More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1841 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1841  diaminopimelate epimerase  100 
 
 		 247 aa  510  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0348  diaminopimelate epimerase  68.4 
 
 		 249 aa  346  2e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1771  diaminopimelate epimerase  61.94 
 
 		 247 aa  295  4e-79  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0072  diaminopimelate epimerase  57.89 
 
 		 247 aa  288  8e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2046  diaminopimelate epimerase  54.69 
 
 		 257 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1883  diaminopimelate epimerase  55.28 
 
 		 249 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1516  diaminopimelate epimerase  55.28 
 
 		 249 aa  265  5e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1702  diaminopimelate epimerase  55.28 
 
 		 249 aa  265  7e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0107  diaminopimelate epimerase  50.19 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0054  diaminopimelate epimerase  52.03 
 
 		 249 aa  236  2e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000506343  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0492  diaminopimelate epimerase  48.95 
 
 		 247 aa  227  2e-58  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1165  diaminopimelate epimerase  39.48 
 
 		 277 aa  151  1e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0057  diaminopimelate epimerase  39.51 
 
 		 287 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.809521 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1764  diaminopimelate epimerase  34.96 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1455  diaminopimelate epimerase  39.05 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0568169  normal  0.427819 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1977  diaminopimelate epimerase  35.56 
 
 		 268 aa  123  3e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00347642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1270  diaminopimelate epimerase  36.29 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000437124  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1416  diaminopimelate epimerase  36.29 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0018  diaminopimelate epimerase  34.2 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0273  diaminopimelate epimerase  35.58 
 
 		 264 aa  119  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000651876  decreased coverage  0.0000261892 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0755  diaminopimelate epimerase  36.89 
 
 		 292 aa  118  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.277533  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1873  diaminopimelate epimerase  40.16 
 
 		 281 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00642624 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0342  diaminopimelate epimerase  32.82 
 
 		 270 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00240422  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1614  diaminopimelate epimerase  33.58 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1297  diaminopimelate epimerase  37.6 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0270469  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0044  Diaminopimelate epimerase  36.18 
 
 		 274 aa  116  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0648  diaminopimelate epimerase  38.57 
 
 		 279 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.312023  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1874  diaminopimelate epimerase  33.63 
 
 		 232 aa  115  7.999999999999999e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3911  diaminopimelate epimerase  31.67 
 
 		 278 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000014608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3074  diaminopimelate epimerase  31.02 
 
 		 279 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000185766  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2694  diaminopimelate epimerase  30.42 
 
 		 268 aa  111  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000359695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0790  diaminopimelate epimerase  33.21 
 
 		 276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3323  diaminopimelate epimerase  31.32 
 
 		 278 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2992  diaminopimelate epimerase  31.56 
 
 		 282 aa  110  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000459249  normal  0.46742 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1798  diaminopimelate epimerase  38.19 
 
 		 283 aa  109  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000300974  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2316  diaminopimelate epimerase  33.79 
 
 		 274 aa  108  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0561  diaminopimelate epimerase  35.25 
 
 		 282 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00183817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5091  diaminopimelate epimerase  36.57 
 
 		 259 aa  108  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000217016  normal  0.274183 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0304  diaminopimelate epimerase  34.16 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.684099  hitchhiker  0.00244199 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0218  diaminopimelate epimerase  32.47 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2345  diaminopimelate epimerase  29.82 
 
 		 279 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1604  diaminopimelate epimerase  31.5 
 
 		 278 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3907  Diaminopimelate epimerase  30.29 
 
 		 283 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.739136  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0127  diaminopimelate epimerase  30.89 
 
 		 261 aa  105  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0805  hypothetical protein  36.15 
 
 		 258 aa  105  8e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.15567 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0358  diaminopimelate epimerase  30.6 
 
 		 278 aa  105  8e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000380809  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0339  diaminopimelate epimerase  31.18 
 
 		 278 aa  104  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  3.6920099999999997e-35 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0208  diaminopimelate epimerase  33.94 
 
 		 261 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0882102 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1814  diaminopimelate epimerase  31.09 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0454  diaminopimelate epimerase  31.96 
 
