More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1797 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  100 
 
 		 241 aa  496  1e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0091  hypothetical protein  56.43 
 
 		 240 aa  281  6.000000000000001e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0346514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0311  hypothetical protein  40.25 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.322092  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0288  hypothetical protein  39.42 
 
 		 239 aa  172  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  39.83 
 
 		 239 aa  168  6e-41  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0040  hypothetical protein  39.81 
 
 		 232 aa  168  8e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0514  methyltransferase domain-containing protein  35.68 
 
 		 242 aa  161  1e-38  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0992  Methyltransferase type 11  29.27 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.358942  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  33.16 
 
 		 261 aa  94.4  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  31.68 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  30.17 
 
 		 253 aa  70.1  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  27.86 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 267 aa  63.5  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  26.21 
 
 		 299 aa  63.2  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  37.14 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  30 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  21.37 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.93 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 286 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  28.68 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  40.24 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  30.43 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  27.65 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  32.38 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2109  hypothetical protein  45.71 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  40 
 
 		 278 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0296  methyltransferase type 11  23.95 
 
 		 284 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  25.95 
 
 		 279 aa  52.8  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  30.53 
 
 		 276 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  41.33 
 
 		 243 aa  52  0.000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3549  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  35.71 
 
 		 449 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.029326  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  31 
 
 		 279 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.46 
 
 		 275 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  27.54 
 
 		 279 aa  50.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.5 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3858  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.21 
 
 		 260 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000301378 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2633  methyltransferase  35.37 
 
 		 250 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.193989  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  24.71 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1749  methyltransferase type 12  38.98 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.110719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  30.83 
 
 		 283 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  22.14 
 
 		 323 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  25 
 
 		 270 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3390  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  34.29 
 
 		 449 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.02988  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2071  hypothetical protein  32.47 
 
 		 144 aa  50.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2134  hypothetical protein  42.86 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  35.62 
 
 		 577 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  35.62 
 
 		 577 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0468  hypothetical protein  29.46 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 287 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  32.18 
 
 		 264 aa  49.3  0.00005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2320  methyltransferase  35.37 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.407436  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0911  Methyltransferase type 11  27.54 
 
 		 247 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  23.36 
 
 		 265 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  24.63 
 
 		 302 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2591  methyltransferase  35.37 
 
 		 250 aa  49.3  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.59659e-17 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.82 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  30.67 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.15 
 
 		 291 aa  48.9  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4911  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.83 
 
 		 270 aa  48.9  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.168902 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  29.82 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 203 aa  48.9  0.00008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.25 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  31.2 
 
 		 239 aa  48.5  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2984  methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 227 aa  48.5  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.452511  normal  0.396011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4949  methyltransferase type 11  30.49 
 
 		 256 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.31 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  30.21 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.72 
 
 		 253 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  30.67 
 
 		 457 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  29.59 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  33.33 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  26.21 
 
 		 283 aa  48.5  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0217  methyltransferase  29.63 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.11 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 266 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2163  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 284 aa  47.4  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.669447  normal  0.0704024 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.18 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2777  methyltransferase  34.15 
 
 		 250 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.786225  hitchhiker  0.00000000105145 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2579  methyltransferase type 11  38 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000242226  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  29.71 
 
 		 286 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  27 
 
 		 280 aa  47.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3852  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.31 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  34.67 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  31.78 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.61 
 
 		 275 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1110  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.35 
 
 		 449 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0268238  normal  0.546108 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  31.51 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3163  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.86 
 
 		 431 aa  46.6  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0558904  normal  0.0471726 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 247 aa  47  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3179  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.86 
 
 		 431 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0330224  normal  0.448815 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1176  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  32.35 
 
 		 463 aa  47  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0393959  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.88 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>