More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1289 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1560  TonB-dependent receptor  51.63 
 
 		 714 aa  714    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.3619  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1289  TonB-dependent receptor domain-containing protein  100 
 
 		 727 aa  1486    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00967025  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1610  TonB-dependent receptor  44.19 
 
 		 733 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  36.59 
 
 		 742 aa  401  9.999999999999999e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  36.83 
 
 		 718 aa  399  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  37.26 
 
 		 730 aa  400  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  37.12 
 
 		 727 aa  394  1e-108  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 774 aa  347  3e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  31.05 
 
 		 716 aa  346  1e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0366  TonB-dependent siderophore receptor  33.91 
 
 		 750 aa  340  7e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.167728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1183  TonB-dependent siderophore receptor  32.2 
 
 		 757 aa  330  8e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1080  TonB dependent receptor  48.82 
 
 		 335 aa  318  2e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0174  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 772 aa  277  4e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.191382 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0879  TonB-dependent receptor  35.26 
 
 		 378 aa  211  4e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.928768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.17 
 
 		 728 aa  210  9e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.66 
 
 		 729 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.502501  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3905  TonB-dependent siderophore receptor  27.41 
 
 		 731 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  26.88 
 
 		 811 aa  197  8.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  26.7 
 
 		 744 aa  192  2e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  27.79 
 
 		 811 aa  191  4e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  25.49 
 
 		 708 aa  191  5e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.26 
 
 		 802 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  28.45 
 
 		 746 aa  183  9.000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 808 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 768 aa  172  2e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 710 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 729 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 		 754 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2064  TonB-dependent siderophore receptor  27.16 
 
 		 734 aa  169  1e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000430928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 801 aa  169  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 743 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 710 aa  165  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  26.86 
 
 		 743 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  24.42 
 
 		 801 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  25.89 
 
 		 804 aa  164  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 751 aa  163  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  24.49 
 
 		 726 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 727 aa  163  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  27.23 
 
 		 755 aa  161  3e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  25.85 
 
 		 804 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  24.53 
 
 		 800 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  23.62 
 
 		 710 aa  157  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  25.44 
 
 		 743 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  26.68 
 
 		 722 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  25.98 
 
 		 764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  24.65 
 
 		 727 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 743 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  25.33 
 
 		 743 aa  154  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  25.97 
 
 		 702 aa  154  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  25.74 
 
 		 758 aa  153  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1625  TonB-dependent siderophore receptor  25.71 
 
 		 746 aa  153  8.999999999999999e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.930758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  26.77 
 
 		 737 aa  153  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  25.23 
 
 		 728 aa  153  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  24.72 
 
 		 719 aa  152  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6957  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 749 aa  152  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  23.67 
 
 		 724 aa  151  4e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2237  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 		 777 aa  151  4e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 698 aa  151  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  26.35 
 
 		 743 aa  150  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 728 aa  150  9e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  26.82 
 
 		 771 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  25.89 
 
 		 705 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  30.41 
 
 		 700 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.27 
 
 		 715 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4236  TonB-dependent siderophore receptor  23.76 
 
 		 710 aa  148  4.0000000000000006e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000695536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  24.43 
 
 		 704 aa  146  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  24.47 
 
 		 706 aa  146  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  25.26 
 
 		 702 aa  146  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  25.65 
 
 		 804 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  35.69 
 
 		 730 aa  145  3e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  23.72 
 
 		 762 aa  145  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  25.07 
 
 		 772 aa  145  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2129  TonB-dependent siderophore receptor  26.81 
 
 		 722 aa  144  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.759874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  24.54 
 
 		 761 aa  144  7e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  24.38 
 
 		 823 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3719  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 753 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525992  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3084  TonB-dependent siderophore receptor  25.21 
 
 		 764 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.159276  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3243  TonB-dependent siderophore receptor  24.09 
 
 		 728 aa  142  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.181533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  24.51 
 
 		 708 aa  141  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  26.4 
 
 		 761 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  24.22 
 
 		 804 aa  140  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3841  TonB-dependent siderophore receptor  23.08 
 
 		 712 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000249714  hitchhiker  0.000312087 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  24.75 
 
 		 809 aa  139  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  25 
 
 		 726 aa  139  2e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2123  TonB-dependent siderophore receptor  25.56 
 
 		 725 aa  139  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4894  TonB-dependent siderophore receptor  24.04 
 
 		 714 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.142345  normal  0.811526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  22.44 
 
 		 712 aa  138  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2266  TonB-dependent siderophore receptor  29.82 
 
 		 724 aa  138  4e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.238084  normal  0.145177 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2294  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 		 773 aa  138  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  26.14 
 
 		 756 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 		 709 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  22.64 
 
 		 724 aa  134  5e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 753 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3757  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 851 aa  132  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0566087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  24.44 
 
 		 805 aa  132  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 		 742 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4052  TonB-dependent siderophore receptor  25.94 
 
 		 839 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  23.89 
 
 		 738 aa  131  4.0000000000000003e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0110  TonB dependent receptor  23.92 
 
 		 693 aa  131  5.0000000000000004e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>