238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1822 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1822  uracil-DNA glycosylase  100 
 
 
230 aa  470  1e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1111  uracil-DNA glycosylase  77.09 
 
 
231 aa  370  1e-102  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0112  uracil-DNA glycosylase  73.57 
 
 
232 aa  334  6e-91  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0347  uracil-DNA glycosylase  71.05 
 
 
235 aa  328  4e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0126  uracil-DNA glycosylase  62.28 
 
 
229 aa  292  3e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.560482  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0093  uracil-DNA glycosylase  60.35 
 
 
231 aa  283  1e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0121  uracil-DNA glycosylase  59.47 
 
 
231 aa  283  2e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0081  uracil-DNA glycosylase  59.91 
 
 
231 aa  282  3e-75  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.110525  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2726  uracil-DNA glycosylase  60.36 
 
 
223 aa  264  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1590  uracil-DNA glycosylase  55.02 
 
 
269 aa  253  2e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  5.1966e-11  hitchhiker  5.89305e-06 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0009  uracil-DNA glycosylase  57.47 
 
 
224 aa  248  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1676  uracil-DNA glycosylase  55.02 
 
 
245 aa  248  8e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0536187  normal  0.595891 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1562  uracil-DNA glycosylase  58.18 
 
 
223 aa  247  1e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.118173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13610  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
232 aa  246  3e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4236  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
230 aa  245  3e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0400  hypothetical protein  56.83 
 
 
220 aa  245  3e-64  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1497  uracil-DNA glycosylase  54.11 
 
 
247 aa  245  4e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0754216  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2992  uracil-DNA glycosylase  53.78 
 
 
235 aa  243  1e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4770  uracil-DNA glycosylase  53.51 
 
 
231 aa  244  1e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.740506  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3970  uracil-DNA glycosylase  55.16 
 
 
230 aa  244  1e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.439338  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54590  uracil-DNA glycosylase  53.07 
 
 
231 aa  242  3e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000185097  normal  0.0296541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0198  uracil-DNA glycosylase  55.91 
 
 
221 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.495889  normal  0.174961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2820  uracil-DNA glycosylase  55.66 
 
 
241 aa  242  4e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.840691 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1349  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 
231 aa  240  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170175  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0054  uracil-DNA glycosylase  55.41 
 
 
223 aa  239  2e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3241  uracil-DNA glycosylase  52.91 
 
 
233 aa  239  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1413  uracil-DNA glycosylase  54.02 
 
 
230 aa  238  7e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4308  uracil-DNA glycosylase  53.57 
 
 
230 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2288  uracil-DNA glycosylase  52.86 
 
 
223 aa  236  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.4813e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03325  uracil-DNA glycosylase  53.46 
 
 
221 aa  236  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100053  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1381  uracil-DNA glycosylase  53.36 
 
 
229 aa  235  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.541157  normal  0.225249 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2033  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
221 aa  234  9e-61  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4397  uracil-DNA glycosylase  53.57 
 
 
230 aa  234  9e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0808  uracil-DNA glycosylase  52.65 
 
 
231 aa  233  1e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0481  uracil-DNA glycosylase  52.04 
 
 
223 aa  233  2e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0802006  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2059  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
245 aa  233  2e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.963745 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0246  uracil-DNA glycosylase  52.73 
 
 
221 aa  232  3e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00388102 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3206  uracil-DNA glycosylase  51.98 
 
 
261 aa  233  3e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.240216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1054  uracil-DNA glycosylase  52.02 
 
 
230 aa  232  4e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3560  uracil-DNA glycosylase  51.57 
 
 
233 aa  231  8e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03712  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
241 aa  230  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2796  uracil-DNA glycosylase  52.56 
 
 
228 aa  229  2e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.416019  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1058  uracil-DNA glycosylase  54.13 
 
 
225 aa  228  5e-59  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2586  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 
222 aa  228  5e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0237  uracil-DNA glycosylase  49.55 
 
 
222 aa  227  1e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1084  uracil-DNA glycosylase  53.49 
 
