16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1362 on replicon NC_009796
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009796  CCC13826_1362  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  780    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0822479  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0936  hypothetical protein  91.84 
 
 
382 aa  728    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0472  hypothetical protein  36.64 
 
 
360 aa  164  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.446039  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0929  glutamyl-tRNA synthetase (glutamate--tRNA ligase; GluRS)  33.24 
 
 
367 aa  157  3e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0127  flagellar basal-body rod protein FlgG (Distal rod protein)  32.21 
 
 
366 aa  155  1e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.912909  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1355  hypothetical protein  38.38 
 
 
368 aa  154  2e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0740  hypothetical protein  36.17 
 
 
423 aa  152  8.999999999999999e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.530729  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0835  hypothetical protein  33.23 
 
 
444 aa  125  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.334407  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0815  hypothetical protein  32.92 
 
 
424 aa  124  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.272305  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0885  hypothetical protein  33.23 
 
 
434 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.159164  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0905  hypothetical protein  37.45 
 
 
415 aa  115  1.0000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0157  hypothetical protein  36.78 
 
 
417 aa  113  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.414245  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1772  hypothetical protein  29.51 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.460228  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0051  hypothetical protein  34.69 
 
 
330 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0930  DNA polymerase III subunit alpha  32.14 
 
 
237 aa  62  0.00000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1358  hypothetical protein  31.25 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.219209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>