177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0439 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0439  yggt family protein  100 
 
 		 103 aa  201  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000131375  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0679  protein of unknown function YGGT  62.89 
 
 		 98 aa  134  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345775  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1547  riboflavin synthase alpha subunit  62.89 
 
 		 97 aa  131  3e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.836777  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0106  yggt family protein  56.12 
 
 		 99 aa  118  3e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1379  yggt family protein  55.67 
 
 		 97 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  48.96 
 
 		 105 aa  96.7  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  44.79 
 
 		 99 aa  96.3  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1060  hypothetical protein  51.09 
 
 		 94 aa  95.1  3e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.040258  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1665  protein of unknown function YGGT  42.27 
 
 		 99 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.905288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  44.33 
 
 		 100 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0718  conserved hypothetical integral membrane protein, YGGT family  54.08 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.338437  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  45.16 
 
 		 105 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2172  hypothetical protein  47.87 
 
 		 100 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0505653  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  44.68 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  40.86 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1901  protein of unknown function YGGT  43.3 
 
 		 100 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.879042  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0860  YGGT family protein  56.67 
 
 		 93 aa  84  7e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.151332  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0931  YGGT family protein  55.56 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0261  protein of unknown function YGGT  41.67 
 
 		 99 aa  80.5  0.000000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  45.78 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0993  YGGT family protein  59.49 
 
 		 93 aa  77  0.00000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0346912  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0405  protein of unknown function YGGT  38.89 
 
 		 97 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.97811  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  41.89 
 
 		 93 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  39.53 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  36.78 
 
 		 89 aa  69.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1355  protein of unknown function YGGT  40.62 
 
 		 100 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  41.18 
 
 		 92 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  39.51 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  38.24 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  37.08 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0547  protein of unknown function YGGT  36.9 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  40.48 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  30.93 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3001  hypothetical protein  37.84 
 
 		 187 aa  58.2  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  29.89 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2724  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1492  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 		 109 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3096  protein of unknown function YGGT  39.56 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.669144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  31.91 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  32.61 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2973  protein of unknown function YGGT  39.13 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  30.85 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0534  protein of unknown function YGGT  34.72 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  31.03 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3056  protein of unknown function YGGT  32.18 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.502077  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  30.85 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  31.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 		 196 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1093  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.869762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1027  protein of unknown function YGGT  34.41 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3042  hypothetical protein  43.21 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.390306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 92 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  32.97 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0478  hypothetical protein  36.05 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  34.57 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  32.53 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000050243  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000491839  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000245532  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  40.91 
 
 		 182 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  0.0000219253 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  33.72 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  43.75 
 
 		 184 aa  51.6  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000426882  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  31.33 
 
 		 182 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  33.33 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  28.4 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0607  protein of unknown function YGGT  36.05 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3720  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 		 180 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  37.68 
 
 		 182 aa  50.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2870  protein of unknown function YGGT  45.21 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0388606 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1540  protein of unknown function YGGT  38.3 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.180759  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  37.8 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  34.38 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 		 182 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1534  YGGT family protein  31.11 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.460678  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1838  hypothetical protein  31.08 
 
 		 189 aa  49.3  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000231673  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  36.59 
 
 		 96 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4087  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4199  protein of unknown function YGGT  37.5 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.7106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0110  hypothetical protein  36.11 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0365579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4038  protein of unknown function YGGT  34.44 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.5468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03300  hypothetical protein  36.36 
 
 		 178 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4076  protein of unknown function YGGT  34.44 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3782  protein of unknown function YGGT  34.44 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.402098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0580  hypothetical protein  37.84 
 
 		 194 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.471121  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0327  yggt family protein  32.95 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1838  protein of unknown function YGGT  35.06 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  34.94 
 
 		 87 aa  47  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  35.9 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2158  hypothetical protein  30.12 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.101701  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  35.87 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3028  YGGT family membrane protein  30.12 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.952589  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3083  YGGT family membrane protein  30.12 
 
 		 213 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2028  YGGT family membrane protein  30.12 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.835593  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  36.36 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2655  protein of unknown function YGGT  37.78 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666885  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>