42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0019 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0019  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  100 
 
 
50 aa  102  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00405758  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0023  hypothetical protein  71.43 
 
 
53 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0051  hypothetical protein  66 
 
 
54 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4059  hypothetical protein  68.42 
 
 
54 aa  66.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0861  hypothetical protein  57.14 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2107  hypothetical protein  58.7 
 
 
58 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45526  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1783  hypothetical protein  58.7 
 
 
58 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0846066  normal  0.790948 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0426  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  65 
 
 
893 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2207  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.14 
 
 
636 aa  64.3  0.0000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2768  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase  71.43 
 
 
608 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.722905  hitchhiker  0.0000187982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3366  hypothetical protein  66.67 
 
 
48 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.278826  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02295  hypothetical protein  63.41 
 
 
58 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.38417 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0305  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  58.14 
 
 
629 aa  62.8  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.113243 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3581  hypothetical protein  63.41 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.972578  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4658  hypothetical protein  63.41 
 
 
58 aa  62  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5138  hypothetical protein  60.47 
 
 
63 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.26264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39700  hypothetical protein  64.1 
 
 
48 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2988  hypothetical protein  63.04 
 
 
60 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.397696  normal  0.373274 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1693  hypothetical protein  58.7 
 
 
63 aa  59.7  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0301562  normal  0.601822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0086  hypothetical protein  54.55 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0105  hypothetical protein  54.55 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3516  hypothetical protein  55.32 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.196587 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0369  hypothetical protein  57.78 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0628  hypothetical protein  58.54 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497536  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1699  hypothetical protein  58.54 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2686  hypothetical protein  58.54 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2384  hypothetical protein  58.54 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2903  hypothetical protein  58.54 
 
 
70 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.314108  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2743  hypothetical protein  58.54 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.527298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0455  hypothetical protein  55.32 
 
 
61 aa  57.8  0.00000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0030661  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2808  hypothetical protein  58.54 
 
 
899 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1780  hypothetical protein  58.97 
 
 
58 aa  56.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.219233  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1275  hypothetical protein  55.81 
 
 
58 aa  55.5  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2341  hypothetical protein  56.41 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2719  hypothetical protein  56.41 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2641  hypothetical protein  50 
 
 
63 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3480  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  63.64 
 
 
627 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.308899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1473  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.17 
 
 
704 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.935092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3397  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  45.16 
 
 
686 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1191  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  35.71 
 
 
730 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.112053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0421  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  55.17 
 
 
689 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2273  anaerobic ribonucleoside triphosphate reductase  43.24 
 
 
718 aa  40.4  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.414975  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>