More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0047 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0047  cytosine-specific methyltransferase NlaX (M.NlaX)  100 
 
 
352 aa  730    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00306927  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1565  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  36.9 
 
 
328 aa  192  6e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0587  DNA-cytosine methyltransferase  36.11 
 
 
319 aa  164  3e-39  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.00791678  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00371  site-specific DNA methylase  32.85 
 
 
305 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1008  cytosine-specific methyltransferase NlaX  32.08 
 
 
350 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.02363e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0816  DNA-cytosine methyltransferase  31.67 
 
 
350 aa  157  2e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1526  DNA-cytosine methyltransferase  33.04 
 
 
311 aa  156  5.0000000000000005e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  7.5111e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0822  DNA-cytosine methyltransferase  32.65 
 
 
318 aa  152  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.091848  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1078  hypothetical protein  31.21 
 
 
320 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0652  DNA-cytosine methyltransferase  30.9 
 
 
329 aa  149  7e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000019493  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2549  DNA-cytosine methyltransferase  31.95 
 
 
338 aa  147  3e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.149278  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1968  DNA-cytosine methyltransferase  31.04 
 
 
324 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4919  DNA-cytosine methyltransferase  32.32 
 
 
416 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00440588 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4374  DNA-cytosine methyltransferase  31.82 
 
 
417 aa  135  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.423632  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2854  DNA-cytosine methyltransferase  31.32 
 
 
372 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0160  DNA-cytosine methyltransferase  29.19 
 
 
328 aa  129  8.000000000000001e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2695  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1869  prophage LambdaSa2, type II DNA modification methyltransferase, putative  33 
 
 
437 aa  126  5e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000208673  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0060  DNA-cytosine methyltransferase  31.14 
 
 
329 aa  126  6e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0356  site-specific DNA methylase  29.82 
 
 
323 aa  125  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0414  DNA-cytosine methyltransferase  28.57 
 
 
436 aa  125  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.596456  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2460  DNA-cytosine methyltransferase  31.18 
 
 
424 aa  122  9e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00000000266884  hitchhiker  0.00000000000186187 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2360  DNA-cytosine methyltransferase  30.26 
 
 
336 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00768264  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2371  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
419 aa  122  9.999999999999999e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0692329  hitchhiker  0.000000223127 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0145  hypothetical protein  30.11 
 
 
417 aa  121  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5354  modification methylase HaeIII  29.45 
 
 
313 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000130575  hitchhiker  4.94055e-16 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0832  DNA-cytosine methyltransferase  28.16 
 
 
383 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0932  DNA-cytosine methyltransferase  28.27 
 
 
350 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000150039 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0841  modification methylase HpaII (cytosine-specific methyltransferase HpaII)  28.87 
 
 
373 aa  119  6e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.59966e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0535  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  29.75 
 
 
357 aa  119  6e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000373164 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3057  DNA-cytosine methyltransferase  30.06 
 
 
406 aa  118  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1823  DNA-cytosine methyltransferase  29.06 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1297  C-5 cytosine-specific DNA methylase  40.49 
 
 
451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000219997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3307  DNA-cytosine methyltransferase  27.11 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.594869 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5352  DNA-cytosine methyltransferase  25.73 
 
 
444 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1143  DNA-cytosine methyltransferase  28.99 
 
 
426 aa  117  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2793  DNA-cytosine methyltransferase  26.82 
 
 
727 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20440  DNA-methyltransferase Dcm  27.4 
 
 
315 aa  117  3.9999999999999997e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.359782  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0082  DNA-cytosine methyltransferase  29.85 
 
 
423 aa  116  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2867  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
416 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000939229  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0102  DNA-cytosine methyltransferase  28.26 
 
 
438 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.557518  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf138  cytosine-specific methyltransferase, related to HhaI  30.61 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  decreased coverage  0.000711386  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4748  DNA cytosine methylase  31.32 
 
 
447 aa  114  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1722  DNA-cytosine methyltransferase  28.07 
 
 
335 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000269653  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5355  modification methylase HaeIII  27.81 
 
 
313 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000134666  hitchhiker  1.11891e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0298  DNA-cytosine methyltransferase  29.8 
 
 
415 aa  112  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0084  DNA-cytosine methyltransferase  29.55 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0083  DNA-cytosine methyltransferase  28.03 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.817279  n/a   
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3583  DNA-cytosine methyltransferase  29.41 
 
