More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1853 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  80.96 
 
 
436 aa  736    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
436 aa  886    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  67.36 
 
 
436 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.64 
 
 
441 aa  557  1e-157  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  62.16 
 
 
442 aa  535  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  59.36 
 
 
440 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  59.36 
 
 
440 aa  532  1e-150  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  59.13 
 
 
440 aa  531  1e-150  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  49.65 
 
 
435 aa  441  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  52.18 
 
 
437 aa  441  9.999999999999999e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  38.03 
 
 
450 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  45.83 
 
 
460 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  45.54 
 
 
458 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  38.06 
 
 
450 aa  303  5.000000000000001e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.86 
 
 
443 aa  301  1e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  300  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  299  8e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.63 
 
 
449 aa  298  9e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  38.68 
 
 
445 aa  298  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.38 
 
 
461 aa  297  2e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  296  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  297  3e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  297  3e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  37.25 
 
 
446 aa  296  3e-79  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  297  3e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  297  3e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  36.65 
 
 
446 aa  296  4e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  45.62 
 
 
450 aa  292  8e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  37.53 
 
 
443 aa  292  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  35.62 
 
 
457 aa  291  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  35.62 
 
 
457 aa  291  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  39.17 
 
 
443 aa  289  6e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.74 
 
 
458 aa  288  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  43.58 
 
 
459 aa  286  4e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.1 
 
 
446 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.29 
 
 
503 aa  285  9e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.48 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.67 
 
 
453 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  35.36 
 
 
463 aa  283  4.0000000000000003e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  38.27 
 
 
450 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  39.4 
 
 
452 aa  282  9e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  45.91 
 
 
515 aa  281  2e-74  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.07 
 
 
591 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.07 
 
 
587 aa  280  3e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.69 
 
 
469 aa  280  3e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.280164  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.98 
 
 
474 aa  279  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  35.78 
 
 
441 aa  279  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  41.23 
 
 
490 aa  279  7e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  40.41 
 
 
478 aa  278  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  34.98 
 
 
465 aa  278  1e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0001  chromosomal replication initiation protein  35.65 
 
 
465 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00156244  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.61 
 
 
444 aa  278  2e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40 
 
 
511 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
511 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
453 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  35.99 
 
 
445 aa  277  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  41.79 
 
 
442 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  35.71 
 
 
453 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  34.88 
 
 
451 aa  278  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  39.23 
 
 
464 aa  278  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0001  chromosomal replication initiation protein  40 
 
 
507 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00366311  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  36.45 
 
 
436 aa  277  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  36.3 
 
 
451 aa  276  5e-73  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  35.62 
 
 
452 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  35.62 
 
 
452 aa  276  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.01 
 
 
474 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00208216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 
451 aa  276  7e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  34.8 
 
 
451 aa  276  7e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.98 
 
 
462 aa  275  8e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.78 
 
 
440 aa  275  8e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.01 
 
 
461 aa  275  9e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.926832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.43 
 
 
453 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.18 
 
 
473 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4153  chromosomal replication initiation protein  34.23 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  7.6269e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4177  chromosomal replication initiation protein  34.23 
 
 
462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  41.48 
 
 
477 aa  274  3e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.27 
 
 
454 aa  274  3e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.84 
 
 
491 aa  274  3e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.68 
 
 
464 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00240104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.68 
 
 
480 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0206444  normal  0.0774659 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2507  chromosomal replication initiation protein  34.16 
 
 
472 aa  273  6e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000251721  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0136  chromosomal replication initiation protein  37.1 
 
 
452 aa  273  6e-72  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000582235  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.86 
 
 
528 aa  273  6e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.16 
 
 
449 aa  272  7e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0001  chromosomal replication initiation protein  40.48 
 
 
511 aa  272  8.000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.424003  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0010  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
506 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.645293  hitchhiker  0.0000364152 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0001  chromosomal replication initiation protein  34.17 
 
 
450 aa  271  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000634969  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0001  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
505 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390724  normal  0.0464489 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0003  chromosomal replication initiation protein  40.18 
 
 
510 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  40.59 
 
 
492 aa  271  2e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002009  chromosomal replication initiator protein dnaA  41.3 
 
 
468 aa  271  2e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000552796  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.11 
 
 
721 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.24 
 
 
480 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  43.31 
 
 
582 aa  270  4e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.35 
 
 
570 aa  270  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00442  chromosomal replication initiation protein  41.56 
 
 
468 aa  270  5e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  39.23 
 
 
472 aa  270  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0009  chromosomal replication initiation protein  33.63 
 
 
468 aa  269  5.9999999999999995e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00184157  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>