More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0145 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2056  divalent cation transporter  69.67 
 
 
575 aa  803    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000288452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0145  cytochrome C biogenesis protein transmembrane region  100 
 
 
570 aa  1135    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0906  thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.62 
 
 
563 aa  484  1e-135  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.664459  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1087  thiol:disulfide interchange protein DsbD  44.6 
 
 
582 aa  474  1e-132  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000524195  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0980  thiol:disulfide interchange protein DsbD (protein-disulfide reductase) (disulfide reductase)  41.7 
 
 
574 aa  463  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1355  Thioredoxin domain protein  42.5 
 
 
577 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0706  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.75 
 
 
567 aa  432  1e-119  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.760098  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  40.99 
 
 
586 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0631  thiol:disulfide interchange protein DsbD  40.04 
 
 
567 aa  425  1e-118  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1067  thiol:disulfide interchange protein DsbD  39.68 
 
 
567 aa  423  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.477245  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  39.65 
 
 
731 aa  395  1e-108  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.59 
 
 
789 aa  391  1e-107  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  38.78 
 
 
613 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  38.9 
 
 
750 aa  389  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1055  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  39.69 
 
 
626 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000114598  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0898  protein-disulfide reductase  39.32 
 
 
589 aa  383  1e-105  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  38.73 
 
 
623 aa  378  1e-103  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.7 
 
 
624 aa  369  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0741  hypothetical protein  35.44 
 
 
586 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0722  hypothetical protein  35.33 
 
 
586 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2683  protein-disulfide reductase  39.21 
 
 
654 aa  369  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.98 
 
 
810 aa  363  4e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  36.84 
 
 
625 aa  352  1e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  35.14 
 
 
622 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  38.51 
 
 
745 aa  349  9e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.13 
 
 
616 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.13 
 
 
616 aa  348  1e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  36.79 
 
 
623 aa  346  5e-94  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1778  protein-disulfide reductase  34.86 
 
 
629 aa  340  4e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3506  protein-disulfide reductase  36.52 
 
 
642 aa  339  5.9999999999999996e-92  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.647422 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  38.58 
 
 
752 aa  338  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  35.27 
 
 
649 aa  338  1.9999999999999998e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  33.44 
 
 
626 aa  336  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4360  thiol:disulfide interchange protein  34.78 
 
 
603 aa  334  3e-90  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0322676  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0281  thiol:disulfide interchange protein  33.95 
 
 
630 aa  332  8e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  34.64 
 
 
632 aa  332  1e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 
610 aa  330  3e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  36.38 
 
 
604 aa  331  3e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.47 
 
 
613 aa  331  3e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.3 
 
 
613 aa  330  4e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.47 
 
 
613 aa  329  8e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0953  thiol:disulfide interchange protein precursor  35.31 
 
 
608 aa  329  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447642  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.28 
 
 
604 aa  327  3e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3666  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.57 
 
 
628 aa  327  5e-88  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.162085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.6 
 
 
619 aa  326  6e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.92 
 
 
589 aa  325  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.6 
 
 
619 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  33.56 
 
 
611 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  33.72 
 
 
611 aa  325  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  33.05 
 
 
615 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  33.05 
 
 
615 aa  323  5e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  34.86 
 
 
608 aa  322  8e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4158  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 
609 aa  323  8e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.18513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.6 
 
 
619 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  35.02 
 
 
639 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.78 
 
 
602 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  35.18 
 
 
605 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.6 
 
 
619 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  33.17 
 
 
618 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  34.08 
 
 
610 aa  321  3e-86  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  33.33 
 
 
614 aa  318  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  32.49 
 
 
617 aa  318  2e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  33.05 
 
 
615 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.05 
 
 
610 aa  317  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0416  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.2 
 
 
624 aa  315  1.9999999999999998e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.136243  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4015  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.11 
 
 
611 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000287322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.51 
 
 
628 aa  313  3.9999999999999997e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  31.95 
 
 
631 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.5 
 
 
624 aa  313  6.999999999999999e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  32.05 
 
 
627 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002212  cytochrome c-type biogenesis protein DsbD protein-disulfide reductase  34.7 
 
 
603 aa  309  1.0000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  33.74 
 
 
600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.64 
 
 
602 aa  306  6e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  31.96 
 
 
616 aa  306  7e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2274  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.86 
 
 
600 aa  306  7e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.82 
 
 
627 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  33.28 
 
 
623 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  31.66 
 
 
627 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.66 
 
 
627 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.66 
 
 
627 aa  302  1e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  31.66 
 
 
627 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  32.15 
 
 
627 aa  301  3e-80  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.48 
 
 
631 aa  300  3e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.57 
 
 
592 aa  299  9e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  31.49 
 
 
627 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0538  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.93 
 
 
607 aa  298  2e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.126162  decreased coverage  0.00471183 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.82 
 
 
605 aa  298  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  32.89 
 
 
654 aa  297  3e-79  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0503  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.85 
 
 
583 aa  297  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.51 
 
 
592 aa  297  4e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 
565 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 
565 aa  296  6e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.27 
 
 
565 aa  296  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.27 
 
 
565 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  33.27 
 
 
565 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  33.09 
 
 
565 aa  293  6e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1357  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  34.24 
 
 
612 aa  293  6e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.669889  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.09 
 
 
565 aa  293  6e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.45 
 
 
565 aa  293  7e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.36 
 
 
565 aa  292  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>