionyl-tRNA synthetase  38.01 
 
 		 657 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.940267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0106  methionyl-tRNA synthetase  44.42 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000102629  hitchhiker  0.0000228434 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0315  methionyl-tRNA synthetase  39.52 
 
 		 648 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1420  methionyl-tRNA synthetase  37.67 
 
 		 670 aa  451  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2079  methionyl-tRNA synthetase  44.96 
 
 		 515 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.87065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0995  methionyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_29029  predicted protein  44.72 
 
 		 574 aa  441  9.999999999999999e-123  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0962  methionyl-tRNA synthetase  46.08 
 
 		 515 aa  441  9.999999999999999e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0933149  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1459  methionyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 		 500 aa  436  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2705  methionyl-tRNA synthetase  43.64 
 
 		 522 aa  436  1e-121  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0041  methionyl-tRNA synthetase  44.38 
 
 		 516 aa  434  1e-120  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.367271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0029  methionyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 512 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.743063  normal  0.0950714 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1255  methionyl-tRNA synthetase  39.69 
 
 		 651 aa  435  1e-120  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0972  methionyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 511 aa  425  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1462  methionyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 544 aa  425  1e-117  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1701  methionyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 519 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0498077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4327  methionyl-tRNA synthetase  45.51 
 
 		 550 aa  425  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2717  methionyl-tRNA synthetase  43.47 
 
 		 514 aa  423  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.894409 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1490  methionyl-tRNA synthetase  44.92 
 
 		 523 aa  424  1e-117  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4100  methionyl-tRNA synthetase  42.75 
 
 		 722 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.631035  normal  0.0384097 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1290  methionyl-tRNA synthetase  44.9 
 
 		 516 aa  422  1e-117  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.69251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0486  methionyl-tRNA synthetase  43.59 
 
 		 523 aa  421  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3116  methionyl-tRNA synthetase  42.63 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0588014  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2681  methionyl-tRNA synthetase  43.03 
 
 		 514 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.647042 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4187  methionyl-tRNA synthetase  42.72 
 
 		 522 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1514  methionyl-tRNA synthetase  43.46 
 
 		 525 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2533  methionyl-tRNA synthetase  44.05 
 
 		 519 aa  418  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308491  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>