61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1878 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1878  NosL protein  100 
 
 
152 aa  310  4.999999999999999e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00130265  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0697  NosL family protein  55.08 
 
 
350 aa  131  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1317  hypothetical protein  44.07 
 
 
364 aa  104  4e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.199897  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2169  hypothetical protein  44.62 
 
 
378 aa  98.6  3e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.986179  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1474  NosL family protein  41.41 
 
 
156 aa  97.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.819898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2816  NosL protein  40.68 
 
 
131 aa  94  6e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1829  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  39.32 
 
 
160 aa  92  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.420918  normal  0.0608142 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0677  putative lipoprotein involved in nitrous oxide reduction  35.48 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3636  NosL protein  40.83 
 
 
162 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3586  NosL protein  39.34 
 
 
162 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0509  hypothetical protein  40.62 
 
 
364 aa  86.3  1e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0438  NosL protein  36.75 
 
 
170 aa  84.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.077405  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0472  NosL family protein  36.36 
 
 
163 aa  84  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0467  NosL family protein  37.19 
 
 
165 aa  83.6  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1258  nosL protein  33.76 
 
 
160 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1308  hypothetical protein  36.07 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00257483  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3207  hypothetical protein  36.36 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1214  lipoprotein  33.33 
 
 
172 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0655  hypothetical protein  30.23 
 
 
210 aa  61.2  0.000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1397  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123154  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0599  putative lipoprotein  31.53 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4740  putative lipoprotein  31.53 
 
 
167 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5552  lipoprotein  31.37 
 
 
168 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00108003 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4177  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4065  hypothetical protein  31.58 
 
 
200 aa  54.3  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.562736  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4911  hypothetical protein  32.17 
 
 
181 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189693  decreased coverage  0.000364228 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0449  hypothetical protein  29.17 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2857  NosL family protein  26.83 
 
 
193 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0693  putative lipoprotein  30.63 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0476  lipoprotein  29.82 
 
 
167 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0624  putative lipoprotein  29.73 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0212  hypothetical protein  28.26 
 
 
180 aa  52  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0442724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0474  hypothetical protein  30.63 
 
 
167 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0619  putative lipoprotein  29.73 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0563  putative lipoprotein  29.73 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0532  putative lipoprotein  29.73 
 
 
167 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0476  hypothetical protein  28.83 
 
 
167 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1929  hypothetical protein  34.41 
 
 
160 aa  50.8  0.000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1133  hypothetical protein  29.77 
 
 
204 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0922744  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2568  NosL family protein  29.92 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.67081  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1054  hypothetical protein  29.01 
 
 
204 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3360  NosL family protein  31.09 
 
 
163 aa  47.8  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.798238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2018  hypothetical protein  26.85 
 
 
161 aa  46.2  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.46525  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2354  lipoprotein  31.34 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0494  NosL family protein  29.41 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3536  NosL family protein  29.41 
 
 
163 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1722  copper-binding protein  43.9 
 
 
711 aa  45.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146255  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0658  NosL family protein  42.86 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1081  NosL family protein  26.58 
 
 
181 aa  44.3  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.534314  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3203  NosL  30.53 
 
 
181 aa  44.3  0.0006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87408  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4736  protein disulfide isomerase NosL  25.77 
 
 
167 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0795  lipoprotein  30.43 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.300197  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3146  NosL  28.48 
 
 
181 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0354  NosL family protein  25.95 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0449  nitrous-oxide reductase accessory protein NosL  32 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000932903  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1055  NosL family protein  44 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1134  NosL family protein  44 
 
 
182 aa  41.6  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0185331  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3996  NosL family protein  28.57 
 
 
163 aa  41.2  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3074  NosL family protein  25 
 
 
196 aa  40.8  0.007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.650914  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0694  hypothetical protein  29.82 
 
 
341 aa  40.4  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0701327  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2215  NosL  28.06 
 
 
180 aa  40  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>