More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1580 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  80.1 
 
 
769 aa  1255    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  100 
 
 
783 aa  1560    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  80.23 
 
 
769 aa  1256    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  79.64 
 
 
770 aa  1222    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  63.56 
 
 
803 aa  999    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  79.97 
 
 
769 aa  1258    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  89.57 
 
 
785 aa  1381    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  72.75 
 
 
774 aa  1143    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  80.25 
 
 
770 aa  1238    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  47.01 
 
 
770 aa  567  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  46.86 
 
 
598 aa  550  1e-155  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  47.23 
 
 
610 aa  543  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  47.72 
 
 
601 aa  544  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
604 aa  542  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  47.28 
 
 
603 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  47.31 
 
 
607 aa  536  1e-151  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  39.55 
 
 
719 aa  464  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  40.49 
 
 
685 aa  462  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  37.79 
 
 
681 aa  462  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  36.98 
 
 
714 aa  453  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  39.31 
 
 
650 aa  456  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  37.67 
 
 
709 aa  451  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  41.47 
 
 
639 aa  442  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0874  putative CheA signal transduction histidine kinases  37.55 
 
 
677 aa  434  1e-120  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  52.77 
 
 
606 aa  431  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
687 aa  431  1e-119  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 
696 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  37.52 
 
 
723 aa  431  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1343  CheA signal transduction histidine kinase  36.91 
 
 
653 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0441377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  34.57 
 
 
702 aa  423  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  39.19 
 
 
878 aa  420  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1806  chemotaxis protein CheA  35.07 
 
 
670 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.917647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1547  CheA signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
656 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1524  CheA signal transduction histidine kinases  39.31 
 
 
766 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.82922 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1749  chemotaxis histidine kinase  34.48 
 
 
670 aa  410  1e-113  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  36.66 
 
 
652 aa  412  1e-113  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4224  CheA signal transduction histidine kinases  36.85 
 
 
801 aa  410  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.424073  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0658  CheA signal transduction histidine kinases  36.75 
 
 
928 aa  410  1e-113  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231862  normal  0.831096 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4155  CheA signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
729 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00201987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1507  chemotaxis protein  34.64 
 
 
667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0831836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1696  chemotaxis protein CheA  34.27 
 
 
672 aa  409  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3650  chemotaxis protein CheA  34.38 
 
 
667 aa  405  1e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1518  chemotaxis protein  34.48 
 
 
667 aa  404  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1728  chemotaxis protein CheA  34.48 
 
 
667 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  37.07 
 
 
655 aa  404  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 
673 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2325  CheA signal transduction histidine kinase  37.23 
 
 
760 aa  401  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0655  CheA signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 
695 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000249153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4838  CheA signal transduction histidine kinase  39.18 
 
 
935 aa  399  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.552774  hitchhiker  0.00614515 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4035  CheA signal transduction histidine kinase  39.78 
 
 
921 aa  396  1e-109  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.703964  normal  0.275969 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2466  chemotaxis protein CheA  35.69 
 
 
674 aa  393  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.406126  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0521  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  36.05 
 
 
942 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58429  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  43.53 
 
 
745 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1792  CheA signal transduction histidine kinase  47.04 
 
 
701 aa  395  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2611  chemotaxis protein CheA  35 
 
 
669 aa  390  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.561376  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
934 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3376  CheA signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
911 aa  390  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.163998  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  41.73 
 
 
747 aa  386  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  36.44 
 
 
888 aa  388  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  41.79 
 
 
747 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  36.07 
 
 
715 aa  388  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  37.81 
 
 
910 aa  389  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1872  CheA signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
937 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  46.24 
 
 
767 aa  385  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
686 aa  383  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  41.91 
 
 
736 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
796 aa  385  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1855  chemotaxis protein CheA  36.02 
 
 
662 aa  384  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.110168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  34.4 
 
 
681 aa  385  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2277  putative CheA signal transduction histidine kinase  43.24 
 
 
759 aa  385  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  37.37 
 
 
934 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
746 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  43.7 
 
 
760 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  45.34 
 
 
675 aa  382  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2985  chemotaxis protein CheA  35.48 
 
 
655 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.65 
 
 
734 aa  381  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
737 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  41.46 
 
 
738 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2027  CheA signal transduction histidine kinase  46.73 
 
 
691 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  44.11 
 
 
1031 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2026  CheA signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 
666 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  35.75 
 
 
654 aa  374  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  47.81 
 
 
743 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
747 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1491  chemotaxis protein CheA  39.27 
 
 
801 aa  376  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  35.43 
 
 
654 aa  374  1e-102  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  35.03 
 
 
669 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  46.75 
 
 
748 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  47.34 
 
 
747 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  45.76 
 
 
660 aa  374  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1080  CheA signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
682 aa  376  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000655427 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0212  CheA signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 
728 aa  373  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.432304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  48.07 
 
 
739 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  37.95 
 
 
922 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  41.12 
 
 
751 aa  375  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3027  CheA signal transduction histidine kinases  41.59 
 
 
754 aa  373  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  35.6 
 
 
652 aa  374  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  35.6 
 
 
652 aa  373  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  35.03 
 
 
669 aa  373  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  35.6 
 
 
654 aa  373  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>