14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2060 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  100 
 
 		 420 aa  838    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  61.85 
 
 		 405 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  46.19 
 
 		 414 aa  311  1e-83  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  43.62 
 
 		 402 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  41.55 
 
 		 406 aa  276  5e-73  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  42.69 
 
 		 406 aa  270  2.9999999999999997e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  35.29 
 
 		 421 aa  191  2e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  32.23 
 
 		 431 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  32.01 
 
 		 424 aa  132  9e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  30.04 
 
 		 440 aa  126  6e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  30.6 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  30.6 
 
 		 425 aa  125  2e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  25.05 
 
 		 432 aa  53.9  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0019  outer membrane porin  27.25 
 
 		 402 aa  46.6  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00360128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>