 		 279 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0531  diaminopimelate epimerase  30.14 
 
 		 282 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.46131  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2100  diaminopimelate epimerase  31.09 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0181  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 272 aa  103  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00086691  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12773  Diaminopimelate epimerase  35.24 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2431  diaminopimelate epimerase  34.55 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.410157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1694  diaminopimelate epimerase  27.64 
 
 		 284 aa  99.8  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0440642  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09951  diaminopimelate epimerase  31.25 
 
 		 284 aa  100  3e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.51158 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4694  diaminopimelate epimerase  34.43 
 
 		 261 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  0.0110449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0549  diaminopimelate epimerase  30.69 
 
 		 280 aa  98.6  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3414  diaminopimelate epimerase  29.75 
 
 		 278 aa  98.2  1e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0481236  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2322  diaminopimelate epimerase  28.99 
 
 		 277 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000212903  hitchhiker  0.00476007 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0322  diaminopimelate epimerase  30.9 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.217655  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3100  diaminopimelate epimerase  29.24 
 
 		 280 aa  97.1  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239794  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2115  diaminopimelate epimerase  31.51 
 
 		 278 aa  97.1  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2160  diaminopimelate epimerase  34.09 
 
 		 272 aa  95.9  6e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0630  diaminopimelate epimerase  26.07 
 
 		 304 aa  95.9  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0063  diaminopimelate epimerase  34.06 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1382  diaminopimelate epimerase  32.35 
 
 		 279 aa  95.1  9e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0183  diaminopimelate epimerase  31.05 
 
 		 274 aa  94.7  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.190067  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0560  diaminopimelate epimerase  29.52 
 
 		 274 aa  94.4  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00795649 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1927  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 280 aa  94  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1173  diaminopimelate epimerase  27.41 
 
 		 278 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.16632  hitchhiker  0.0076294 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0185  diaminopimelate epimerase  30.83 
 
 		 280 aa  92.8  5e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.00343666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0888  diaminopimelate epimerase  29.91 
 
 		 279 aa  92  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000673594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0004  diaminopimelate epimerase  28.51 
 
 		 292 aa  91.3  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0554484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0071  diaminopimelate epimerase  33.65 
 
 		 245 aa  91.3  1e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0259  diaminopimelate epimerase  31.82 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3088  diaminopimelate epimerase  28.99 
 
 		 282 aa  90.5  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.233699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11570  Diaminopimelate epimerase  25.89 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3975  diaminopimelate epimerase  28 
 
 		 274 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.525187  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4074  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3837  diaminopimelate epimerase  27.64 
 
 		 277 aa  90.9  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0489107  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0998  diaminopimelate epimerase  30.86 
 
 		 260 aa  89.7  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0232  diaminopimelate epimerase  29.96 
 
 		 274 aa  89.7  4e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.596238  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1738  diaminopimelate epimerase  27.35 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0164  diaminopimelate epimerase  27.78 
 
 		 277 aa  89.4  5e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.543882  normal  0.191958 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4166  diaminopimelate epimerase  28.62 
 
 		 274 aa  89  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.078673  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0724  diaminopimelate epimerase  26.92 
 
 		 277 aa  88.6  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0456566  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09701  diaminopimelate epimerase  28.47 
 
 		 286 aa  88.2  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0227672  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15041  diaminopimelate epimerase  27.6 
 
 		 323 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.476128 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4334  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4227  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.642483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4275  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1371  diaminopimelate epimerase  29.64 
 
 		 368 aa  86.7  3e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.692483  normal  0.473185 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4175  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.132697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4157  diaminopimelate epimerase  28.57 
 
 		 274 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1610  diaminopimelate epimerase  29.02 
 
 		 274 aa  86.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2989  diaminopimelate epimerase  30.68 
 
 		 285 aa  86.3  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000823328  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1150  Diaminopimelate epimerase  27.45 
 
 		 287 aa  86.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.756006  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3983  diaminopimelate epimerase  27.76 
 
 		 274 aa  85.5  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.983346  normal  0.2689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>