More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1337 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1337  carboxypeptidase G2  100 
 
 
372 aa  759    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.214507  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001112  acetylornithine deacetylase  34.77 
 
 
374 aa  240  4e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04865  carboxypeptidase G2  34.77 
 
 
374 aa  237  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3078  glutamate carboxypeptidase  34.65 
 
 
413 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125209  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  34.65 
 
 
413 aa  176  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2050  glutamate carboxypeptidase  34.65 
 
 
409 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  30.87 
 
 
394 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0967  peptidase dimerization domain protein  32.8 
 
 
385 aa  170  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0818  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.68 
 
 
358 aa  160  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.548763  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0795  peptidase dimerisation domain-containing protein  34.68 
 
 
358 aa  160  4e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2417  peptidase M20  29.95 
 
 
383 aa  154  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0660551  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28060  glutamate carboxypeptidase  28.42 
 
 
412 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0939662  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1369  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.96 
 
 
394 aa  153  4e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1914  peptidase M20  29.86 
 
 
409 aa  151  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28653  hitchhiker  0.00843843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2444  glutamate carboxypeptidase  27.88 
 
 
409 aa  150  4e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1915  glutamate carboxypeptidase  29.35 
 
 
432 aa  149  6e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4254  peptidase M20  29.58 
 
 
375 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749883  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5033  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.76 
 
 
376 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.379056  hitchhiker  0.00853617 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5339  peptidase dimerisation domain protein  30.81 
 
 
377 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.538527  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2120  peptidase, M20/M25/M40 family  29.9 
 
 
415 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2204  glutamate carboxypeptidase  28.34 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.498847  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2261  peptidase M20:peptidase M20  31.49 
 
 
383 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.158188  normal  0.807548 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2460  peptidase dimerisation domain-containing protein  29.08 
 
 
363 aa  143  5e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.308375  normal  0.162998 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0052  M20 family peptidase  30.4 
 
 
376 aa  143  5e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2570  peptidase, M20/M25/M40 family  30.67 
 
 
383 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.27383  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4146  peptidase M20  31.35 
 
 
420 aa  138  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.74761  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2375  peptidase M20  29.18 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0895  peptidase M20  28.04 
 
 
372 aa  136  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.111399  normal  0.0352819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1198  carboxypeptidase  29.44 
 
 
376 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0237  peptidase M20  28.84 
 
 
388 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0492  peptidase M20  29.24 
 
 
376 aa  132  9e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0471333  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1858  hypothetical protein  27.99 
 
 
423 aa  132  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0460852  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3818  peptidase dimerisation domain-containing protein  28.08 
 
 
405 aa  132  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12450  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  30 
 
 
376 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0366  peptidase M20  28.57 
 
 
367 aa  131  2.0000000000000002e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0873  carboxypeptidase  28.68 
 
 
376 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0916  peptidase M20  27.5 
 
 
391 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4731  peptidase M20  28.5 
 
 
416 aa  130  4.0000000000000003e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1664  hypothetical protein  31.17 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0934  Glutamate carboxypeptidase  28.68 
 
 
391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0038  peptidase M20  29.48 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0036  peptidase M20  29.48 
 
 
388 aa  129  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1688  hypothetical protein  29.49 
 
 
387 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1410  carboxypeptidase  28.72 
 
 
376 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212173  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0328  peptidase M20  29.1 
 
 
372 aa  127  5e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0028  peptidase M20  27.08 
 
 
385 aa  126  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0179  glutamate carboxypeptidase  28.57 
 
 
382 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.881663 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0170  glutamate carboxypeptidase  30.19 
 
 
382 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334086  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0179  peptidase dimerisation domain protein  30.19 
 
 
382 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5255  carboxypeptidase  27.32 
 
 
376 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.481639  normal  0.0388322 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0190  peptidase dimerisation domain protein  30.19 
 
 
382 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0831507  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1670  hypothetical protein  29.94 
 
 
407 aa  122  9e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2201  hypothetical protein  28.34 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.449085 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4369  glutamate carboxypeptidase  25.4 
 
 
424 aa  120  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.407974  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1939  hypothetical protein  31.29 
 
 
402 aa  120  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3807  peptidase M20  29.74 
 
 
378 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.116948  normal  0.414196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6820  peptidase M20  30.23 
 
 
412 aa  120  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  decreased coverage  0.0081642 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4870  glutamate carboxypeptidase  24.87 
 
 
417 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.120273  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1368  carboxypeptidase  27.89 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4023  carboxypeptidase  27.39 
 
 
376 aa  119  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.50112  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1225  carboxypeptidase  27.39 
 
 
376 aa  116  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0884  hypothetical protein  32.08 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0896  carboxypeptidase  28.89 
 
 
388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.417572  normal  0.0534097 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5703  peptidase M20  26.57 
 
 
405 aa  113  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231398  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0530  hypothetical protein  29.97 
 
 
401 aa  112  9e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3983  peptidase dimerization domain protein  30.07 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0024  glutamate carboxypeptidase  24.74 
 
 
438 aa  109  9.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3093  glutamate carboxypeptidase  25.07 
 
 
436 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2730  peptidase dimerization domain protein  29.26 
 
 
385 aa  106  7e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.319557  normal  0.0559311 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3377  glutamate carboxypeptidase  24.87 
 
 
436 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1203  glutamate carboxypeptidase  25.53 
 
 
418 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3030  glutamate carboxypeptidase  24.08 
 
 
436 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0034  peptidase M20  29.21 
 
 
389 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0060  glutamate carboxypeptidase  24.41 
 
 
429 aa  99.8  8e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0524  peptidase, M20/M25/M40 family  24.94 
 
 
432 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1543  glutamate carboxypeptidase  24.42 
 
 
428 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3250  peptidase M20  25.26 
 
 
424 aa  90.1  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.470437  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1560  glutamate carboxypeptidase  23.16 
 
 
422 aa  87.4  3e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.400095  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1008  D-alanine--D-alanine ligase  21.45 
 
 
743 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2375  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.93 
 
 
377 aa  79.7  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2069  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.15 
 
 
391 aa  75.9  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.370348  normal  0.325609 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.86 
 
 
378 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2199  peptidase T-like protein  30.19 
 
 
389 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0595  tripeptidase  26.53 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2470  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.24 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00847211  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2367  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.93 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0319493  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1991  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.25 
 
 
381 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1892  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.22 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2418  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
376 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.508006  decreased coverage  0.00000131595 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1992  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.93 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0274072  hitchhiker  0.000000073122 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2354  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.24 
 
 
380 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.473063  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1605  peptidase T-like protein  26.84 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1348  peptidase T-like protein  27.48 
 
 
365 aa  73.6  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.868823  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1862  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.77 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000241136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1857  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183592 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2121  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 
381 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000264012 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1072  peptidase T-like protein  26.83 
 
 
374 aa  72.8  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.945662  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2471  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.55 
 
 
384 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2123  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.33 
 
 
379 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06810  peptidase T-like protein  27.95 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>