21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1635 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1635  peptidase M50  100 
 
 
396 aa  761    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1841  hypothetical protein  59.9 
 
 
393 aa  421  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0686029  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0560  hypothetical protein  47.58 
 
 
393 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.174074  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1436  hypothetical protein  33.17 
 
 
423 aa  146  8.000000000000001e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.841332  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0794  hypothetical protein  30.46 
 
 
411 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0467  hypothetical protein  31.65 
 
 
410 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000668675  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0347  hypothetical protein  29.92 
 
 
407 aa  110  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0120833  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0267  hypothetical protein  25.91 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0700  hypothetical protein  27.33 
 
 
428 aa  63.9  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.694234  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2153  hypothetical protein  24.03 
 
 
434 aa  63.5  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1722  hypothetical protein  26.33 
 
 
460 aa  62.8  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4376  hypothetical protein  25.27 
 
 
455 aa  58.5  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1457  hypothetical protein  24.48 
 
 
451 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.629081  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0494  hypothetical protein  26.55 
 
 
432 aa  55.8  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6282  hypothetical protein  25.61 
 
 
452 aa  53.9  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.454076  normal  0.917457 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0253  hypothetical protein  25.24 
 
 
455 aa  51.2  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.8172  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0229  hypothetical protein  25.24 
 
 
428 aa  51.2  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1552  hypothetical protein  24.4 
 
 
416 aa  49.3  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1647  hypothetical protein  25.52 
 
 
451 aa  48.1  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.605477  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1889  hypothetical protein  26.63 
 
 
432 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0901  hypothetical protein  24.19 
 
 
408 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.809724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>