More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1759 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1759  30S ribosomal protein S5  100 
 
 
147 aa  292  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00134618  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1016  30S ribosomal protein S5  97.28 
 
 
147 aa  285  1e-76  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000116786  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0076  30S ribosomal protein S5  89.73 
 
 
158 aa  268  3e-71  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.504275  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1858  30S ribosomal protein S5  89.04 
 
 
147 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1687  30S ribosomal protein S5  89.04 
 
 
147 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2064  30S ribosomal protein S5  89.04 
 
 
147 aa  265  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0051  30S ribosomal protein S5  86.3 
 
 
147 aa  261  2e-69  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.546505  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1951  ribosomal protein S5  83.67 
 
 
147 aa  256  5e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0101  30S ribosomal protein S5  82.76 
 
 
146 aa  250  6e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0303  30S ribosomal protein S5  75.35 
 
 
146 aa  221  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.924443  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  64.79 
 
 
166 aa  183  8e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.28927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.95354e-09  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.20585e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.3601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.26666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  64.03 
 
 
166 aa  179  8e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 
166 aa  179  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.348e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  63.31 
 
 
166 aa  179  1e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  64.08 
 
 
166 aa  179  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  60.53 
 
 
182 aa  178  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  64.29 
 
 
166 aa  175  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  62.59 
 
 
168 aa  174  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  57.53 
 
 
172 aa  174  5e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.52788e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  62.24 
 
 
168 aa  173  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  61.54 
 
 
166 aa  171  2e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.49284e-05  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  60.71 
 
 
167 aa  170  6e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.09593e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  61.87 
 
 
165 aa  169  1e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  64.03 
 
 
173 aa  169  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  59.44 
 
 
163 aa  168  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  58.74 
 
 
166 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  60.14 
 
 
168 aa  167  4e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  59.29 
 
 
180 aa  167  4e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  54.79 
 
 
206 aa  167  5e-41  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  59.29 
 
 
166 aa  167  5e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
165 aa  166  9e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  57.86 
 
 
165 aa  166  9e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  59.86 
 
 
164 aa  166  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  58.57 
 
 
180 aa  164  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  8.76107e-05  hitchhiker  7.86108e-05 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  55.32 
 
 
190 aa  161  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1632  ribosomal protein S5  59.71 
 
 
172 aa  161  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  57.75 
 
 
166 aa  160  5e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  56.55 
 
 
167 aa  159  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf423  ribosomal protein S5  56.43 
 
 
234 aa  159  1e-38  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0618  ribosomal protein S5  50.68 
 
 
169 aa  159  1e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  54.93 
 
 
225 aa  158  2e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  6.96393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 
220 aa  158  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.27793e-05  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  57.45 
 
 
236 aa  158  3e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  60.71 
 
 
167 aa  157  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  58.99 
 
 
166 aa  157  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  56.43 
 
 
179 aa  157  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  55.94 
 
 
168 aa  157  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  55.86 
 
 
222 aa  157  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.82419e-06  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  57.45 
 
 
238 aa  157  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  56.55 
 
 
215 aa  157  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00955  30S ribosomal protein S5  52.14 
 
 
166 aa  155  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  55.24 
 
 
169 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  56.03 
 
 
223 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  55.24 
 
 
169 aa  155  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  56.03 
 
 
223 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  6.81641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  56.55 
 
 
166 aa  155  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  60.29 
 
 
208 aa  156  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 
166 aa  155  1e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0438  30S ribosomal protein S5  52.86 
 
 
166 aa  155  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0839334  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  56.03 
 
 
223 aa  155  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  55.24 
 
 
169 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 
166 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  55.71 
 
 
169 aa  155  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.30874e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  58.82 
 
 
166 aa  155  2e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  56.2 
 
 
163 aa  155  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0679  30S ribosomal protein S5  55.48 
 
 
254 aa  154  3e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2890  ribosomal protein S5  53.57 
 
 
163 aa  154  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3978  ribosomal protein S5  54.23 
 
 
168 aa  154  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  57.64 
 
 
199 aa  154  4e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  58.09 
 
 
162 aa  154  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4673  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 
168 aa  154  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000106514  unclonable  9.08127e-09 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1164  30S ribosomal protein S5  52.86 
 
 
174 aa  154  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00523189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0216  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 
167 aa  154  5e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  2.81151e-09  hitchhiker  1.27878e-09 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0715  30S ribosomal protein S5  58.09 
 
 
189 aa  154  5e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.128922  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0216  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 
167 aa  154  5e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000901319  unclonable  1.54128e-11 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4300  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 
167 aa  154  5e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.20088e-08  unclonable  6.04487e-11 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0248  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 
167 aa  154  5e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  59.85 
 
 
200 aa  154  5e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  54 
 
 
162 aa  154  5e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.75279e-06  hitchhiker  1.14757e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0211  30S ribosomal protein S5  47.62 
 
 
167 aa  154  5e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0010203  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3742  30S ribosomal protein S5  46.94 
 
 
167 aa  153  6e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  3.426e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0175  30S ribosomal protein S5  49.66 
 
 
167 aa  153  6e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  4.90298e-05  decreased coverage  5.58993e-05 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1006  30S ribosomal protein S5  48.98 
 
 
167 aa  154  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00241211  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  56.62 
 
 
215 aa  153  7e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  5.41133e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  54 
 
 
162 aa  153  7e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  54.74 
 
 
172 aa  153  8e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0201  30S ribosomal protein S5  48.97 
 
 
168 aa  153  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  5.49797e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0411  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 
168 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0386  30S ribosomal protein S5  53.33 
 
 
168 aa  152  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0422  30S ribosomal protein S5  52.14 
 
 
166 aa  152  1e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0728588  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0209  ribosomal protein S5  55.88 
 
 
153 aa  152  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0230  30S ribosomal protein S5  47.59 
 
 
168 aa  152  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  2.59388e-08  unclonable  8.56318e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>