More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1856 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1409  methyl-accepting chemotaxis protein  59.39 
 
 		 655 aa  764    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0869  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein  58.84 
 
 		 649 aa  754    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0397  methyl-accepting chemotaxis protein  59.39 
 
 		 655 aa  764    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  100 
 
 		 654 aa  1318    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0395  UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase (UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanine synthetase)  42.92 
 
 		 663 aa  478  1e-133  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1698  methyl-accepting chemotaxis protein  39.15 
 
 		 653 aa  435  1e-120  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.130314  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1307  methyl-accepting chemotaxis protein  43.87 
 
 		 596 aa  416  9.999999999999999e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000917497  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0190  methyl-accepting chemotaxis protein  38.37 
 
 		 657 aa  403  1e-111  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.145639  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1305  methyl-accepting chemotaxis protein  37.33 
 
 		 652 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.049405  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1957  methyl-accepting chemotaxis protein  45.76 
 
 		 654 aa  371  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0289  methyl-accepting chemotaxis protein  37.61 
 
 		 665 aa  369  1e-100  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1394  putative 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase (ptps; ptp synthase)  51.44 
 
 		 656 aa  365  1e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0141  MCP-domain signal transduction protein  36.55 
 
 		 658 aa  351  3e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1915  methyl-accepting chemotaxis protein  34.48 
 
 		 653 aa  347  4e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.633585  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1720  methyl-accepting chemotaxis protein  36.28 
 
 		 664 aa  346  8e-94  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0383  MCP-domain signal transduction protein  35.89 
 
 		 656 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.168196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1471  DNA processing chain A  51.95 
 
 		 651 aa  338  1.9999999999999998e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0140  methyl-accepting chemotaxis protein  39.38 
 
 		 540 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0312  methyl-accepting chemotaxis protein  36.31 
 
 		 662 aa  336  7e-91  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1546  MCP-domain signal transduction protein  34.38 
 
 		 660 aa  336  9e-91  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0314  methyl-accepting chemotaxis protein  34.8 
 
 		 659 aa  328  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1547  MCP-domain signal transduction protein  35.21 
 
 		 657 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0180  methyl-accepting chemotaxis protein  34.36 
 
 		 659 aa  327  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  38.36 
 
 		 604 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1735  methyl-accepting chemotaxis protein  33.87 
 
 		 651 aa  317  3e-85  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1331  MCP-domain signal transduction protein  34.48 
 
 		 678 aa  315  1.9999999999999998e-84  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0185  methyl-accepting chemotaxis protein  50.85 
 
 		 544 aa  313  4.999999999999999e-84  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000579859  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1041  methyl-accepting chemotaxis protein  38.87 
 
 		 731 aa  308  2.0000000000000002e-82  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.32701  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1499  MCP-domain signal transduction protein  35.44 
 
 		 694 aa  307  5.0000000000000004e-82  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1679  methyl-accepting chemotaxis protein  37.6 
 
 		 700 aa  300  8e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1498  methyl-accepting chemotaxis protein  37.4 
 
 		 700 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.756421  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1645  methyl-accepting chemotaxis protein  48.59 
 
 		 545 aa  294  3e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0567442  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1858  methyl-accepting chemotaxis protein  36.61 
 
 		 700 aa  291  2e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1227  methyl-accepting chemotaxis protein  47.7 
 
 		 553 aa  280  8e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1549  methyl-accepting chemotaxis protein  55.16 
 
 		 236 aa  221  3e-56  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00107467  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0269  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.87 
 
 		 663 aa  218  4e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0375988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  27.8 
 
 		 621 aa  160  5e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.61 
 
 		 632 aa  158  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  28.01 
 
 		 626 aa  154  4e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.33 
 
 		 658 aa  154  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 636 aa  150  6e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1061  methyl-accepting chemotaxis protein  27.73 
 
 		 626 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.8 
 
 		 372 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.409493  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0495  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.43 
 
 		 661 aa  148  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3603  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.95 
 
 		 630 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.840663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3480  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 		 630 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3405  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.1 
 
 		 630 aa  146  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  25.13 
 
 		 629 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0882  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.8 
 
 		 630 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4876  chemotactic transducer PctA  25.04 
 
 		 629 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.647167  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1056  methyl-accepting chemotaxis protein  24.23 
 
 		 630 aa  144  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  25.31 
 
 		 629 aa  144  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.09 
 
 		 625 aa  144  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0895  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.87 
 
 		 630 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.174985 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  26 
 
 		 624 aa  142  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2719  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.17 
 
 		 655 aa  140  7e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  25.7 
 
 		 623 aa  140  7.999999999999999e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.91 
 
 		 660 aa  140  8.999999999999999e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0544  methyl-accepting chemotaxis protein  26.86 
 
 		 660 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0138447  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0575  methyl-accepting chemotaxis protein  26.86 
 
 		 660 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0930  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.57 
 
 		 630 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.257402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56000  chemotactic transducer PctA  25.42 
 
 		 629 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4029  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.41 
 
 		 630 aa  137  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2920  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.61 
 
 		 596 aa  136  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.115472  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1867  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 		 660 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1821  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 		 660 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.63 
 
 		 650 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2009  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 		 660 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2043  methyl-accepting chemotaxis protein  26.52 
 
 		 660 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000331062 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003139  methyl-accepting chemotaxis protein  26.16 
 
 		 627 aa  135  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.116124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2480  methyl-accepting chemotaxis protein  22.58 
 
 		 629 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  25 
 
 		 632 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.34 
 
 		 658 aa  133  9e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0322  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.06 
 
 		 662 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1837  methyl-accepting chemotaxis protein  26.24 
 
 		 660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1011  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.65 
 
 		 624 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.752503  hitchhiker  0.0000000000251926 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0613  methyl-accepting chemotaxis protein  27.22 
 
 		 660 aa  133  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  39.71 
 
 		 650 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  24.81 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3298  methyl-accepting chemotaxis protein  25.99 
 
 		 660 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.220146 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4726  methyl-accepting chemotaxis protein  26.92 
 
 		 660 aa  131  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.520736  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3056  methyl-accepting chemotaxis protein  25.33 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0365  accessory colonization factor AcfB  26.64 
 
 		 626 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3561  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.89 
 
 		 673 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.506738  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3291  methyl-accepting chemotaxis protein  25.33 
 
 		 650 aa  130  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.279097  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1871  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  25.16 
 
 		 660 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  39.01 
 
 		 661 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3282  methyl-accepting chemotaxis protein  25.33 
 
 		 660 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  61.11 
 
 		 566 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.21 
 
 		 832 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2783  methyl-accepting chemotaxis protein  27.34 
 
 		 705 aa  128  3e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.260069  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1039  protease htpx  46.84 
 
 		 656 aa  128  3e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0758551  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1200  methyl-accepting chemotaxis protein  23.64 
 
 		 728 aa  127  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0550  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  24.82 
 
 		 660 aa  127  6e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000171017  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4745  methyl-accepting chemotaxis protein  25.26 
 
 		 658 aa  127  7e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  24.82 
 
 		 660 aa  127  7e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0020921  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  47.73 
 
 		 530 aa  127  8.000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1432  chemotaxis sensory transducer  61.32 
 
 		 546 aa  126  1e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.138665  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  51.82 
 
 		 625 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>