More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1768 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1768  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
83 aa  168  2e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000123557  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1024  30S ribosomal protein S17  93.98 
 
 
83 aa  163  9e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00110885  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0043  30S ribosomal protein S17  85.19 
 
 
85 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.183118  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0093  30S ribosomal protein S17  79.52 
 
 
83 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1959  30S ribosomal protein S17  77.11 
 
 
83 aa  137  3.9999999999999997e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.493665  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1866  30S ribosomal protein S17  75.9 
 
 
83 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1695  30S ribosomal protein S17  75.9 
 
 
83 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000812231  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0068  30S ribosomal protein S17  72.29 
 
 
83 aa  133  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00143996  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2072  30S ribosomal protein S17  73.49 
 
 
83 aa  132  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0741725  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0295  30S ribosomal protein S17  69.62 
 
 
82 aa  121  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00357598  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2146  SSU ribosomal protein S17P  49.35 
 
 
138 aa  80.5  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0316675  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  50.63 
 
 
87 aa  80.1  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  52.63 
 
 
86 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  45.68 
 
 
87 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2898  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 
97 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  50 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
82 aa  76.6  0.00000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0167  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350413  hitchhiker  0.000281031 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  51.47 
 
 
86 aa  76.3  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4681  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
82 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000864007  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  49.37 
 
 
88 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  50.72 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4308  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000115651  unclonable  0.0000000000430661 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1624  ribosomal protein S17  50 
 
 
85 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0188  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 
86 aa  75.9  0.0000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.27191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
91 aa  75.5  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2414  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 
101 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000854587  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0611  ribosomal protein S17  44.3 
 
 
84 aa  74.7  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.758418 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1355  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.132856  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2160  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0103749  normal  0.166866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1842  30S ribosomal protein S17  47.44 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0587769  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0478  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
83 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.112019  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  49.37 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  45.68 
 
 
88 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0190  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00542058  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  43.37 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1845  30S ribosomal protein S17  44.87 
 
 
120 aa  73.2  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.48409e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  44.74 
 
 
83 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  49.37 
 
 
84 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00454  30S ribosomal protein S17  48.05 
 
 
85 aa  72  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.301377  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  45.45 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  45.95 
 
 
82 aa  72  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0717  ribosomal protein S17  43.21 
 
 
85 aa  71.2  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.451923  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0157  ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000117396  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
89 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4312  ribosomal protein S17  47.3 
 
 
94 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.572719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3750  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000077178  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0205  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000179685  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4047  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000100461  unclonable  0.00000000000380928 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0209  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000139872  unclonable  0.00000794162 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4161  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000038185  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0846  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.349116  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3010  30S ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000740755  normal  0.0471511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1736  30S ribosomal protein S17  46.58 
 
 
86 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000020777  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0179  ribosomal protein S17  42.86 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000265086  n/a   
 
 
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  50 
 
 
88 aa  70.1  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2941  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00001015  hitchhiker  0.00000362348 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3288  30S ribosomal protein S17  46.75 
 
 
89 aa  70.1  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000278806  hitchhiker  0.00000199578 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0222  30S ribosomal subunit protein S17  46.75 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000618059  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_002950  PG1929  30S ribosomal protein S17  46.84 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0864  ribosomal protein S17  42.86 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.549145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  43.75 
 
 
84 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5070  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000035859  normal  0.128482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
90 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2765  30S ribosomal protein S17  43.04 
 
 
88 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144726  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0851  ribosomal protein S17  46.58 
 
 
101 aa  70.1  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1156  30S ribosomal protein S17  45.57 
 
 
85 aa  68.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000188626  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2055  30S ribosomal protein S17  45.21 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000336499  normal  0.395653 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  46.84 
 
 
86 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  44.16 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0962  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
99 aa  68.9  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00820919  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0635  ribosomal protein S17  44.3 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000269745  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4539  30S ribosomal protein S17  44.3 
 
 
88 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0332  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000873863  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  46.58 
 
 
89 aa  68.6  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0781  ribosomal protein S17  44.3 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3308  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000182432  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5778  30S ribosomal protein S17  46.58 
 
 
120 aa  68.6  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.274363  normal  0.420923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1564  ribosomal protein S17  44.59 
 
 
87 aa  68.6  0.00000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.997362 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  42.86 
 
 
107 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0282  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000313457  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3170  30S ribosomal protein S17  49.3 
 
 
92 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000175324  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0287  30S ribosomal protein S17  47.89 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000277089 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf433  ribosomal protein S17  47.3 
 
 
94 aa  67.8  0.00000000004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  47.83 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  46.15 
 
 
84 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>