129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0241 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0241  cytochrome c-553 (cytochrome c553) (low-potential cytochromec)  100 
 
 
100 aa  201  3e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  77 
 
 
100 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1416  cytochrome c553  53.33 
 
 
104 aa  102  2e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0474  cytochrome c family protein  52.48 
 
 
101 aa  101  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1418  cytochrome c553  53.33 
 
 
104 aa  99.8  1e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.785663  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1289  cytochrome c553  50.5 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1170  cytochrome c553  50.5 
 
 
100 aa  97.8  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0575  cytochrome c553  49.5 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.673779  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1235  cytochrome c553  46.67 
 
 
105 aa  81.6  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1817  cytochrome c class I  47.52 
 
 
98 aa  75.1  0.0000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1602  cytochrome c553  40.96 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.330816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2138  cytochrome c family protein  38.61 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.203882 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2244  cytochrome c class I  38.61 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2134  cytochrome c family protein  38.38 
 
 
103 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  38.96 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2603  cytochrome c family protein  38.03 
 
 
202 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.44743  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  40.26 
 
 
102 aa  55.5  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  33.98 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1570  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
102 aa  52  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0285899  normal  0.683196 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  32.93 
 
 
318 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0138  hypothetical protein  37.14 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0123  hypothetical protein  37.14 
 
 
200 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0539  cytochrome c class I  29.63 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113512 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3622  cytochrome c, class I  32.39 
 
 
206 aa  48.5  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00635609  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  34.29 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00575  cytochrome c553  31.43 
 
 
205 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2853  cytochrome c, class I  32.86 
 
 
205 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.530376  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2406  cytochrome c4  30 
 
 
223 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  31.43 
 
 
205 aa  47.4  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1516  cytochrome c553-like protein  33.33 
 
 
139 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.513352  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0552  cytochrome c, class I  33.8 
 
 
209 aa  47  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0787  cytochrome c family protein  34.41 
 
 
237 aa  47  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000887671  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0741  cytochrome c, class I  33.33 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.39 
 
 
224 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  31.03 
 
 
207 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  31.03 
 
 
207 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  31.03 
 
 
207 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0187  cytochrome c oxidase  33.8 
 
 
208 aa  45.8  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0207051  normal  0.526918 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3945  cytochrome c, class I  29.63 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.405176  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  32.86 
 
 
200 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3764  cytochrome c class I  36.62 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000231636  normal  0.0830615 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  31.19 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  30 
 
 
229 aa  45.1  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1343  cytochrome c, class I  35.23 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.022471  normal  0.750332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  28.95 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0628  cytochrome c, class I  28.12 
 
 
102 aa  44.7  0.0004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000335471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  38.64 
 
 
418 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0739  putative cytochrome c  30.99 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  34.25 
 
 
273 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0907  putative periplasmic cytochrome type-c oxidoreductase signal peptide protein  32.35 
 
 
121 aa  43.9  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.153679  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0229  cytochrome c  27.14 
 
 
205 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.779368  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1493  putative cytochrome c related protein  32.94 
 
 
262 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.164831  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6830  cytochrome c, class I  34.94 
 
 
292 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0812003  normal  0.612141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  30.99 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1354  cytochrome c family protein  32.94 
 
 
262 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1360  cytochrome c family protein  32.94 
 
 
262 aa  42.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.264003  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1947  cytochrome c, class I  22.64 
 
 
216 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.457627  normal  0.677602 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  31.73 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05467  cytochrome c  30.84 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  28.28 
 
 
206 aa  43.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5760  cytochrome c class I  32.47 
 
 
266 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0346  putative cytochrome c, class I  31.17 
 
 
269 aa  43.5  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3823  cytochrome c-type protein  23.15 
 
 
217 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.479711 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0878  putative cytochrome c-554  31.82 
 
 
105 aa  42.4  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0463799  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  27.59 
 
 
207 aa  42  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5418  cytochrome c, class I  32.84 
 
 
200 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  32 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  32 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35390  pyoverdine biosynthesis protein PvcD  32.86 
 
 
215 aa  42  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.15131  normal  0.0513213 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  32 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2095  putative cytochrome c  24.74 
 
 
284 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.737605  normal  0.709755 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  26.14 
 
 
218 aa  42.4  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1662  cytochrome c class I  39.13 
 
 
224 aa  42.4  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  32 
 
 
119 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3126  cytochrome c class I  31 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0549907 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  32.39 
 
 
221 aa  41.6  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2878  cytochrome c class I  31.94 
 
 
219 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6402  cytochrome c, class I  36.11 
 
 
218 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1333  cytochrome c family protein  30.67 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.00326957  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0967  cytochrome c family protein  31.08 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0861  cytochrome c, class I  37.97 
 
 
225 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  26.14 
 
 
218 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3555  cytochrome c, class I  31.94 
 
 
219 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.411936  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1018  cytochrome c553  30.67 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1946  cytochrome c, class I  31.65 
 
 
108 aa  41.6  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0592942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0847  cytochrome C4  30.67 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.233095  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1172  cytochrome c family protein  31.08 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1180  cytochrome c family protein  30.67 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0301  cytochrome c family protein  30.67 
 
 
122 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1429  cytochrome c552, putative  27.59 
 
 
213 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1146  cytochrome c family protein  27.59 
 
 
213 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0982  cytochrome c class I  27.84 
 
 
106 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0520697  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  32 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0538  cytochrome c class I  36.54 
 
 
102 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0164881 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  30.67 
 
 
119 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2873  cytochrome c family protein  31.76 
 
 
262 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  30.67 
 
 
119 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3192  cytochrome c class I  26.61 
 
 
216 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0040  cytochrome c class I  28.57 
 
 
207 aa  41.2  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>