More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2021 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2021  putative dihydropteroate synthase  100 
 
 
379 aa  783    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000920733  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1567  dihydropteroate synthase  73.09 
 
 
380 aa  554  1e-157  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1002  dihydropteroate synthase  58.48 
 
 
406 aa  471  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1084  dihydropteroate synthase  58.4 
 
 
380 aa  459  9.999999999999999e-129  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.982793  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0672  dihydropteroate synthase  59.74 
 
 
380 aa  460  9.999999999999999e-129  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.999539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0613  dihydropteroate synthase  58.13 
 
 
380 aa  457  1e-127  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0688  dihydropteroate synthase  57.87 
 
 
380 aa  453  1.0000000000000001e-126  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201794  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1113  dihydropteroate synthase  56.37 
 
 
380 aa  433  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0029811  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  48.94 
 
 
380 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1647  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 
380 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000944705  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  34.76 
 
 
394 aa  204  3e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  34.32 
 
 
400 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  32.89 
 
 
400 aa  200  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  38.64 
 
 
266 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  31.98 
 
 
396 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  34.99 
 
 
412 aa  187  3e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  34.83 
 
 
413 aa  186  7e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  38.87 
 
 
278 aa  184  3e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  34.64 
 
 
397 aa  182  6e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  37.92 
 
 
286 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  33.96 
 
 
394 aa  182  7e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  39.1 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  34.72 
 
 
275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1527  7,8-dihydropteroate synthase protein  37.55 
 
 
291 aa  178  2e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.134999  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  29.75 
 
 
407 aa  177  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  35.88 
 
 
280 aa  176  4e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  39.38 
 
 
286 aa  176  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  37.05 
 
 
292 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  39.1 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  38.55 
 
 
283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  36.19 
 
 
277 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1862  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  37.09 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  38.17 
 
 
283 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  37.3 
 
 
279 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0511  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 
345 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2382  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
283 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  36.92 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2633  dihydropteroate synthase  37.83 
 
 
294 aa  172  6.999999999999999e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160124  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1476  dihydropteroate synthase  36.47 
 
 
283 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  36.43 
 
 
277 aa  172  7.999999999999999e-42  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  38.17 
 
 
283 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  35.51 
 
 
277 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  35.04 
 
 
277 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
283 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  38.25 
 
 
275 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 
282 aa  170  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
283 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  37.88 
 
 
290 aa  169  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  34.87 
 
 
283 aa  169  9e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  35.66 
 
 
291 aa  169  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  30.73 
 
 
402 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  36.4 
 
 
278 aa  168  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  35.56 
 
 
278 aa  168  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  35.98 
 
 
277 aa  168  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  35.04 
 
 
277 aa  168  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  29.82 
 
 
817 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
277 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  35.56 
 
 
278 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  36.84 
 
 
287 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  34.63 
 
 
272 aa  167  2.9999999999999998e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
283 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  37.2 
 
 
279 aa  167  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  36.98 
 
 
283 aa  166  4e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  31.4 
 
 
399 aa  166  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 
271 aa  165  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  36.05 
 
 
347 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5465  dihydropteroate synthase  38.8 
 
 
286 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.128045  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  37.4 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  37.69 
 
 
376 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  37.05 
 
 
280 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1911  dihydropteroate synthase  36.18 
 
 
268 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  35.89 
 
 
298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0210  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0484  dihydropteroate synthase  35.88 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.154911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  36.88 
 
 
290 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  35.61 
 
 
278 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 
258 aa  164  3e-39  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1769  dihydropteroate synthase  39.2 
 
 
286 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.633789  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2044  dihydropteroate synthase  37.26 
 
 
285 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  38.31 
 
 
277 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0945  dihydropteroate synthase  35.21 
 
 
279 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.601088 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2354  dihydropteroate synthase  35.32 
 
 
279 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2404  dihydropteroate synthase  35.32 
 
 
279 aa  163  5.0000000000000005e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  35.47 
 
 
286 aa  163  6e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  34.7 
 
 
284 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0729  dihydropteroate synthase  35.71 
 
 
275 aa  162  8.000000000000001e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  37.02 
 
 
264 aa  162  9e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  37.02 
 
 
264 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  35.9 
 
 
277 aa  162  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  35.85 
 
 
302 aa  162  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1381  dihydropteroate synthase  35.96 
 
 
281 aa  161  1e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.131538  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  36.11 
 
 
276 aa  162  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
282 aa  161  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
282 aa  161  2e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
282 aa  161  2e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
282 aa  161  2e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>