164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2072 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2072  putative chemotaxis protein MotB  100 
 
 
363 aa  701    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.291136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0111  putative chemotaxis protein MotB  81.27 
 
 
366 aa  563  1.0000000000000001e-159  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.876361  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1218  putative chemotaxis protein MotB  52.96 
 
 
337 aa  352  7e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0517  chemotaxis protein MotB, putative  49.33 
 
 
334 aa  291  1e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1217  OmpA/MotB domain protein  42.39 
 
 
385 aa  272  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000964512  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0627  chemotaxis protein MotB, putative  43.43 
 
 
317 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0702  chemotaxis protein MotB, putative  43.43 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.66676  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1070  chemotaxis protein MotB, putative  43.43 
 
 
317 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.98925  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0911  chemotaxis protein MotB, putative  42.61 
 
 
316 aa  238  1e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0745423  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3412  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like protein  34.13 
 
 
220 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3877  OmpA/MotB domain protein  32.52 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0846  OmpA/MotB domain-containing protein  25.97 
 
 
340 aa  70.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.222157  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1203  hypothetical protein  25.07 
 
 
343 aa  68.6  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1714  hypothetical protein  24.8 
 
 
343 aa  67.8  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.763791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0800  hypothetical protein  27.5 
 
 
341 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.625307 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0991  hypothetical protein  27.27 
 
 
341 aa  67  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0284  hypothetical protein  32.73 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6939  hypothetical protein  27.25 
 
 
342 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.524655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 
209 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  36.09 
 
 
209 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4338  hypothetical protein  26.63 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.268779  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4587  hypothetical protein  30.82 
 
 
234 aa  60.1  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0322  OmpA/MotB domain-containing protein  25.49 
 
 
348 aa  60.1  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  31.69 
 
 
212 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2663  hypothetical protein  24.17 
 
 
342 aa  59.7  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.327919  normal  0.91255 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0954  hypothetical protein  38.37 
 
 
243 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.636597  unclonable  0.0000321673 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3542  hypothetical protein  26.17 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1656  hypothetical protein  24.16 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  33.83 
 
 
209 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3670  hypothetical protein  24.86 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3188  hypothetical protein  24.38 
 
 
343 aa  57.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2768  OmpA/MotB  32.39 
 
 
294 aa  56.6  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.961309  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4617  hypothetical protein  31.25 
 
 
247 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000179085 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0831  OmpA/MotB domain-containing protein  29.37 
 
 
314 aa  55.5  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.322779  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1500  OmpA/MotB domain protein  28.22 
 
 
253 aa  55.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0272  OmpA/MotB domain-containing protein  37.89 
 
 
224 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01765  putative flagellar motor protein MotB  26.4 
 
 
321 aa  55.5  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0452  hypothetical protein  31.34 
 
 
229 aa  55.1  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0241337  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2584  OmpA/MotB domain-containing protein  26.05 
 
 
329 aa  54.7  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0007  hypothetical protein  28.99 
 
 
248 aa  54.3  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.231859  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2744  hypothetical protein  24.86 
 
 
342 aa  53.9  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0900497 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4488  hypothetical protein  25.68 
 
 
341 aa  52.8  0.000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.264247  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2316  OmpA/MotB domain protein  29.21 
 
 
337 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.313851  normal  0.0895977 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2940  hypothetical protein  29.81 
 
 
648 aa  52.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0783557 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2160  OmpA/MotB domain protein  24.32 
 
 
337 aa  51.2  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3551  hypothetical protein  23.4 
 
 
343 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2637  OmpA/MotB domain protein  28.57 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.187978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0232  hypothetical protein  32.65 
 
 
230 aa  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2360  OmpA/MotB domain-containing protein  28.57 
 
 
337 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.45206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2170  OmpA/MotB domain-containing protein  37.4 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.161948  normal  0.187481 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0762  OmpA/MotB domain protein  34.26 
 
 
236 aa  50.4  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420349  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  34.85 
 
 
543 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0231  hypothetical protein  31.97 
 
 
230 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.317475  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1204  OmpA family protein  31.97 
 
 
220 aa  48.9  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1506  ompA family protein  29.09 
 
 
260 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  37.19 
 
 
443 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3143  OmpA/MotB  31.4 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356953  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5224  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0179146  normal  0.128612 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  31.97 
 
 
243 aa  49.3  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  30.82 
 
 
217 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5047  OmpA/MotB domain-containing protein  31.4 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0302882  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1316  OmpA/MotB  29.09 
 
 
260 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2042  OmpA/MotB  34.94 
 
 
286 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0440  OmpA/MotB family outer membrane protein  31.4 
 
 
220 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.485101  normal  0.40853 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  32.03 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
206 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5365  OmpA/MotB domain-containing protein  29.14 
 
 
337 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00131166 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.75 
 
 
220 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.92305  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3968  putative outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.508971  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  30.66 
 
 
217 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  34.78 
 
 
641 aa  47.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3840  putative outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3924  putative outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.835288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3859  putative outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4028  putative outer membrane lipoprotein  32.79 
 
 
220 aa  48.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0388504  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2560  OmpA/MotB domain protein  30.15 
 
 
355 aa  47.8  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.293745  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3344  OmpA/MotB domain-containing protein  23.01 
 
 
345 aa  47.4  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.773573  normal  0.13321 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  30.66 
 
 
217 aa  47.4  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  34.51 
 
 
381 aa  47.4  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  30.77 
 
 
226 aa  47.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0553  OmpA/MotB domain-containing protein  30.95 
 
 
224 aa  47.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  33.56 
 
 
542 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1008  hypothetical protein  28.45 
 
 
239 aa  47  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  31.25 
 
 
206 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3254  hypothetical protein  22.54 
 
 
343 aa  46.6  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308178  normal  0.172632 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  31.08 
 
 
263 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0325  OmpA/MotB domain protein  29.5 
 
 
280 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3238  OmpA/MotB domain protein  30.16 
 
 
228 aa  46.6  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0999  OmpA/MotB domain-containing protein  28.12 
 
 
255 aa  46.6  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4541  OmpA/MotB domain protein  25.87 
 
 
337 aa  46.6  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0506849  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1667  OmpA/MotB  35.06 
 
 
219 aa  46.2  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0160  OmpA/MotB domain protein  31.97 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3974  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0328  OmpA/MotB domain-containing protein  30.99 
 
 
224 aa  45.8  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3873  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4266  hypothetical protein  32.52 
 
 
235 aa  45.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3753  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4047  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  31.76 
 
 
262 aa  45.8  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0164  putative outer membrane lipoprotein  31.97 
 
 
219 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>