More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1324 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1324  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 220 aa  440  9.999999999999999e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.273971  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1280  DNA-binding response regulator  75 
 
 		 220 aa  340  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000547046  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1103  two-component response regulator  57.08 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0840  transcriptional activator protein CopR  50.68 
 
 		 222 aa  225  4e-58  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.048163  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1358  DNA-binding response regulator  54.9 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0519481  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1236  DNA-binding response regulator  54.9 
 
 		 221 aa  216  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000188808  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0504  DNA-binding response regulator  53.43 
 
 		 221 aa  209  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000376141  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0136  transcriptional activator protein CopR  50.45 
 
 		 220 aa  207  9e-53  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0528  transcriptional activator protein CopR  54.55 
 
 		 220 aa  204  7e-52  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0128  two-component response regulator  49.32 
 
 		 228 aa  202  3e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.4797  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0097  response regulator receiver  45.66 
 
 		 222 aa  184  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1365  two component transcriptional regulator  44.91 
 
 		 219 aa  177  2e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.00130586  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0120  response regulator receiver  40.74 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1773  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0884  two component transcriptional regulator  39.73 
 
 		 218 aa  151  8e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.68851  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1969  response regulator receiver domain-containing protein  37.16 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.478098  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1631  two component transcriptional regulator  36.77 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0039171  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1330  response regulator receiver  34.1 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3511  two component transcriptional regulator  35.62 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000699106  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0521  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 223 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.720367  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2799  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  142  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000368356  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  37.33 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3294  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  36.44 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0118223  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2130  response regulator receiver  34.23 
 
 		 252 aa  141  7e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539517  hitchhiker  0.00279069 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2277  two component transcriptional regulator  34.23 
 
 		 248 aa  141  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.113906  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1034  two component transcriptional regulator, winged helix family  37.16 
 
 		 219 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.171933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0583  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  0.467543 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4793  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.59 
 
 		 219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.732153 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2296  two component transcriptional regulator  33.03 
 
 		 255 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.398969  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0660  two component transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000259813  hitchhiker  0.0000270487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0622  DNA-binding response regulator  35.16 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0535  two component transcriptional regulator  35.29 
 
 		 223 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.660155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3383  two component transcriptional regulator  34.84 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0615  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 		 224 aa  138  6e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0124209  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3875  two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 224 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000754116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  34.1 
 
 		 223 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2765  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.497538  normal  0.0218205 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3352  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.63 
 
 		 225 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.41 
 
 		 220 aa  137  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.44 
 
 		 241 aa  137  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31270  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  31.8 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.014564  normal  0.249814 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1341  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 226 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0136  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.235991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1404  two component transcriptional regulator  34.53 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.153238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0856  two component transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0280  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5018  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0258  two component transcriptional regulator  34.56 
 
 		 217 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0200742  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0257  response regulator receiver  34.72 
 
 		 219 aa  135  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0523  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.09 
 
 		 224 aa  135  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3495  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.972301  normal  0.0200045 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1917  DNA-binding response regulator  34.26 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5325  two component transcriptional regulator  36.24 
 
 		 221 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02960  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.53 
 
 		 229 aa  134  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4293  two component transcriptional regulator  34.39 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000934276  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0576  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00494054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3692  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0674602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4693  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.41 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2526  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1566  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.42 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435599 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0485  two component transcriptional regulator  33.48 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3749  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.545663  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0650  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000493918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0227  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.84 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3006  response regulator receiver protein  34.7 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0347664  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4225  winged helix family two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0985  DNA-binding response regulator CiaR  37.39 
 
 		 226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.447626  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2264  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.78 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00910741  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3875  two component transcriptional regulator  34.7 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000900168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4064  two component transcriptional regulator  33.64 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.98903  normal  0.0666639 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21620  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.03 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.019443  normal  0.0473518 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5097  two component transcriptional regulator  35.78 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.361428  normal  0.112132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4258  response regulator receiver  29.95 
 
 		 220 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0567705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0634  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0540  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2440  two component transcriptional regulator  31.65 
 
 		 222 aa  133  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0936231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0571  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3931  two component transcriptional regulator  35.32 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  34.26 
 
 		 220 aa  132  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3593  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.55 
 
 		 226 aa  132  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000142937  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0142  DNA-binding response regulator  35.75 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0608  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0627  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1247  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.18 
 
 		 235 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.464606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4628  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.29 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000289587 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0165  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0155  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0636837 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3686  response regulator receiver  34.09 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0174  two component transcriptional regulator  31.96 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.947413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  32.16 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3792  two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.358087  normal  0.612342 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4731  DNA-binding response regulator  33.48 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1480  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.32 
 
 		 219 aa  132  5e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000681553  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1174  two component heavy metal response transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  131  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.216853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0386  two component transcriptional regulator  32.87 
 
 		 222 aa  132  6e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3061  two component transcriptional regulator  32.2 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.296421  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>