More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2324 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2324  ribosomal protein L22  100 
 
 
85 aa  171  2.9999999999999996e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000160012  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1028  50S ribosomal protein L22  96.47 
 
 
110 aa  167  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000806813  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0039  50S ribosomal protein L22  89.41 
 
 
110 aa  158  2e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00472535  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0089  50S ribosomal protein L22  84.34 
 
 
109 aa  149  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0769345  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0064  50S ribosomal protein L22  85.19 
 
 
124 aa  147  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000282721  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1699  50S ribosomal protein L22  80.72 
 
 
147 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000199803  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1870  50S ribosomal protein L22  79.52 
 
 
141 aa  140  4e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2076  50S ribosomal protein L22  78.31 
 
 
141 aa  138  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000614651  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1963  ribosomal protein L22  75 
 
 
110 aa  132  9.999999999999999e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0617879  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0291  50S ribosomal protein L22  71.43 
 
 
105 aa  116  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00371339  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3019  50S ribosomal protein L22  43.9 
 
 
113 aa  76.6  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0177222  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0713  50S ribosomal protein L22  49.33 
 
 
114 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.41885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6609  ribosomal protein L22  47.19 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2852  50S ribosomal protein L22  52.7 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.314759  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0631  50S ribosomal protein L22  54.05 
 
 
110 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000316767  hitchhiker  0.0000000013248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1297  50S ribosomal protein L22  49.35 
 
 
119 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00515674  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3990  ribosomal protein L22  46.75 
 
 
111 aa  72.4  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0600  50S ribosomal protein L22  44.05 
 
 
120 aa  72.4  0.000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000168861  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4920  ribosomal protein L22  46.43 
 
 
113 aa  71.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0979364  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0311  50S ribosomal protein L22P  40.7 
 
 
281 aa  71.6  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0022086 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0685  50S ribosomal protein L22  49.35 
 
 
111 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.735331  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2564  50S ribosomal protein L22  47.37 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3323  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000376786 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0938  50S ribosomal protein L22  50 
 
 
111 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000140309  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17351  50S ribosomal protein L22  47.37 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3007  50S ribosomal protein L22P  46.75 
 
 
119 aa  70.9  0.000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.148134  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0063  50S ribosomal protein L22  45.12 
 
 
114 aa  70.1  0.00000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.279384  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2227  50S ribosomal protein L22  44.16 
 
 
117 aa  69.7  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.793555  normal  0.494658 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1902  50S ribosomal protein L22  43.9 
 
 
114 aa  69.7  0.00000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.40685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4000  ribosomal protein L22  45 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.248751  normal  0.644151 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0706  50S ribosomal protein L22  47.3 
 
 
110 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000543227  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3430  ribosomal protein L22  43.68 
 
 
136 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1351  50S ribosomal protein L22  49.35 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.622659  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1128  ribosomal protein L22  45.83 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0482  ribosomal protein L22  40 
 
 
117 aa  68.6  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17441  50S ribosomal protein L22  42.35 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2682  50S ribosomal protein L22  37.23 
 
 
121 aa  67.8  0.00000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0632  ribosomal protein L22  43.18 
 
 
122 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3708  50S ribosomal protein L22  44.16 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0371  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.300281  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1280  ribosomal protein L22  44.16 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17601  50S ribosomal protein L22  43.42 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2397  50S ribosomal protein L22  42.5 
 
 
115 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0178523  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20820  LSU ribosomal protein L22P  40.86 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.594698  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1072  50S ribosomal protein L22  48.78 
 
 
111 aa  67  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000186157  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3753  ribosomal protein L22  46.51 
 
 
136 aa  66.6  0.00000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.453861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0199  LSU ribosomal protein L22P  46.59 
 
 
113 aa  67  0.00000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.019088  normal  0.0505621 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29690  LSU ribosomal protein L22P  43.02 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.505918 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0247  50S ribosomal protein L22  44.58 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0244  50S ribosomal protein L22  44.58 
 
 
120 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0201  50S ribosomal protein L22  42.68 
 
 
118 aa  66.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0571206  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2970  50S ribosomal protein L22  37.63 
 
 
121 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.36983  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3138  50S ribosomal protein L22  40.45 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1124  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1960  50S ribosomal protein L22  42.86 
 
 
121 aa  65.9  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1645  50S ribosomal protein L22  42.11 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19981  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.508737  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0284  50S ribosomal protein L22P  47.37 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000221006  hitchhiker  0.00000160224 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3900  50S ribosomal protein L22  43.42 
 
 
146 aa  65.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1190  50S ribosomal protein L22  44.3 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0681571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0328  ribosomal protein L22  41.03 
 
 
110 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000246157  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0958  50S ribosomal protein L22  39.77 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00139982  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0427  50S ribosomal protein L22  43.68 
 
 
114 aa  64.3  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.005659  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04030  LSU ribosomal protein L22P  42.86 
 
 
142 aa  64.3  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.951007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0852  50S ribosomal protein L22P  43.21 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000720413  hitchhiker  0.0000829756 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0220  50S ribosomal protein L22  44.71 
 
 
113 aa  64.3  0.0000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000894126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2150  50S ribosomal protein L22P  41.25 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.174844  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2060  ribosomal protein L22  40.96 
 
 
110 aa  63.9  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000300396  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0693  50S ribosomal protein L22  41.86 
 
 
126 aa  63.9  0.0000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.411882 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2173  ribosomal protein L22  44.16 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.799495  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1180  50S ribosomal protein L22  40.96 
 
 
113 aa  62.8  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.78172  normal  0.528873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0116  50S ribosomal protein L22  45.78 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000205775  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1560  ribosomal protein L22  44.59 
 
 
110 aa  62.8  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.671944  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4021  50S ribosomal protein L22  42.17 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.552506  hitchhiker  0.00000514416 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0230  50S ribosomal protein L22  48.05 
 
 
113 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl128  50S ribosomal protein L22  44.16 
 
 
112 aa  62.8  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16731  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0112  50S ribosomal protein L22  45.78 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1091  50S ribosomal protein L22  42.68 
 
 
117 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0865205 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0592  ribosomal protein L22  38.64 
 
 
122 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.085598  normal  0.812874 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23071  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1156  ribosomal protein L22  45.57 
 
 
120 aa  62.4  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000440865  hitchhiker  0.000000562165 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4502  ribosomal protein L22  41.03 
 
 
158 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2319  ribosomal protein L22  39.53 
 
 
115 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000611506  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4310  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
152 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.620955  normal  0.0104158 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0296  50S ribosomal protein L22  44.87 
 
 
117 aa  62  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.09394e-28 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0691  50S ribosomal protein L22  42.31 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3918  50S ribosomal protein L22  41.56 
 
 
152 aa  61.6  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1916  50S ribosomal protein L22  45.45 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.58558 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0084  50S ribosomal protein L22  43.42 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100288 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0463  50S ribosomal protein L22  41.46 
 
 
111 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0665  50S ribosomal protein L22  41.77 
 
 
112 aa  61.2  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000646537  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0474  50S ribosomal protein L22  37.8 
 
 
110 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000332367  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1519  ribosomal protein L22  44.74 
 
 
116 aa  61.2  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.417666  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0291  ribosomal protein L22  43.37 
 
 
113 aa  60.8  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00562751  normal  0.0409902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3519  ribosomal protein L22  40.51 
 
 
111 aa  60.8  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000743779  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0868  ribosomal protein L22  39.02 
 
 
110 aa  60.8  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2654  ribosomal protein L22  40.23 
 
 
122 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2455  50S ribosomal protein L22P  42.5 
 
 
112 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.082512 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>