More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1787 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  100 
 
 
241 aa  476  1e-133  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  74.9 
 
 
246 aa  363  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  6.14006e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  72.03 
 
 
239 aa  340  1e-92  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  66.81 
 
 
238 aa  315  3e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  64.73 
 
 
245 aa  292  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  60.43 
 
 
250 aa  286  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  60 
 
 
248 aa  285  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  60.76 
 
 
250 aa  282  3e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  57.2 
 
 
251 aa  275  4e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  7.10089e-05 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  62.08 
 
 
240 aa  275  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  60.26 
 
 
248 aa  273  1e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  57.38 
 
 
249 aa  270  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  60.09 
 
 
241 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  decreased coverage  8.73859e-07 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  56.85 
 
 
249 aa  270  2e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  55.32 
 
 
241 aa  266  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  59.57 
 
 
253 aa  266  3e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  59.83 
 
 
247 aa  265  7e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  57.45 
 
 
238 aa  264  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  56.9 
 
 
253 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  57.81 
 
 
253 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4229  Integral membrane protein TerC  60.08 
 
 
264 aa  262  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0769944  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  56.78 
 
 
238 aa  261  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  52.79 
 
 
518 aa  261  9e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  59.15 
 
 
255 aa  260  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.4631e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  52.36 
 
 
522 aa  258  6e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  54.27 
 
 
253 aa  257  1e-67  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  59.15 
 
 
238 aa  257  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  6.78399e-05  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  57.63 
 
 
259 aa  257  1e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  55.65 
 
 
254 aa  256  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  56.9 
 
 
250 aa  255  4e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  56.96 
 
 
256 aa  254  7e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  56.07 
 
 
256 aa  253  2e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2490  Integral membrane protein TerC  60.85 
 
 
251 aa  252  4e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  56.07 
 
 
265 aa  252  5e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  55.97 
 
 
255 aa  252  5e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  56.9 
 
 
252 aa  251  7e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  58.12 
 
 
245 aa  251  7e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
518 aa  250  1e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  57.69 
 
 
257 aa  250  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.07273e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  50.21 
 
 
522 aa  249  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  55.23 
 
 
256 aa  249  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0196  TerC family integral membrane protein  61 
 
 
242 aa  248  5e-65  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  55.83 
 
 
238 aa  248  5e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2160  integral membrane protein TerC  57.38 
 
 
249 aa  248  6e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  55.56 
 
 
252 aa  248  7e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1762  integral membrane protein TerC  50.84 
 
 
530 aa  247  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.171934  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  49.15 
 
 
522 aa  247  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2087  Integral membrane protein TerC  58.97 
 
 
248 aa  246  2e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0217  TerC family integral membrane protein  61.7 
 
 
239 aa  245  4e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2677  integral membrane protein TerC  49.16 
 
 
527 aa  245  5e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15378 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  52.14 
 
 
242 aa  245  5e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  57.14 
 
 
252 aa  245  6e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  48.93 
 
 
523 aa  244  7e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  56.6 
 
 
237 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  56.6 
 
 
237 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  56.6 
 
 
237 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  9.95784e-07 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  56.6 
 
 
237 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  56.6 
 
 
237 aa  244  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  1.96217e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2812  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 
514 aa  244  9e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0276679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.08 
 
 
519 aa  244  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.08 
 
 
519 aa  243  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  47.08 
 
 
519 aa  243  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  47.08 
 
 
519 aa  243  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  47.08 
 
 
519 aa  243  1e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1852  integral membrane protein TerC  52.16 
 
 
522 aa  244  1e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  54.01 
 
 
259 aa  243  2e-63  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0858  Integral membrane protein TerC  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  3.83082e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3030  integral membrane protein, TerC family  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.30968e-09  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  4.74889e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  4.21681e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  55.17 
 
 
248 aa  243  2e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  56.72 
 
 
252 aa  243  2e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  53.42 
 
 
253 aa  243  2e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0179  TerC family integral membrane protein  61.7 
 
 
239 aa  243  2e-63  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.9602e-05  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4099  integral membrane protein, TerC family  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  1.2685e-06  hitchhiker  0.00127098 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.51436e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2979  TerC family integral membrane protein  55.74 
 
 
237 aa  243  2e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.02037e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
250 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  53.85 
 
 
253 aa  242  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
250 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  53.42 
 
 
253 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  46.67 
 
 
518 aa  243  3e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  47.93 
 
 
523 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 
250 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.12 
 
 
516 aa  242  3e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.29507e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  57.14 
 
 
250 aa  242  4e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.95379e-06 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.47451e-05  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  48.12 
 
 
518 aa  242  4e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  48.31 
 
 
523 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  48.31 
 
 
523 aa  241  6e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2948  Integral membrane protein TerC  51.67 
 
 
240 aa  241  7e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  48.54 
 
 
518 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>