44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0072 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0072  PDZ domain-containing protein  100 
 
 		 365 aa  750    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.031079  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1737  sigma 54 modulation protein/ribosomal protein S30EA  73.13 
 
 		 369 aa  556  1e-157  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00781988  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0067  PDZ domain-containing protein  39.42 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.618019  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0114  hypothetical protein  38.59 
 
 		 359 aa  233  3e-60  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000396595  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1815  PDZ domain-containing protein  37.46 
 
 		 364 aa  218  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1634  PDZ domain-containing protein  37.22 
 
 		 356 aa  214  2.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2003  PDZ domain-containing protein  37.22 
 
 		 356 aa  213  3.9999999999999995e-54  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1935  PDZ/DHR/GLGF domain protein  26.72 
 
 		 357 aa  113  5e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0336  PDZ/DHR/GLGF  25 
 
 		 326 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.699218  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  24.25 
 
 		 511 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  29.14 
 
 		 476 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1073  protease Do  24.79 
 
 		 527 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.952362 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0924  protease Do  23.66 
 
 		 527 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.010153  normal  0.0275633 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0901  protease Do  27.87 
 
 		 509 aa  50.8  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  26.72 
 
 		 516 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0871  protease Do  25.79 
 
 		 500 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  21.91 
 
 		 501 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  22.76 
 
 		 500 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  25.77 
 
 		 525 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1042  serine endoprotease  26.03 
 
 		 482 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.88791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2014  protease Do  19.84 
 
 		 502 aa  46.6  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  24.75 
 
 		 511 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  24.21 
 
 		 501 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1368  serine protease DO-like protease  22.46 
 
 		 491 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.200414  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3620  protease Do  20.89 
 
 		 495 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2805  serine endoprotease  24.79 
 
 		 476 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0606  protease Do  26.56 
 
 		 523 aa  45.4  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0210206 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.57 
 
 		 457 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  23.41 
 
 		 461 aa  44.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  26.44 
 
 		 389 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  50 
 
 		 485 aa  44.7  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  24.5 
 
 		 511 aa  44.3  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0610  serine protease  24.43 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0611  serine protease  24.43 
 
 		 513 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  23.53 
 
 		 498 aa  43.9  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  24.54 
 
 		 528 aa  43.5  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  22.71 
 
 		 514 aa  43.5  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  21.85 
 
 		 515 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  22.16 
 
 		 462 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  23.62 
 
 		 498 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  32.05 
 
 		 524 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  22.27 
 
 		 487 aa  43.1  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  27.61 
 
 		 476 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  26 
 
 		 511 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>