18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0037 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0037  Ppx/GppA family phosphatase  100 
 
 
433 aa  894    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0324  putative terminase B protein  50.46 
 
 
430 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1131  putative terminase B protein  50.46 
 
 
430 aa  414  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.815847  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0577  terminase B protein, putative  50 
 
 
430 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0853  hypothetical protein  29.36 
 
 
499 aa  102  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0642356  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1746  putative phage terminase, large subunit  28 
 
 
499 aa  97.4  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628877  hitchhiker  0.00000000165176 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3756  PBSX family phage terminase large subunit  31.02 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.893937  normal  0.0951984 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1462  hypothetical protein  23.84 
 
 
421 aa  66.2  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0654  hypothetical protein  29.55 
 
 
472 aa  64.3  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.485589  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3879  hypothetical protein  26 
 
 
471 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591729  normal  0.0947318 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2856  hypothetical protein  24.85 
 
 
484 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0701856  normal  0.015637 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2590  hypothetical protein  22.89 
 
 
505 aa  58.5  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1309  hypothetical protein  21.84 
 
 
520 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0096  hypothetical protein  24.18 
 
 
505 aa  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1100  hypothetical protein  23.98 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0366334 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0896  hypothetical protein  23.6 
 
 
450 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0076  hypothetical protein  22.11 
 
 
418 aa  46.6  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1030  hypothetical protein  29.17 
 
 
402 aa  44.7  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0399083 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>