More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2259 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2219  tRNA-Asp  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2259  tRNA-Asp  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.169626  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2178  tRNA-Asp  98.73 
 
 
79 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2182  tRNA-Asp  98.72 
 
 
79 bp  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1160  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0165656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.602947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asp-2  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.520938  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1738  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000457664  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1156  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00893597  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1734  tRNA-Asp  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000527786  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0013  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.212749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0050  tRNA-Asp  94.67 
 
 
77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0232692  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0916  tRNA-Asp  96.92 
 
 
79 bp  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.125153  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0014  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.469751  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0021  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000252162  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0026  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000221306  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0039  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000226797  normal  0.246953 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0059  tRNA-Asp  96.92 
 
 
77 bp  113  6e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.938712  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0096  tRNA-Asp  98.36 
 
 
77 bp  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.434013  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0022  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000352228  hitchhiker  0.00000353756 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0029  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0847414 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0027  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000248152  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0041  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000325058  normal  0.507644 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0094  tRNA-Asp  98.36 
 
 
74 bp  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0021  tRNA-Asp  96.92 
 
 
77 bp  113  6e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000370726  hitchhiker  0.000000254524 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0093  tRNA-Asp  98.36 
 
 
77 bp  113  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0027  tRNA-Asp  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00239727  normal  0.0594729 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0054  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566349  normal  0.354373 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0054  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000552526  normal  0.231331 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0028  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00318123  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0037  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000102957  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0096  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000000496509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0054  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000000338252  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0052  tRNA-Asp  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241383  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2040  tRNA-Asp  92.31 
 
 
79 bp  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1860  tRNA-Asp  92.31 
 
 
79 bp  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.000224596  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2041  tRNA-Asp  92.31 
 
 
79 bp  107  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0037  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0055  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.297696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0037  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451566  normal  0.215433 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0056  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.299906 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0021  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0103753 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t46  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t47  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t49  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0054  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.300765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA27  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237638  normal  0.165942 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA29  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000082024  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA30  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000254834  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0019  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0178689 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0038  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.352364  normal  0.157284 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0060  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0314851 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0059  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0311409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R26  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000223241  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R28  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771602  normal  0.0209843 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R37  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835448  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R38  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.809466  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0062  tRNA-Asp  94.2 
 
 
74 bp  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000000866023  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0027  tRNA-Asp  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.00000000032409  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0028  tRNA-Asp  95.38 
 
 
77 bp  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000808447  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0036  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.227491  normal  0.213335 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0039  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0067  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.168888  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0021  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000452524  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0066  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111209  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0068  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242521  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0083  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14401  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0085  tRNA-Asp  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.150257  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0067  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000256523  hitchhiker  0.000000993702 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Asp-1  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00209721  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0114  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0100  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000567752  hitchhiker  0.00319693 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0129  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0108  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00436109  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t102  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0078  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000246729  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0101  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000000609189  hitchhiker  0.00329166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0050  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0018  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00473987  normal  0.433792 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0007  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0016  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0392662 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0041  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000000109501  normal  0.0527209 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0018  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0114  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0124  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0018  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0008  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0004  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.372238  hitchhiker  0.00144913 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0019  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000445716 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0103  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118993  normal  0.0723976 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0104  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103964  normal  0.0748014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0004  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.253522  hitchhiker  0.00233636 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0103  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000505774  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0104  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000485826  normal  0.231295 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0138  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0082  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000638289  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0083  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116842  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0130  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.511088  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0049  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.256681  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0052  tRNA-Asp  92 
 
 
77 bp  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000000247942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>