84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0093 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  100 
 
 
130 aa  270  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1794  4-diphosphocytidyl-2-C-methyl-D-erythritol kinase  68.99 
 
 
130 aa  189  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.139421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2293  thioesterase  33.59 
 
 
163 aa  92  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
135 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3390  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2002  hypothetical protein  30.23 
 
 
145 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
130 aa  66.2  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23630  hypothetical protein  29.46 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0065862 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2168  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  31.54 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33249  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1978  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.682995  normal  0.146868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1154  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 
158 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.576417  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
153 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2836  hypothetical protein  30.77 
 
 
164 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.701864  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1511  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
144 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0245282  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1046  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
158 aa  62.4  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.324914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1841  hypothetical protein  29.01 
 
 
130 aa  62.4  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.940249  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
136 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1543  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
144 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.95151  normal  0.104644 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1980  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  0.0434236 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3780  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.400891 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3245  thioesterase superfamily; K07107  27.91 
 
 
162 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1535  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
154 aa  60.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1929  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
136 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0366431  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  30.23 
 
 
140 aa  60.5  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2729  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.595703  normal  0.232765 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
156 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1290  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
156 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.185257  normal  0.979627 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2806  hypothetical protein  26.36 
 
 
164 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.188367 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4202  acyl-ACP thioesterase  26.77 
 
 
246 aa  53.5  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.67924  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4227  acyl-ACP thioesterase  26.77 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.285714  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4078  Acyl-ACP thioesterase  26.89 
 
 
246 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0343  acyl-ACP thioesterase  32.22 
 
 
255 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.603679 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  30.08 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0436  thioesterase-like  27.5 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.447447  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0710  thioesterase superfamily protein  26.92 
 
 
164 aa  49.3  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.406632  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1539  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  25.38 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  28.23 
 
 
158 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
136 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3168  acyl-ACP thioesterase  25 
 
 
247 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.96192e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  25.38 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3454  acyl-ACP thioesterase  25.96 
 
 
248 aa  46.6  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.604598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1428  acyl-ACP thioesterase  28.43 
 
 
318 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  25 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
145 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
139 aa  44.3  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03750  hypothetical protein  29.17 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  22.76 
 
 
139 aa  43.9  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  33.77 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  24 
 
 
177 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.77 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.77 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  25.95 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  24.8 
 
 
179 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.21 
 
 
134 aa  42.4  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  26.98 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.21 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.39 
 
 
133 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3301  thioesterase superfamily protein  23.53 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  23.97 
 
 
132 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  24 
 
 
147 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0268  acyl-ACP thioesterase  26.02 
 
 
231 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000883261  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.11 
 
 
143 aa  42  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  26.02 
 
 
184 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.39 
 
 
133 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
136 aa  41.6  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0082  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
136 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0077  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
136 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  23.77 
 
 
177 aa  41.2  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  24.03 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.33 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  32.43 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  26.36 
 
 
139 aa  40.4  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3775  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
134 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.752542  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  26.8 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  28.07 
 
 
159 aa  40  0.01  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
283 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>