More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0058 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0058  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  100 
 
 		 161 aa  337  5.9999999999999996e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.631212  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1586  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  61.38 
 
 		 188 aa  221  3e-57  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1997  amino acid carrier protein AlsT  60 
 
 		 175 aa  211  2.9999999999999995e-54  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.473255  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1132  single-stranded DNA-binding protein  56.28 
 
 		 209 aa  190  8e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0242  single-stranded DNA-binding protein (SSB) (helix-destabilizingprotein)  71.31 
 
 		 206 aa  183  7e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.916441  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0952  single-stranded DNA-binding protein  55.87 
 
 		 175 aa  183  7e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1089  single-stranded DNA-binding protein  51.65 
 
 		 182 aa  183  9e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1214  single-stranded DNA-binding protein  51.65 
 
 		 182 aa  183  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.589073  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0652  single-stranded DNA-binding protein  50.82 
 
 		 183 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1661  single-stranded DNA-binding protein  51.69 
 
 		 172 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0862  single-strand binding protein  47.02 
 
 		 166 aa  140  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2626  single-strand binding protein  42.5 
 
 		 176 aa  106  1e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.377428  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2288  single-strand binding protein  40.12 
 
 		 159 aa  105  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0848  single-strand binding protein family  38.24 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000446358  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  38.46 
 
 		 149 aa  101  5e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 163 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 161 aa  99.8  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  35.06 
 
 		 177 aa  98.6  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 156 aa  97.8  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1690  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 137 aa  96.7  1e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  33.72 
 
 		 166 aa  95.9  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  44.55 
 
 		 150 aa  96.3  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  38.58 
 
 		 151 aa  95.5  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  36.26 
 
 		 168 aa  95.5  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  40.91 
 
 		 151 aa  94.7  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0020  single-strand binding protein  40.28 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  33.33 
 
 		 171 aa  92  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 147 aa  92  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 146 aa  91.7  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11550  single stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 147 aa  91.7  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0161241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 173 aa  91.7  4e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  36.3 
 
 		 238 aa  91.3  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  36.14 
 
 		 172 aa  91.3  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  35.37 
 
 		 165 aa  90.9  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  35.8 
 
 		 171 aa  90.9  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  41.35 
 
 		 183 aa  90.5  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1677  single-strand binding protein  33.53 
 
 		 168 aa  90.1  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000004529  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  32.1 
 
 		 161 aa  90.1  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2076  single-strand binding protein  39.72 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0331  single-strand binding protein  39.72 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0322  single-strand binding protein  39.72 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2039  single-strand binding protein  39.72 
 
 		 156 aa  89.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  36.8 
 
 		 160 aa  89.7  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  43.27 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6278  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 190 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  44.23 
 
 		 181 aa  89.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 183 aa  89  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  41.82 
 
 		 178 aa  89  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  33.94 
 
 		 158 aa  88.6  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5572  single-strand binding protein  38.1 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  36.92 
 
 		 231 aa  88.2  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6544  single-strand binding protein  32.37 
 
 		 188 aa  88.2  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  37.3 
 
 		 146 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  34.76 
 
 		 157 aa  87.8  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27910  single stranded DNA-binding protein  37.35 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000548397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  34.94 
 
 		 154 aa  87.8  6e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2929  single-strand binding protein  37.93 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.564764  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  32.39 
 
 		 178 aa  87.4  7e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4136  single-strand binding protein  33.94 
 
 		 165 aa  87  8e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00257705  normal  0.135122 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  42.31 
 
 		 154 aa  87.4  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 148 aa  87.4  8e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  44.76 
 
 		 178 aa  87  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  33.54 
 
 		 152 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3772  single-strand binding protein  34.29 
 
 		 167 aa  86.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  33.33 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  36.64 
 
 		 166 aa  86.7  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  40.95 
 
 		 181 aa  85.9  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 201 aa  85.9  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  39.42 
 
 		 155 aa  86.3  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  37.1 
 
 		 222 aa  86.3  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  40.95 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1969  single-stranded DNA-binding protein  39.17 
 
 		 188 aa  85.5  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.198905  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3093  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 199 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0781  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.391635  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0596  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 179 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  40.37 
 
 		 178 aa  85.5  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0611  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 184 aa  85.1  3e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1529  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0061  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 196 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2957  single-stranded DNA-binding protein  39.42 
 
 		 192 aa  85.5  3e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.602343  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  37.21 
 
 		 181 aa  85.1  4e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  34.32 
 
 		 182 aa  84.7  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0570  single-strand binding protein  36.11 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.802144  hitchhiker  0.00395946 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  34.27 
 
 		 236 aa  84.3  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0830  single-strand binding protein  41.9 
 
 		 141 aa  84.3  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0450  single-strand binding protein  37.04 
 
 		 152 aa  84.3  7e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000062046  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  38.46 
 
 		 200 aa  84  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 180 aa  84.3  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  41.35 
 
 		 175 aa  84  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4106  single-stranded DNA-binding protein  38.46 
 
 		 177 aa  84  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>