More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1893 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1893  disulfide isomerase  100 
 
 
307 aa  633  1e-180  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1120  putative prophage LambdaCh01, recombination protein Bet  68.67 
 
 
305 aa  432  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0023  putative ribosomal pseudouridine synthase  54.03 
 
 
300 aa  326  2e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.835317  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1741  RNA pseudouridine synthase  51.16 
 
 
304 aa  319  4e-86  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1818  RNA pseudouridine synthase  51.32 
 
 
319 aa  318  9e-86  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0024  RNA pseudouridine synthase family protein  50.68 
 
 
300 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0022  RNA pseudouridylate synthase family protein  50.68 
 
 
300 aa  305  5e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0049  RNA pseudouridine synthase family protein  49.66 
 
 
300 aa  302  5e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0056  pseudouridine synthase  43.38 
 
 
302 aa  267  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2094  pseudouridine synthase, RluD  42.47 
 
 
304 aa  236  3e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0458  RluA family pseudouridine synthase  30.88 
 
 
311 aa  115  9e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0878  RluA family pseudouridine synthase  28.21 
 
 
325 aa  114  2e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.175115  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0473  RluA family pseudouridine synthase  30.51 
 
 
311 aa  113  3e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl387  23S rRNA/tRNA pseudouridine synthase  32.49 
 
 
311 aa  112  7e-24  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.319286  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1604  pseudouridine synthase, RluA family  33.19 
 
 
331 aa  111  1e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.357256  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3127  pseudouridine synthase, RluA family  31 
 
 
327 aa  108  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11940  Pseudouridine synthase  30.67 
 
 
336 aa  107  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3159  pseudouridine synthase, RluA family  31.23 
 
 
329 aa  106  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0969  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.51 
 
 
324 aa  105  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466312 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2253  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.58 
 
 
391 aa  104  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391915  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6286  pseudouridine synthase, RluD  28.22 
 
 
402 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1793  RluA family pseudouridine synthase  28.22 
 
 
402 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2333  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.33 
 
 
395 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.93917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1813  RluA family pseudouridine synthase  28.33 
 
 
389 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.587957  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1731  RluA family pseudouridine synthase  28.63 
 
 
405 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1704  RluA family pseudouridine synthase  28.63 
 
 
407 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.225391  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1324  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.33 
 
 
395 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224168  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1481  RluA family pseudouridine synthase  28.22 
 
 
400 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00249005  normal  0.0889319 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1084  RluA family pseudouridine synthase  28.33 
 
 
389 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.346306  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3518  pseudouridine synthase, RluA family  31.33 
 
 
299 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0083  RluA family pseudouridine synthase  28.33 
 
 
389 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2205  RluA family pseudouridine synthase  28.33 
 
 
395 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5094  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.22 
 
 
402 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0815  pseudouridine synthase, RluA family  29.91 
 
 
315 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.689288  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2168  RluA family pseudouridine synthase  28.33 
 
 
389 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0998  pseudouridine synthase, RluA family  28.15 
 
 
547 aa  103  3e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.012801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2235  RluA family pseudouridine synthase  30.08 
 
 
313 aa  103  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.894524  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0386  RluA family pseudouridine synthase  29.5 
 
 
303 aa  103  4e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1817  RluA family pseudouridine synthase  27.8 
 
 
360 aa  102  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294999 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1014  pseudouridine synthase  35.55 
 
 
229 aa  102  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2034  pseudouridine synthase, RluA family  27.41 
 
 
319 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60210  pseudouridine synthase  30.22 
 
 
320 aa  102  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  1.35219e-10 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1813  pseudouridine synthase, RluA family  25.84 
 
 
526 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  9.64916e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0967  RluA family pseudouridine synthase  27.39 
 
 
436 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3630  pseudouridine synthase  33.77 
 
 
217 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.146108  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf515  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  30.85 
 
 
298 aa  101  2e-20  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1628  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D protein  29.75 
 
 
358 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1841  pseudouridine synthase, RluA family  24.07 
 
 
431 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.482122  normal  0.168334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5183  pseudouridine synthase  30.22 
 
 
320 aa  101  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.521194  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0972  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.57 
 
