More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2047 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2047  DNA polymerase III epsilon subunit  100 
 
 
200 aa  415  9.999999999999999e-116  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0204926  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0124  thioredoxin reductase (trxr) (general stress protein 35)(Gsp35)  64.5 
 
 
200 aa  281  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1076  metallo-beta-lactamase family protein  54.31 
 
 
196 aa  236  2e-61  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.253465  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0899  conserved hypothetical protein, putative hydrolase (metallo-beta-lactamase family)  49.24 
 
 
199 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.585968  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0850  Beta-lactamase-like  50 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1347  beta-lactamase domain protein  47.72 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1201  metallo-beta-lactamase family protein  49.24 
 
 
198 aa  187  8e-47  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0830  metallo-beta-lactamase family protein  48.22 
 
 
198 aa  184  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0389556  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0900  metallo-beta-lactamase family protein  47.24 
 
 
198 aa  182  3e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1026  metallo-beta-lactamase family protein  41.12 
 
 
215 aa  180  1e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  35.82 
 
 
211 aa  122  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1470  beta-lactamase domain-containing protein  38.5 
 
 
210 aa  121  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122516  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  38.81 
 
 
212 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2191  metallo-beta-lactamase family protein  37.95 
 
 
206 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1902  metallo-beta-lactamase family protein  37.44 
 
 
206 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  36.22 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1949  beta-lactamase domain protein  38.3 
 
 
198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.857141  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  35.2 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2055  beta-lactamase domain-containing protein  34.68 
 
 
229 aa  108  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  32 
 
 
204 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  34.02 
 
 
207 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 
206 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3091  hydrolase  29.91 
 
 
225 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.513985  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.99 
 
 
209 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  34.87 
 
 
205 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  33.67 
 
 
213 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  34.17 
 
 
208 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6103  beta-lactamase-like protein  33.17 
 
 
231 aa  102  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2120  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 
231 aa  102  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316298  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1110  metallo-beta-lactamase family protein  33.99 
 
 
207 aa  102  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
216 aa  101  6e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1700  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
234 aa  101  6e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.153973  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2261  beta-lactamase-like protein  28.08 
 
 
219 aa  101  8e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0317  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
214 aa  101  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.605621  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2853  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
210 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
214 aa  100  2e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2989  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
209 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.86043  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  31.19 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  31.31 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0673  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
206 aa  99.4  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.20621  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2364  beta-lactamase domain protein  30.52 
 
 
231 aa  99.4  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  34.8 
 
 
209 aa  99  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  29.74 
 
 
208 aa  99  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  29.56 
 
 
213 aa  98.6  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  32.18 
 
 
211 aa  98.2  7e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  34.34 
 
 
215 aa  98.2  7e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1077  beta-lactamase domain protein  35 
 
 
226 aa  97.8  9e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  34.57 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2508  beta-lactamase domain protein  33.51 
 
 
214 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523411 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4341  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  97.1  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4163  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00575624  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2375  beta-lactamase domain protein  31.98 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2576  beta-lactamase domain-containing protein  32.99 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.835238  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4485  metallo-beta-lactamase family protein  32.67 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2799  beta-lactamase domain protein  32.99 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130329  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1637  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.084203  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  32.04 
 
 
208 aa  96.7  2e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1603  beta-lactamase domain-containing protein  32.02 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0599073  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0369  beta-lactamase domain-containing protein  35.68 
 
 
201 aa  96.3  2e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4394  metallo-beta-lactamase family protein  33 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1713  metallo-beta-lactamase family protein  32.99 
 
 
212 aa  95.9  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2396  beta-lactamase domain-containing protein  31.48 
 
 
237 aa  95.9  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.668368  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2310  beta-lactamase domain protein  32.74 
 
 
246 aa  95.5  4e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.1865  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0068  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.99 
 
 
212 aa  95.5  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0554126  normal  0.354369 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1949  beta-lactamase domain protein  31.46 
 
 
245 aa  95.5  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  95.9  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3045  beta-lactamase domain protein  30.39 
 
 
238 aa  95.9  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0136984  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3413  beta-lactamase domain protein  30.48 
 
 
209 aa  95.9  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  30.69 
 
 
214 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  32.68 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1608  beta-lactamase domain-containing protein  30.43 
 
 
206 aa  95.5  5e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.130416  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  32.68 
 
 
215 aa  95.5  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  32.68 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  32.68 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  32.68 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  31.71 
 
 
215 aa  95.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1422  beta-lactamase-like protein  33.5 
 
 
221 aa  95.1  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0199  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
214 aa  95.1  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.604325  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0213  beta-lactamase domain-containing protein  32.84 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.325973 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0451  beta-lactamase domain protein  34.2 
 
 
213 aa  94.7  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 
209 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  34.48 
 
 
209 aa  94.4  9e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2087  hydrolase  28.99 
 
 
224 aa  94.7  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1728  beta-lactamase domain-containing protein  32.47 
 
 
215 aa  94.7  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  30.57 
 
 
215 aa  94  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1112  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.68 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.347617  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1030  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.68 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  hitchhiker  0.00661846 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0635  beta-lactamase domain-containing protein  32.09 
 
 
204 aa  94.4  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.320984  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0859  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1095  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.68 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1062  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.68 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136718 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1003  hydroxyacylglutathione hydrolase  32.68 
 
 
215 aa  94.4  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.105674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  30.05 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  33.16 
 
 
206 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2269  beta-lactamase domain-containing protein  33.85 
 
 
214 aa  93.2  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.289735 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>