182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1772 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1772  outer membrane protein transport protein (ompp1/fadl/todx)  100 
 
 
413 aa  849    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000672167  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1488  outer membrane protein transport protein (OMPP1/FadL/TodX)  69.49 
 
 
415 aa  610  1e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000022561  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1669  membrane protein  44.34 
 
 
427 aa  352  5e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0246  membrane protein  40.27 
 
 
435 aa  324  2e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0135  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  38.46 
 
 
405 aa  290  3e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1834  hypothetical protein  32.78 
 
 
413 aa  229  1e-58  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0420265  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04350  outer membrane protein P1, putative  25.86 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0256286  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3521  long-chain fatty acid transport protein, outer membrane protein  27.02 
 
 
407 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0893  outer membrane protein P1, putative  27.61 
 
 
422 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.325084  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1287  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.43 
 
 
421 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.102696  normal  0.683767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4102  outer membrane protein  26.09 
 
 
429 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.630925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1689  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.49 
 
 
421 aa  110  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.918972  normal  0.897129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47540  putative outer membrane protein precursor  27.2 
 
 
424 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.638983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1245  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.8 
 
 
421 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0947409  normal  0.253916 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0339  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  26.67 
 
 
452 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000148311  normal  0.499418 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1800  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.13 
 
 
424 aa  106  9e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.839799  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1993  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.43 
 
 
412 aa  105  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.131408  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4030  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.98 
 
 
426 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150189  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3824  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.75 
 
 
428 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0401  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.76 
 
 
449 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000690815 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0475  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.82 
 
 
451 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0415  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.76 
 
 
449 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000169798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0390  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.76 
 
 
449 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0389  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.76 
 
 
449 aa  103  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0397  long-chain fatty acid transport protein  25.35 
 
 
445 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000252847 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4232  long-chain fatty acid transport protein  24.18 
 
 
437 aa  102  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2113  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.38 
 
 
364 aa  102  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.628404  normal  0.519362 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3816  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.52 
 
 
450 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3004  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.93 
 
 
450 aa  102  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.853487  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002851  long-chain fatty acid transport protein  25.31 
 
 
442 aa  101  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1655  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.39 
 
 
423 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0166252  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3584  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
448 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1758  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.82 
 
 
430 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.407775  normal  0.7461 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0068  aromatic hydrocarbon degradation protein  26.65 
 
 
417 aa  99.8  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.952244  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0372  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
448 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3757  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.48 
 
 
449 aa  99.8  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0902024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1767  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.25 
 
 
424 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0166103  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03125  hypothetical protein  24.69 
 
 
429 aa  99.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3669  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.82 
 
 
427 aa  96.7  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.832534  normal  0.097076 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2174  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.43 
 
 
410 aa  96.3  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3342  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.77 
 
 
436 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15331  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2706  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.17 
 
 
400 aa  95.5  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.327378  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2658  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.81 
 
 
450 aa  95.1  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000308676  normal  0.803813 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0104  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.32 
 
 
439 aa  94.7  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0340  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.45 
 
 
450 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000312339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1551  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.44 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0286516  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1720  outer membrane protein  23.17 
 
 
424 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0182152  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2708  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.34 
 
 
413 aa  93.2  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0589559 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4546  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.75 
 
 
432 aa  92  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495383  normal  0.0136159 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3082  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.36 
 
 
416 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000123053  unclonable  0.0000131367 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3234  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.26 
 
 
420 aa  92.4  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3468  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.4 
 
 
451 aa  92  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  normal  0.254623 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3092  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.77 
 
 
450 aa  92.4  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.148936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0698  long-chain fatty acid transport protein  25.44 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1379  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.83 
 
 
450 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.918562  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05817  hypothetical protein  25.63 
 
 
414 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0891  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25 
 
 
453 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00668397  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000183  long-chain fatty acid transport protein  25.75 
 
 
414 aa  90.5  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0205909  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3370  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.79 
 
 
458 aa  90.5  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1588  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.94 
 
 
422 aa  90.1  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000227474  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3839  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
430 aa  89.4  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000632854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2270  outer membrane protein transport protein  25.25 
 
 
438 aa  89.4  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000125338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1585  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.11 
 
 
404 aa  89  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2596  long chain fatty acid transport protein  23.89 
 
 
405 aa  87.8  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0488563  normal  0.346925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3059  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.16 
 
 
442 aa  88.2  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292585  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0470  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.66 
 
 
401 aa  88.2  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2482  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.01 
 
 
423 aa  87.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1548  outer membrane protein P1  23.85 
 
 
453 aa  87  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000809472  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0374  long-chain fatty acid transport protein  24.29 
 
 
412 aa  87  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1410  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  25.06 
 
 
406 aa  86.7  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.343268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0385  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.95 
 
 
421 aa  86.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1397  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.95 
 
 
421 aa  86.3  9e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1506  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.95 
 
 
421 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0138985  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1313  aromatic hydrocarbon degradation protein  23.47 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2600  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23.15 
 
 
422 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.243825  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2044  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.67 
 
 
419 aa  83.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00212006  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0351  outer membrane protein transport protein  23.83 
 
 
407 aa  82.8  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0140181  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03834  Long-chain fatty acid transport protein  23.08 
 
 
464 aa  82.8  0.00000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000417169  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0907  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.04 
 
 
430 aa  82.8  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000931505 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0560  long-chain fatty acid transport protein  23.32 
 
 
432 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00871251  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5070  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.22 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0344553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0500  aromatic hydrocarbon degradation protein  25.86 
 
 
420 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0350  aromatic hydrocarbon degradation protein  21.67 
 
 
401 aa  80.5  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000805243 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0339  OMPP1/FadL/TodX family outer membrane protein  23.04 
 
 
409 aa  80.1  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.746595  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1000  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.66 
 
 
402 aa  80.1  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.768268  hitchhiker  0.00646641 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1338  long-chain fatty acid outer membrane transporter  23 
 
 
417 aa  80.1  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3046  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.8 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0808  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.56 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.124211  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1450  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  23.72 
 
 
428 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000153151  unclonable  0.0000000000946875 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1252  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.61 
 
 
446 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000958296  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1548  aromatic hydrocarbon degradation protein  24.72 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000033121  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0065  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.59 
 
 
428 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.709413 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0032  membrane protein  24.82 
 
 
407 aa  73.2  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0035  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  24.78 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.05747  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1441  long-chain fatty acid outer membrane transporter  20.97 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1804  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.46 
 
 
426 aa  71.2  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.388514  normal  0.581648 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3793  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.86 
 
 
436 aa  71.2  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0891393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1587  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  21.57 
 
 
438 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000318349  unclonable  0.00000000000430527 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2609  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  22.01 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000112018  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0539  aromatic hydrocarbon degradation membrane protein  20.67 
 
 
488 aa  69.7  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>