 
334 aa  100  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4953  pseudouridine synthase, RluA family  25.96 
 
 
369 aa  100  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0729  pseudouridine synthase  32.89 
 
 
216 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.55311e-07  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4547  RluA family pseudouridine synthase  28.51 
 
 
352 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2346  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.97 
 
 
438 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0455755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0669  RluA family pseudouridine synthase  28.51 
 
 
352 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1572  RluA family pseudouridine synthase  27.9 
 
 
420 aa  100  4e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00305296  hitchhiker  0.00710721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1919  pseudouridine synthase, RluA family  31.82 
 
 
370 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.338974  normal  0.0110313 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1591  pseudouridine synthase, RluA family  31.82 
 
 
370 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  decreased coverage  0.00904495 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1344  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.44 
 
 
403 aa  99.8  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0793  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.12 
 
 
223 aa  99.8  6e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0072267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2950  suppressor of ftsH mutation  27.47 
 
 
326 aa  99.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1856  RluA family pseudouridine synthase  30.04 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0259  ribosomal large subunit pseudouridine synthase, RluD subfamily  30.54 
 
 
290 aa  99.8  6e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0663  RluA family pseudouridine synthase  28.51 
 
 
352 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.241862  normal  0.120069 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1002  pseudouridine synthase, RluA family  28.27 
 
 
325 aa  99  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0353  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  31.86 
 
 
244 aa  98.6  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1460  pseudouridine synthase  38.92 
 
 
217 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3657  RluA family pseudouridine synthase  27.61 
 
 
344 aa  98.6  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0134519  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0929  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  32.77 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1612  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.74 
 
 
356 aa  98.2  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000933226 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1589  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.58 
 
 
308 aa  98.2  1e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0462053  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0827  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.33 
 
 
320 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.587851  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0318  RluA  34.44 
 
 
299 aa  98.6  1e-19  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.264747  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1976  pseudouridine synthase, RluD  28.38 
 
 
318 aa  99  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04873  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.36 
 
 
333 aa  98.2  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1918  pseudouridylate synthase  30.04 
 
 
331 aa  98.2  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.313476  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1079  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28.94 
 
 
304 aa  98.2  2e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0583  pseudouridine synthase, RluA family  35.33 
 
 
305 aa  97.8  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4836  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  28 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0596  ribosomal large subunit pseudouridine synthase C  29.17 
 
 
308 aa  97.1  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  5.79613e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2765  pseudouridine synthase  33.87 
 
 
215 aa  97.4  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.416224  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1818  pseudouridine synthase  29.96 
 
 
306 aa  97.4  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.05074  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0726  pseudouridine synthase, RluD  28.44 
 
 
320 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03674  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  34.18 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1675  pseudouridine synthase  33.48 
 
 
234 aa  96.7  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0568  pseudouridine synthase  32.75 
 
 
217 aa  96.3  5e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.494043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4520  ribosomal large subunit pseudouridine synthase A  30.7 
 
 
227 aa  96.3  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0069  pseudouridine synthase  30.43 
 
 
235 aa  96.3  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.555782  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1303  pseudouridine synthase, RluA family  30.6 
 
 
314 aa  96.7  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4321  RluA family pseudouridine synthase  28.89 
 
 
350 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.412069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1630  pseudouridylate synthase  34.91 
 
 
223 aa  96.3  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.427552  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1580  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  29.78 
 
 
308 aa  95.9  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0928054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0989  RluA family pseudouridine synthase  29.17 
 
 
306 aa  96.3  7e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00899774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1821  RluA family pseudouridine synthase  34.44 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4308  pseudouridine synthase, RluA family  28.79 
 
 
323 aa  95.9  8e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3827  pseudouridine synthase  32.9 
 
 
217 aa  95.5  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3230  RluA family pseudouridine synthase  30.22 
 
 
320 aa  95.5  9e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0515  pseudouridylate synthase  34.29 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2552  ribosomal large subunit pseudouridine synthase D  26.5 
 
 
313 aa  95.5  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0920144  normal  0.0397584 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33477  DRAP deaminase  34.66 
 
 
585 aa  95.1  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.261571 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>