58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1371 on replicon NC_009796
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  100 
 
 		 197 aa  404  1.0000000000000001e-112  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  51.6 
 
 		 198 aa  204  8e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  51.32 
 
 		 199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0096  peptidase family protein  53.51 
 
 		 129 aa  139  3e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  32.86 
 
 		 244 aa  87  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  29.17 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  32.61 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  30.67 
 
 		 253 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  32.39 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  30.99 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  30.59 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  29.29 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  27.46 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0095  peptidase family protein  54.39 
 
 		 67 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  30 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  30.99 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  28.68 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  30 
 
 		 238 aa  65.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  29.35 
 
 		 226 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  26.76 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  26.76 
 
 		 227 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  25.65 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  25.65 
 
 		 237 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  27.95 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  30 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  30.22 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  27.86 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  30 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  29.41 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  28.75 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  29.41 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  27.52 
 
 		 760 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  28.74 
 
 		 251 aa  59.3  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  28.82 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  26.24 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  25.35 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  27.97 
 
 		 716 aa  55.5  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  26.11 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  26.62 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  30.08 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  27.59 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.89 
 
 		 738 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.2 
 
 		 727 aa  53.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  25.65 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  27.66 
 
 		 734 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27.66 
 
 		 734 aa  50.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  28.35 
 
 		 521 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  25.98 
 
 		 738 aa  48.5  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 1038 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  28.28 
 
 		 1038 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  26.92 
 
 		 736 aa  46.2  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A02  bacteriocin-processing peptidase  24.32 
 
 		 716 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  26.9 
 
 		 715 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3347  ABC-type bacteriocin transporter  27.54 
 
 		 721 aa  43.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0880292 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  24.6 
 
 		 727 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  27.78 
 
 		 722 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  25.52 
 
 		 1019 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>