 
487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4337  cytosine-specific methyltransferase NlaX  25.94 
 
 
348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0259442  hitchhiker  0.000000011708 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3354  C-5 cytosine-specific DNA methylase  29.63 
 
 
418 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2140  DNA-cytosine methyltransferase  27.81 
 
 
428 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767539 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1633  DNA-cytosine methyltransferase  28.33 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00134402  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2193  DNA cytosine methylase  28.96 
 
 
472 aa  109  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000335113  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4605  DNA-cytosine methyltransferase family protein  24.93 
 
 
362 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000208195  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1688  DNA-cytosine methyltransferase  28.96 
 
 
472 aa  108  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.105701  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4747  DNA cytosine methylase  29.29 
 
 
474 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209155  normal  0.300797 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2738  DNA cytosine methylase  28.96 
 
 
472 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.358012 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0139  DNA-cytosine methyltransferase  29.25 
 
 
361 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00921515  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1682  DNA cytosine methylase  28.96 
 
 
472 aa  108  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0382129 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3387  DNA-cytosine methyltransferase  29.62 
 
 
417 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.28418  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0923  DNA cytosine methylase  28.96 
 
 
472 aa  108  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.579059  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1839  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase., Type II site-specific deoxyribonuclease  32.68 
 
 
657 aa  107  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.520497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0573  DNA cytosine methylase  27.72 
 
 
491 aa  106  6e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2155  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
476 aa  106  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0409475 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2208  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
476 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.736012 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1224  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
472 aa  106  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.27257  normal  0.639542 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2151  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
476 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.366802 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1249  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
476 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.608462  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1127  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
476 aa  105  9e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00778828  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2063  DNA cytosine methylase  28.69 
 
 
472 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00482699  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2320  DNA-cytosine methyltransferase  25.59 
 
 
334 aa  105  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2257  DNA-cytosine methyltransferase  27.43 
 
 
323 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120501 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0644  DNA-cytosine methyltransferase  26.29 
 
 
390 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000274432  normal  0.895055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3450  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
460 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2666  DNA-cytosine methyltransferase  32.35 
 
 
460 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.566614  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2551  DNA cytosine methylase  29.08 
 
 
471 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.491902 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0079  DNA-cytosine methyltransferase  27.32 
 
 
335 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0372  DNA-cytosine methyltransferase  27.79 
 
 
385 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.497071  normal  0.790678 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3472  DNA-cytosine methyltransferase  27.06 
 
 
370 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000168758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4810  DNA-cytosine methyltransferase  28.53 
 
 
379 aa  100  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1616  C-5 cytosine-specific DNA methylase family protein  28.61 
 
 
345 aa  100  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4296  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
456 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4356  DNA-cytosine methyltransferase  32.56 
 
 
456 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.593221  normal  0.193587 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0731  site-specific DNA methylase  33.73 
 
 
406 aa  99.8  7e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00265008  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1205  DNA-cytosine methyltransferase  26.53 
 
 
632 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.649135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2644  C-5 cytosine-specific DNA methylase  35.93 
 
 
362 aa  98.2  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0419  C-5 cytosine-specific DNA methylase  24.93 
 
 
405 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000336169  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1159  putative 5-methylcytosine methyltransferase  26.82 
 
 
381 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.105767  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0883  DNA-cytosine methyltransferase  35.12 
 
 
389 aa  96.7  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0272  DNA-cytosine methyltransferase  24.48 
 
 
308 aa  96.3  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.861301  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4252  DNA-cytosine methyltransferase  27.02 
 
 
318 aa  96.3  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0263417 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1245  DNA-cytosine methyltransferase  34.3 
 
 
438 aa  95.1  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1568  DNA-cytosine methyltransferase  27.48 
 
 
662 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0406485  hitchhiker  0.00122877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4984  DNA-cytosine methyltransferase  27.4 
 
 
361 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0271  DNA-cytosine methyltransferase  24.27 
 
 
310 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3758  cytosine-specific DNA methylase  26.13 
 
 
443 aa  93.6  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  unclonable  0.00145147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0727  DNA-cytosine methyltransferase  24.32 
 
 
372 aa  94  4e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00617337  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1050  DNA-cytosine methyltransferase  26.97 
 
 
361 aa  94  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00805794  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4525  DNA-cytosine methyltransferase  28.62 
 
 
337 aa  93.6  5e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>