17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1459 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  100 
 
 
402 aa  803    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  63.51 
 
 
414 aa  514  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  45.41 
 
 
406 aa  323  3e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  46.02 
 
 
406 aa  323  3e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  45.24 
 
 
405 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  43.62 
 
 
420 aa  293  4e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  37.65 
 
 
421 aa  240  2.9999999999999997e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  35.99 
 
 
425 aa  186  9e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  35.99 
 
 
425 aa  182  7e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  34.01 
 
 
431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  35.65 
 
 
424 aa  164  3e-39  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  31.78 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1548  hypothetical protein  24.69 
 
 
374 aa  50.1  0.00007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.982258  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0135  hypothetical protein  25.81 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.881577  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2207  metalloid reductase RarA  29.71 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2087  outer membrane porin  27.81 
 
 
452 aa  44.7  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0366  outer membrane porin  27.88 
 
 
403 aa  43.5  0.007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000502534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>