39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1523 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1523  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  813    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1626  hypothetical protein  47.41 
 
 		 402 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00390674  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06567  hypothetical protein  31.1 
 
 		 169 aa  67.4  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2234  uncharacterized lipoprotein NlpE involved in copper resistance  25.45 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000688  lipoprotein  37.63 
 
 		 178 aa  57.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.222485  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3163  lipoprotein  28.48 
 
 		 150 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1548  lipoprotein  35.16 
 
 		 163 aa  53.1  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000337346  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1336  copper resistance lipoprotein NlpE  34.07 
 
 		 170 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.534526  hitchhiker  0.00193123 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1401  copper resistance lipoprotein NlpE  34.07 
 
 		 168 aa  50.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0735011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1389  lipoprotein  34.07 
 
 		 168 aa  49.3  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.14974  hitchhiker  0.000530536 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1928  protein of unknown function DUF306, Meta and HslJ  31.52 
 
 		 278 aa  49.7  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00000453787  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1432  putative lipoprotein  31.29 
 
 		 143 aa  48.1  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.384033  normal  0.561285 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2869  lipoprotein  25.33 
 
 		 149 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.875572  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3687  lipoprotein  34.31 
 
 		 172 aa  46.6  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3071  lipoprotein  27.92 
 
 		 169 aa  46.6  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2886  lipoprotein  28.89 
 
 		 148 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1490  copper resistance lipoprotein NlpE  28.89 
 
 		 149 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.136329  normal  0.226076 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3015  lipoprotein  28.89 
 
 		 149 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.247333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0204  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3410  copper resistance lipoprotein NlpE  25.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0963  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.96 
 
 		 232 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.316289  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00190  hypothetical protein  25.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.373948  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3215  lipoprotein, putative  28.85 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0203  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.852847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2819  lipoprotein  28.85 
 
 		 149 aa  45.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.271135 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0282  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.03 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.943806  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0268  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.03 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.03 
 
 		 233 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105174  normal  0.673786 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0186  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3467  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.451187 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00191  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320519  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0197  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0195  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  25.71 
 
 		 236 aa  45.1  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3338  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  35 
 
 		 229 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1624  copper homeostasis protein CutF  28.42 
 
 		 144 aa  44.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.041939  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0279  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.03 
 
 		 233 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.469251  normal  0.756281 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0263  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  27.03 
 
 		 233 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.327669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3759  lipoprotein involved with copper homeostasis and adhesion  31.78 
 
 		 227 aa  43.5  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.0000000579479  normal  0.0900317 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3563  lipoprotein  29.67 
 
 		 147 aa  43.5  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.829032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>