More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1827 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  100 
 
 
472 aa  938    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  67.3 
 
 
474 aa  626  1e-178  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  57.37 
 
 
451 aa  487  1e-136  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2729  amino acid carrier protein  56.59 
 
 
466 aa  487  1e-136  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.370789  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  54.39 
 
 
469 aa  468  9.999999999999999e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  50.22 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  44.9 
 
 
457 aa  372  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00948  hypothetical protein  46.54 
 
 
494 aa  363  3e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  44.61 
 
 
459 aa  362  8e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  44.54 
 
 
459 aa  358  8e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  44.61 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  44.25 
 
 
458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  44.49 
 
 
457 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5201  sodium/alanine symporter family protein  44.69 
 
 
476 aa  355  7.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000104264  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  44.15 
 
 
460 aa  355  1e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  44.18 
 
 
459 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5217  sodium/alanine symporter family protein  44.47 
 
 
476 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000991647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004447  sodium/alanine symporter  46.71 
 
 
477 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00130712  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5206  sodium/alanine symporter family protein  44.25 
 
 
476 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000860779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  43.83 
 
 
456 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0042  sodium/alanine symporter family protein  44.25 
 
 
476 aa  352  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000137228  hitchhiker  3.60033e-21 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4886  amino acid carrier protein  44.09 
 
 
476 aa  352  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000301461  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  42.92 
 
 
463 aa  351  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  43.82 
 
 
458 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  44.03 
 
 
458 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4925  sodium/alanine symporter family protein  43.82 
 
 
476 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000331766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  44.03 
 
 
458 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  43.82 
 
 
458 aa  350  3e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5301  sodium/alanine symporter family protein  43.82 
 
 
476 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000212742  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4788  sodium/alanine symporter family protein  43.82 
 
 
476 aa  348  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000329294  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0281  amino acid carrier protein  43.15 
 
 
502 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000471022  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2548  putative amino-acid transporter  44.49 
 
 
477 aa  346  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  44.49 
 
 
448 aa  345  8e-94  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  43.84 
 
 
453 aa  345  1e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3148  amino acid carrier protein  43.1 
 
 
493 aa  343  5e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0728  amino acid carrier protein  43.71 
 
 
478 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2219  sodium:alanine symporter family protein  43.97 
 
 
466 aa  342  9e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000474691  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1935  sodium/alanine symporter  44.49 
 
 
476 aa  341  1e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192586  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  41.49 
 
 
458 aa  341  2e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  43.58 
 
 
445 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1931  sodium/alanine symporter family protein  43.53 
 
 
466 aa  340  5e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000563858  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  42.44 
 
 
462 aa  337  2.9999999999999997e-91  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  42.44 
 
 
462 aa  337  3.9999999999999995e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  42.24 
 
 
455 aa  335  7e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4913  sodium/alanine symporter family protein  42.52 
 
 
477 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5289  sodium/alanine symporter family protein  42.52 
 
 
477 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  42.14 
 
 
449 aa  334  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  41.07 
 
 
457 aa  333  3e-90  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  42.43 
 
 
459 aa  333  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2252  amino acid carrier protein  40.71 
 
 
498 aa  333  5e-90  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0078903  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  43.64 
 
 
452 aa  332  6e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  44.44 
 
 
447 aa  332  6e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  43.64 
 
 
452 aa  332  1e-89  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0662  amino acid carrier protein  43.59 
 
 
502 aa  331  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.166259  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0916  sodium:alanine symporter family protein  40.79 
 
 
480 aa  331  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000210867  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  43.24 
 
 
455 aa  331  2e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  42.67 
 
 
461 aa  331  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  42.89 
 
 
455 aa  330  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0350  amino acid carrier protein  43.38 
 
 
470 aa  330  3e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.229783  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  41.49 
 
 
455 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  41.97 
 
 
455 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  41.06 
 
 
456 aa  329  5.0000000000000004e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0082  amino acid carrier protein  44.79 
 
 
468 aa  330  5.0000000000000004e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  43.44 
 
 
464 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  41.76 
 
 
455 aa  329  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.76 
 
 
455 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4885  amino acid carrier protein  41.7 
 
 
481 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000179822  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  43.04 
 
 
457 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17250  putative amino acid permease  41.99 
 
 
471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  43.41 
 
 
452 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1498  putative amino acid permease  41.34 
 
 
471 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  42.73 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.54 
 
 
455 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  43.15 
 
 
452 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  43.15 
 
 
452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  43.15 
 
 
452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  40.62 
 
 
449 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  43.15 
 
 
452 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 
455 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 
455 aa  327  3e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3642  amino acid carrier protein  42.25 
 
 
480 aa  327  3e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000772826  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1039  amino acid carrier protein  39.45 
 
 
479 aa  327  4.0000000000000003e-88  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  41.54 
 
 
455 aa  326  5e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0307  amino acid carrier protein  40.6 
 
 
495 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5190  sodium/alanine symporter family protein  42.73 
 
 
477 aa  325  1e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192209  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  41.52 
 
 
453 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  41.52 
 
 
453 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4924  sodium/alanine symporter family protein  41.61 
 
 
479 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000393697  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2493  putative sodium/alanine symporter  39.03 
 
 
489 aa  324  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1436  amino acid carrier protein  41.63 
 
 
470 aa  325  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000367507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0043  sodium/alanine symporter family protein  41.28 
 
 
480 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000159546  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0383  amino acid carrier protein  41.13 
 
 
497 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5300  sodium/alanine symporter family protein  41.61 
 
 
479 aa  325  2e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000179263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  42.92 
 
 
456 aa  324  3e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4768  sodium/alanine symporter family protein  41.4 
 
 
479 aa  324  3e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.12132e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5216  sodium/alanine symporter family protein  41.4 
 
 
479 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5204  sodium/alanine symporter family protein  42.3 
 
 
477 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000326996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5169  sodium/alanine symporter family protein  41.61 
 
 
479 aa  324  3e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.07907e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4787  sodium/alanine symporter family protein  41.19 
 
 
479 aa  323  4e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000561362  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5200  sodium/alanine symporter family protein  41.4 
 
 
479 aa  323  5e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000109666  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>