More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1760 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1760  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 118 aa  231  3e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00341283  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 		 118 aa  185  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1017  50S ribosomal protein L18  89.83 
 
 		 118 aa  185  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000395061  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1859  50S ribosomal protein L18  76.27 
 
 		 118 aa  183  6e-46  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1688  50S ribosomal protein L18  76.27 
 
 		 118 aa  183  6e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.949463  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2065  50S ribosomal protein L18  75.42 
 
 		 118 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0100  50S ribosomal protein L18  72.03 
 
 		 118 aa  172  9.999999999999999e-43  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0050  50S ribosomal protein L18  77.12 
 
 		 118 aa  162  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.341657  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1952  ribosomal protein L18  63.56 
 
 		 118 aa  154  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0302  50S ribosomal protein L18  63.56 
 
 		 118 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.488983  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  51.4 
 
 		 115 aa  106  9.000000000000001e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  46.28 
 
 		 119 aa  103  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  47.71 
 
 		 120 aa  99.8  1e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  45.95 
 
 		 119 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 118 aa  97.1  7e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  45 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  45 
 
 		 118 aa  96.7  1e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  43.75 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  46.3 
 
 		 116 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  45.61 
 
 		 121 aa  94  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 115 aa  93.6  8e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  42.28 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  44.86 
 
 		 114 aa  92  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  42.02 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  45.45 
 
 		 118 aa  91.3  5e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  42.02 
 
 		 122 aa  90.5  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  45.1 
 
 		 117 aa  89.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  47.37 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf425  ribosomal protein L18  50 
 
 		 115 aa  89  2e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  41.44 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  86.7  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  40.74 
 
 		 116 aa  86.3  1e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  40.35 
 
 		 120 aa  85.5  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  41.18 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  41.28 
 
 		 117 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  39.83 
 
 		 121 aa  84.7  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  42.02 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  45.05 
 
 		 121 aa  84  6e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  40.16 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  40.16 
 
 		 119 aa  84  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  40.35 
 
 		 120 aa  83.6  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  41.82 
 
 		 114 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  38.71 
 
 		 122 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  39.17 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  41.38 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  37.82 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  37.82 
 
 		 120 aa  82.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  41.23 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  41.96 
 
 		 120 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  39.06 
 
 		 123 aa  81.3  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  43.48 
 
 		 118 aa  80.9  0.000000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  40.34 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  48.57 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  38.66 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  40.5 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  39.64 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  41.9 
 
 		 112 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  40.17 
 
 		 117 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  39.13 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  38.53 
 
 		 119 aa  79.7  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  40.68 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  40.74 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  38.53 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  40.54 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  39.45 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  39.45 
 
 		 119 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  39.32 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  37.4 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  40.18 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  40.54 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  40.59 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  78.2  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  40.74 
 
 		 116 aa  77.8  0.00000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  39.09 
 
 		 137 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  40 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  37.39 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  41.75 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  41.75 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  41.75 
 
 		 134 aa  77.4  0.00000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  38.84 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  40.54 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  38.78 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  37.27 
 
 		 120 aa  76.3  0.0000000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  41.24 
 
 		 116 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  38.18 
 
 		 136 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  41.07 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  39.62 
 
 		 112 aa  76.3  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  38.94 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  35.09 
 
 		 117 aa  75.5  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  34.45 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  38.94 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  38.26 
 
 		 120 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>