 
240 aa  227  1e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  3.21985e-05  hitchhiker  1.31635e-09 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0951  uracil-DNA glycosylase  53.39 
 
 
225 aa  225  3e-58  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004450  uracil-DNA glycosylase  52.05 
 
 
226 aa  226  3e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0252327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1556  uracil-DNA glycosylase  53.81 
 
 
225 aa  225  5e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.478183 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02438  hypothetical protein  51.15 
 
 
229 aa  224  7e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.372619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02474  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
229 aa  224  7e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.386825  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2912  uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
221 aa  224  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0496469  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3817  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
229 aa  223  1e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.01333  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2152  uracil-DNA glycosylase  51.8 
 
 
253 aa  224  1e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.957234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0465  uracil-DNA glycosylase  47.53 
 
 
226 aa  223  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.878798  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1057  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 
228 aa  223  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0610651  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2241  uracil-DNA glycosylase  51.35 
 
 
253 aa  223  3e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3454  uracil-DNA glycosylase  51.33 
 
 
229 aa  222  4e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0594128 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1088  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
229 aa  221  6e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0467841  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1097  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
229 aa  221  6e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00580941  normal  0.146724 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2956  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
229 aa  221  6e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0497126  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2737  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
229 aa  221  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.00069e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3082  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
228 aa  221  7e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0349858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2269  uracil-DNA glycosylase  52.75 
 
 
243 aa  221  8e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2865  uracil-DNA glycosylase  52.51 
 
 
301 aa  221  8e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.644996  normal  0.824735 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1041  uracil-DNA glycosylase  52.58 
 
 
217 aa  220  1e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  2.82189e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2733  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
229 aa  220  1e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00800854  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12267  predicted protein  48.87 
 
 
227 aa  221  1e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10973  putative uracil-DNA glycosylase  51.82 
 
 
221 aa  221  1e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2867  uracil-DNA glycosylase  50.69 
 
 
229 aa  220  1e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0155178  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1193  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
228 aa  220  1e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00106549  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1229  putative uracil-DNA glycosylase  54.17 
 
 
218 aa  219  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3371  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 
224 aa  219  4e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  3.1363e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0397  uracil-DNA glycosylase  54.79 
 
 
229 aa  219  4e-56  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.359974  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2757  uracil-DNA glycosylase  51.61 
 
 
229 aa  218  5e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00257883  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3683  uracil-DNA glycosylase  51.63 
 
 
227 aa  218  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  7.21221e-06  normal  0.0564802 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3670  uracil-DNA glycosylase  50.45 
 
 
237 aa  217  9e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.769625  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1938  uracil-DNA glycosylase  50.46 
 
 
226 aa  217  1e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3484  uracil-DNA glycosylase  52.07 
 
 
229 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2975  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
229 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2841  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
229 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.619436  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2859  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
229 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.721357  normal  0.53223 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2863  uracil-DNA glycosylase  51.15 
 
 
229 aa  217  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.466868  normal  0.345403 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0613  uracil-DNA glycosylase  52.09 
 
 
222 aa  216  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3577  uracil-DNA glycosylase  52.29 
 
 
222 aa  216  2e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3588  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
262 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1218  uracil-DNA glycosylase  51.64 
 
 
218 aa  216  3e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.145482  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0618  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 
218 aa  216  3e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.378617  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3561  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
262 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.922311  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3919  uracil-DNA glycosylase  50.23 
 
 
225 aa  216  3e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3580  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
271 aa  216  3e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.386025  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0604  uracil-DNA glycosylase  48.83 
 
 
218 aa  216  3e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5096  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
225 aa  215  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.601619  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5577  uracil-DNA glycosylase  49.77 
 
 
225 aa  215  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00945  uracil-DNA glycosylase  50.68 
 
 
226 aa  215  4e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0528  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
268 aa  214  6e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.822722  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_94976  predicted protein  49.55 
 
 
244 aa  214  6e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.978497 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1915  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
259 aa  215  6e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0649  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
259 aa  215  6e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0945  uracil-DNA glycosylase  49.78 
 
 
259 aa  215  6e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>