More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0329 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0329  translation initiation factor IF-3  100 
 
 		 172 aa  345  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000359846  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1818  translation initiation factor IF-3  90.3 
 
 		 165 aa  284  5e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.228131  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0029  translation initiation factor IF-3  81.29 
 
 		 173 aa  268  2e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1701  translation initiation factor IF-3  82.56 
 
 		 172 aa  268  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00889873  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0082  translation initiation factor IF-3  70.76 
 
 		 171 aa  267  5e-71  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0200  translation initiation factor IF-3  80.23 
 
 		 172 aa  264  5e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0239  translation initiation factor IF-3  80.23 
 
 		 172 aa  264  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0217  translation initiation factor IF-3  79.65 
 
 		 172 aa  262  2e-69  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0612  translation initiation factor IF-3  70.93 
 
 		 173 aa  225  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0067  translation initiation factor IF-3  63.37 
 
 		 172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000101132  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1225  translation initiation factor 3  50.61 
 
 		 164 aa  167  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000314962  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  50.31 
 
 		 197 aa  165  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000028162  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2660  translation initiation factor IF-3  49.09 
 
 		 190 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000648528  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0554  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000012216  unclonable  2.53125e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4706  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000432272  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4471  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4306  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000145665  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4317  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 195 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000117232  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4683  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000101645  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4819  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 186 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000690292  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4690  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.37112e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4699  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 166 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000260309  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0798  translation initiation factor IF-3  47.88 
 
 		 202 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4406  translation initiation factor IF-3  48.47 
 
 		 166 aa  162  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000111711  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  46.95 
 
 		 207 aa  160  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000188671  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3261  translation initiation factor IF-3  47.27 
 
 		 195 aa  159  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000125648  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 238 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1758  translation initiation factor 3  46.41 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000120038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  46.63 
 
 		 225 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1409  translation initiation factor IF-3  47.85 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  1.37178e-16  unclonable  1.3418400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  47.2 
 
 		 252 aa  157  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2996  translation initiation factor IF-3  48.78 
 
 		 173 aa  157  9e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  47.24 
 
 		 198 aa  154  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1311  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 164 aa  154  5.0000000000000005e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000644552  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  45.06 
 
 		 179 aa  153  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000129093  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 198 aa  152  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000135112  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  42.42 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000486529  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 187 aa  151  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111233  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3622  translation initiation factor IF-3  44.51 
 
 		 357 aa  150  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0913675  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2638  translation initiation factor IF-3  48.75 
 
 		 169 aa  150  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294805  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1516  translation initiation factor IF-3  46.34 
 
 		 172 aa  150  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.027432  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  48.45 
 
 		 192 aa  149  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0522  translation initiation factor IF-3  43.6 
 
 		 193 aa  149  3e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000692532  hitchhiker  0.000000579185 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1241  translation initiation factor 3  43.56 
 
 		 170 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000256408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0425  translation initiation factor IF-3  45.29 
 
 		 171 aa  148  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00000964088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0724  translation initiation factor IF-3  49.37 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000346718  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  45.16 
 
 		 165 aa  147  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000758155  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  44.44 
 
 		 174 aa  147  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1204  translation initiation factor IF-3  46.99 
 
 		 171 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000244125  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  46.91 
 
 		 175 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2666  translation initiation factor IF-3  42.01 
 
 		 176 aa  144  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0489  translation initiation factor IF-3  47.02 
 
 		 176 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0000720798  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  42.11 
 
 		 173 aa  144  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3182  translation initiation factor IF-3  44.05 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0466683  normal  0.175076 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  41.76 
 
 		 194 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  42.86 
 
 		 202 aa  142  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 173 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl188  translation initiation factor IF-3  45.56 
 
 		 180 aa  142  3e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  6.75747e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3052  translation initiation factor IF-3  45.4 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 194 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  41.42 
 
 		 173 aa  141  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  42.94 
 
 		 194 aa  141  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 183 aa  141  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  43.11 
 
 		 243 aa  141  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 177 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 183 aa  141  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 176 aa  140  6e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0713  translation initiation factor 3  42.86 
 
 		 249 aa  140  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.814826 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  41.52 
 
 		 173 aa  140  8e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1269  translation initiation factor 3  44.58 
 
 		 225 aa  140  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.628011  normal  0.508823 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0983  translation initiation factor IF-3  45.78 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  44.17 
 
 		 180 aa  139  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  44.79 
 
 		 178 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  43.21 
 
 		 173 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2307  translation initiation factor IF-3  45.33 
 
 		 154 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00282878  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2156  translation initiation factor IF-3  44.85 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000187486  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1419  translation initiation factor IF-3  44.83 
 
 		 146 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000288109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2229  translation initiation factor IF-3  48.77 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00231449 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0930  translation initiation factor 3  42.07 
 
 		 178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  44.1 
 
 		 178 aa  138  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3169  translation initiation factor IF-3  41.82 
 
 		 277 aa  139  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2038  translation initiation factor IF-3  41.72 
 
 		 177 aa  138  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.369536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  41.98 
 
 		 173 aa  139  3e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1249  translation initiation factor IF-3  42.07 
 
 		 174 aa  138  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.246001 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 173 aa  138  3e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  42.59 
 
 		 176 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  43.83 
 
 		 173 aa  138  3.9999999999999997e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  43.37 
 
 		 227 aa  138  3.9999999999999997e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1316  translation initiation factor IF-3  43.11 
 
 		 351 aa  138  3.9999999999999997e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0766  translation initiation factor IF-3  43.71 
 
 		 181 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  46.1 
 
 		 159 aa  137  6e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  43.48 
 
 		 173 aa  137  7.999999999999999e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1678  translation initiation factor IF-3  43.56 
 
 		 170 aa  137  8.999999999999999e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0127847  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1509  translation initiation factor IF-3  41.33 
 
 		 204 aa  137  8.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00441613  normal  0.913408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  44.51 
 
 		 222 aa  136  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  42.69 
 
 		 172 aa  137  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4675  translation initiation factor IF-3  41.1 
 
 		 177 aa  137  1e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.361003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>