65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1865 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1865  citrate transporter  100 
 
 		 455 aa  892    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2039  transport protein  81.1 
 
 		 455 aa  726    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1749  transport protein  69.38 
 
 		 435 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.439809  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1758  transport protein  58.94 
 
 		 432 aa  523  1e-147  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0006  Na+/H+ antiporter family protein  53.85 
 
 		 433 aa  444  1e-123  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0435713  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0006  Na+/H+ antiporter family protein  53.29 
 
 		 433 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000950539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0032  Na+/H+ antiporter family protein  53.63 
 
 		 433 aa  425  1e-117  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.540321  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2204  Na+/H+ antiporter family protein  50.66 
 
 		 433 aa  416  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000124721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0477  Na+/H+ antiporter NhaC  55.16 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1540  Na+/H+ antiporter family protein  50.87 
 
 		 450 aa  395  1e-109  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0558  Na+/H+ antiporter family protein  45.56 
 
 		 446 aa  381  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000048202 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3845  Na+/H+ antiporter  41.87 
 
 		 439 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4127  hypothetical protein  41.65 
 
 		 439 aa  347  4e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00423015 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4012  hypothetical protein  41.43 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4325  hypothetical protein  41.43 
 
 		 439 aa  344  2e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.895738  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3935  Na+/H+ antiporter NhaC  41.65 
 
 		 439 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.10264  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3859  Na+/H+ antiporter  41.65 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4213  hypothetical protein  41.34 
 
 		 439 aa  342  8e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1024  hypothetical protein  41.34 
 
 		 439 aa  342  1e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2095  hypothetical protein  43.87 
 
 		 440 aa  341  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.425927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2449  Na+/H+ antiporter NhaC  44.28 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00774297  normal  0.301135 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4236  hypothetical protein  41.43 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2757  hypothetical protein  44.28 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4172  hypothetical protein  41.34 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2377  Na+/H+ antiporter NhaC  44.06 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00605411  normal  0.730196 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2542  Na+/H+ antiporter NhaC  43.84 
 
 		 439 aa  339  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000174807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1014  permease  43.55 
 
 		 452 aa  337  1.9999999999999998e-91  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.747204  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002937  hypothetical protein  47.42 
 
 		 425 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000304263  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02993  hypothetical protein  44.05 
 
 		 431 aa  337  2.9999999999999997e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2802  Na+ antiporter NhaC  41.56 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.936373  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2575  Na+/H+ antiporter NhaC  43.2 
 
 		 439 aa  333  5e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000723865  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1515  Na+/H+ antiporter NhaC  42.64 
 
 		 439 aa  330  4e-89  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000563518  normal  0.487296 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1776  Na+/H+ antiporter NhaC  41.56 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000109905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1733  Na+/H+ antiporter NhaC  41.56 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000745905  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0526  hypothetical protein  43.75 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2547  Na+/H+ antiporter NhaC  41.56 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000475833  hitchhiker  0.0000000305197 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1737  Na+/H+ antiporter NhaC  41.56 
 
 		 439 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000126474  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1861  sodium/proton antiporter  41.56 
 
 		 442 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1898  Na+/H+ antiporter NhaC  41.88 
 
 		 453 aa  322  9.999999999999999e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0935892  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1598  Na+/H+ antiporter NhaC  42.64 
 
 		 439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000151079  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1847  Na+/H+ antiporter NhaC  43.2 
 
 		 439 aa  316  6e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000629445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0056  Na+/H+ antiporter NhaC  40.73 
 
 		 440 aa  316  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.455554  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0887  Na+/H+ antiporter NhaC  42.61 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.801907  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2092  Na+/H+ antiporter NhaC  42.46 
 
 		 445 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000144395  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2742  Na+/H+ antiporter NhaC  41.56 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000444326  hitchhiker  0.000511547 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1454  Na+/H+ antiporter NhaC  41.63 
 
 		 442 aa  313  5.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0962  Na+ antiporter NhaC  40.69 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000234758  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0943  Na+/H+ antiporter NhaC  40.69 
 
 		 438 aa  310  2.9999999999999997e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000851242  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1978  Na+/H+ antiporter NhaC  39.21 
 
 		 464 aa  300  4e-80  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331673 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1651  Na+/H+ antiporter NhaC  43.03 
 
 		 448 aa  298  9e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00196781  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0529  hypothetical protein  39.87 
 
 		 438 aa  298  1e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0114104  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29770  putative transporter  41.59 
 
 		 441 aa  289  6e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000647538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2547  putative transporter  42.24 
 
 		 441 aa  289  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200049  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1068  Na+/H+ antiporter NhaC-like protein  43.94 
 
 		 440 aa  288  1e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000122266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3769  Na+/H+ antiporter NhaC  43.73 
 
 		 438 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2075  Na+/H+ antiporter NhaC  40.78 
 
 		 439 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.355597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2366  Na+/H+ antiporter NhaC  43.53 
 
 		 439 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1999  Na+/H+ antiporter NhaC  41.43 
 
 		 439 aa  272  1e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00435268  normal  0.0272999 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2218  Na+/H+ antiporter NhaC  39.91 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3556  Na+/H+ antiporter NhaC  39.91 
 
 		 439 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0943  Na+ antiporter NhaC  36.81 
 
 		 448 aa  267  2.9999999999999995e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.629306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1343  Na+/H+ antiporter NhaC  36.77 
 
 		 438 aa  258  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014842  hitchhiker  0.000383483 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01104  Na+/H+ antiporter  27.59 
 
 		 455 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3210  Na+/H+ antiporter NhaC  27.34 
 
 		 517 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2679  Na+/H+ antiporter NhaC  29.7 
 
 		 442 aa  43.5  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.468858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>