30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0018 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0018  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0542374  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1584  hypothetical protein  41.99 
 
 
185 aa  154  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.232051  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0276  hypothetical protein  43.24 
 
 
195 aa  141  6e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1963  hypothetical protein  33.33 
 
 
168 aa  87  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2985  hypothetical protein  36.61 
 
 
171 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.704918  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2437  protein of unknown function DUF847  28.44 
 
 
213 aa  58.5  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0826  hypothetical protein  34.58 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000568663  normal  0.254553 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1604  hypothetical protein  34.58 
 
 
269 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000491659  normal  0.639423 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1650  hypothetical protein  34.58 
 
 
269 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0578979  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1652  hypothetical protein  28.85 
 
 
158 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5041  protein of unknown function DUF847  26.67 
 
 
214 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5744  protein of unknown function DUF847  27.27 
 
 
214 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0617  protein of unknown function DUF847  27.27 
 
 
214 aa  54.7  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3888  protein of unknown function DUF847  32.86 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2014  protein of unknown function DUF847  30.43 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2597  protein of unknown function DUF847  30.43 
 
 
213 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4298  protein of unknown function DUF847  31.43 
 
 
213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2370  hypothetical protein  28.7 
 
 
252 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.672652  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0856  hypothetical protein  25.68 
 
 
253 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0848  hypothetical protein  25.68 
 
 
253 aa  46.6  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0771  hypothetical protein  25.71 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0726932  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0666  hypothetical protein  25.71 
 
 
182 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00221115  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2867  protein of unknown function DUF847  26.94 
 
 
192 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0570  hypothetical protein  24.76 
 
 
205 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4087  hypothetical protein  26.5 
 
 
209 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.114514  normal  0.565066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6576  protein of unknown function DUF847  25 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0293  secretion activator protein, putative  27.94 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.308779 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7310  protein of unknown function DUF847  33.33 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3175  hypothetical protein  26.53 
 
 
290 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0236568 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0035  hypothetical protein  28.95 
 
 
137 aa  43.5  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>