More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0255 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0255  PP-loop family protein  100 
 
 
330 aa  676    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.765354  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0581  ATP/GTP hydrolase  56.19 
 
 
330 aa  365  1e-100  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1373  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  45.74 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0504  tRNA(Ile)-lysidine synthase  42.41 
 
 
331 aa  258  8e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1786  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  43.34 
 
 
321 aa  255  6e-67  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0257  tRNA(Ile)-lysidine synthase (tRNA(Ile)-lysidinesynthetase) (tRNA(Ile)-2-lysyl-cytidine synthase)  44.83 
 
 
318 aa  254  2.0000000000000002e-66  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1626  PP-loop family protein  42.72 
 
 
321 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0434  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  41.96 
 
 
331 aa  251  1e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1446  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  42.72 
 
 
321 aa  251  1e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1738  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.12 
 
 
329 aa  228  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0207  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.68 
 
 
423 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.716943  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  34.64 
 
 
431 aa  95.9  9e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1556  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.03 
 
 
306 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  33.71 
 
 
326 aa  95.1  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.2 
 
 
471 aa  94.7  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.05 
 
 
468 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460009  hitchhiker  0.0000000000638883 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
524 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_002620  TC0228  MesJ/Ycf62 family protein  30.91 
 
 
321 aa  92.8  6e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.131932  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  29.92 
 
 
471 aa  92.8  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.86 
 
 
444 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31 
 
 
445 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2319  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.52 
 
 
412 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.074868  normal  0.706957 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0666  cell cycle protein  33.52 
 
 
412 aa  91.3  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0014  hypothetical protein  33.67 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.709368  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.57 
 
 
472 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  29.73 
 
 
430 aa  91.7  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.86 
 
 
442 aa  91.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5387  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.44 
 
 
342 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.78 
 
 
459 aa  90.5  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000920326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.56 
 
 
480 aa  90.1  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.24 
 
 
414 aa  89.4  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  30.09 
 
 
332 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.4 
 
 
442 aa  87.8  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.55 
 
 
457 aa  87.8  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2678  cell cycle protein mesJ  29.9 
 
 
492 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0688879  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.9 
 
 
470 aa  88.6  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2593  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.9 
 
 
492 aa  87.8  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.32 
 
 
521 aa  87.8  2e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2542  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.93 
 
 
489 aa  88.2  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  28.57 
 
 
444 aa  87.8  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0689  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.91 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.544883  normal  0.119595 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1653  cell cycle protein mesJ  30.93 
 
 
489 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000820354  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3159  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.93 
 
 
489 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.765148  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2156  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.93 
 
 
489 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1429  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.93 
 
 
489 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.431978  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.67 
 
 
419 aa  87  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.43 
 
 
450 aa  87  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.2 
 
 
431 aa  86.7  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.37 
 
 
461 aa  86.7  5e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.72 
 
 
509 aa  86.3  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1114  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.77 
 
 
417 aa  85.9  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0822323  normal  0.384948 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.67 
 
 
455 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.25 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3507  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.61 
 
 
345 aa  85.1  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.381977  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0294  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.55 
 
 
433 aa  84  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.212762 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0825  hypothetical protein  29.27 
 
 
431 aa  84  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0977  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.66 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0402  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  29.55 
 
 
430 aa  83.6  0.000000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0260657  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.8 
 
 
470 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000164425  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.64 
 
 
469 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1944  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.87 
 
 
494 aa  83.2  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0959  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.85 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31371  predicted protein  23.26 
 
 
484 aa  82.8  0.000000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.66 
 
 
456 aa  82.8  0.000000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  29.73 
 
 
454 aa  82  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000839704 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0148  MesJ/Ycf62 family protein  30.94 
 
 
432 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0850  hypothetical protein  29.76 
 
 
431 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.2 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.52 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09873  putative cell-cycle protein  27.66 
 
 
436 aa  82  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2413  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.93 
 
 
450 aa  82.4  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.5 
 
 
473 aa  82  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3087  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.91 
 
 
325 aa  82.4  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30528  predicted protein  27.03 
 
 
714 aa  81.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000000519848  normal  0.264814 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0192  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.78 
 
 
432 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.07 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0918  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.05 
 
 
445 aa  80.9  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5309  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.55 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2110  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.51 
 
 
473 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1980  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.51 
 
 
468 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl673  lysidine synthetase  30.93 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2624  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.49 
 
 
442 aa  80.1  0.00000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4334  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.58 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.114566 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.56 
 
 
469 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0158  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.57 
 
 
457 aa  79.7  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0865096  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1834  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.39 
 
 
440 aa  79.7  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0199  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.21 
 
 
432 aa  79.3  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01389  cell cycle protein MesJ  26.87 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.683525  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.42 
 
 
434 aa  79.3  0.00000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00186  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.21 
 
 
432 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.445968  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00185  hypothetical protein  29.21 
 
 
432 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.434611  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0190  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.21 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.781391  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0181  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.21 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  27.96 
 
 
433 aa  79  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3472  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.21 
 
 
432 aa  79  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878016  normal  0.473347 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1352  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  30.37 
 
 
320 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.150129  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4841  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.94 
 
 
342 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0339142  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0275  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  30.54 
 
 
431 aa  78.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.538522 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.53 
 
 
485 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000793902  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3082  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.28 
 
 
368 aa  78.2  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>