220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1288 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1288  serine protease  100 
 
 
279 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00462648  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0812  hypothetical protein  48.09 
 
 
271 aa  272  5.000000000000001e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1722  hypothetical protein  35.11 
 
 
279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26420  hypothetical protein  28.1 
 
 
265 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0492105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3030  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
274 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0429  methyltransferase type 12  27.21 
 
 
275 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0046  methyltransferase type 12  29.57 
 
 
283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.165361  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1177  ribosomal RNA adenine dimethylase  30.34 
 
 
274 aa  106  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1469  methyltransferase type 11  26.41 
 
 
280 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000470965  normal  0.0590447 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1090  methyltransferase  28.32 
 
 
283 aa  96.7  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000294134  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2275  methyltransferase type 12  26.71 
 
 
279 aa  95.9  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0245  ribosomal RNA adenine dimethylase  25.29 
 
 
278 aa  90.9  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.14559  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2737  methyltransferase  29.46 
 
 
278 aa  89.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000116085  decreased coverage  0.0000479797 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1510  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.86 
 
 
275 aa  88.6  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1781  SAM (and some other nucleotide) binding motif  27.04 
 
 
286 aa  87.4  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.183763  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1471  methyltransferase type 11  26.86 
 
 
279 aa  87.8  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0487894  normal  0.185117 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3701  methyltransferase type 12  25.34 
 
 
279 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1317  ribosomal RNA adenine dimethylase  25 
 
 
279 aa  85.9  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222413  normal  0.0120668 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1924  methyltransferase type 12  29 
 
 
291 aa  85.9  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.302412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0122  SAM-binding motif-containing protein  27.04 
 
 
286 aa  85.5  8e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.350495 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1672  hypothetical protein  28.45 
 
 
268 aa  85.5  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.51834  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1447  hypothetical protein  29.45 
 
 
280 aa  85.5  8e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.814616  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0150  methyltransferase  26.24 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.520005  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0005  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
293 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0234268 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2033  methyltransferase  24.45 
 
 
302 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.931745  normal  0.810156 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1550  hypothetical protein  37.06 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1645  hypothetical protein  27.72 
 
 
292 aa  81.6  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0146326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2016  methyltransferase  26.14 
 
 
283 aa  80.5  0.00000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1473  methyltransferase type 12  24.42 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0327  putative SAM-dependent methyltransferase  27.4 
 
 
323 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0207  hypothetical protein  22.07 
 
 
287 aa  73.9  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0172227  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1983  hypothetical protein  22.48 
 
 
295 aa  72.4  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0369  methyltransferase type 12  26.17 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.151072  normal  0.249023 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0235  methyltransferase type 12  26.05 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3103  methyltransferase type 11  22.46 
 
 
276 aa  71.2  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1588  Methyltransferase type 12  26.67 
 
 
293 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0308513  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0058  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
287 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0032  methyltransferase type 11  22.31 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2360  methyltransferase type 12  25.99 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.328542  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0281  hypothetical protein  28.16 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0206  hypothetical protein  21.48 
 
 
268 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0297191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1320  putative methyltransferase  23.86 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0114884 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0250  hypothetical protein  23.3 
 
 
273 aa  62.8  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09260  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.36 
 
 
352 aa  62.8  0.000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.505356  normal  0.0667798 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0599  methyltransferase domain-containing protein  25.84 
 
 
264 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.57053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1216  hypothetical protein  26.42 
 
 
286 aa  62  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.43284  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0682  SAM-binding motif-containing protein  27.23 
 
 
191 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.206315  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3567  hypothetical protein  26.24 
 
 
284 aa  60.1  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.109401 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1285  methyltransferase type 12  24.89 
 
 
273 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1127  methyltransferase type 12  28.09 
 
 
302 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.287777  hitchhiker  0.00000151267 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1590  Methyltransferase type 11  22.31 
 
 
298 aa  58.9  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0369722  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1495  hypothetical protein  24.43 
 
 
273 aa  58.9  0.00000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000420591  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1271  hypothetical protein  24.42 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000529075  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1982  hypothetical protein  22.03 
 
 
268 aa  57.4  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0225  hypothetical protein  25.1 
 
 
294 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2361  methyltransferase type 12  21.97 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  26.14 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 
267 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1950  putative methyltransferase  29.91 
 
 
270 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0292125 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  26.35 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1045  hypothetical protein  28.12 
 
 
277 aa  54.7  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2002  hypothetical protein  23.96 
 
 
289 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.419802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1230  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
180 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0668757  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0817  methyltransferase  34.65 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1916  putative SAM-dependent methyltransferase  22.39 
 
 
299 aa  52.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0326  hypothetical protein  23.08 
 
 
276 aa  52.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01690  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  21.46 
 
 
291 aa  52  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.160618  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  28.92 
 
 
270 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0487  Methyltransferase type 11  25 
 
 
270 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000866959 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1435  ribosomal L11 methyltransferase  36.73 
 
 
276 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4629  Methyltransferase type 11  27.87 
 
 
270 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0094  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  25.71 
 
 
439 aa  51.2  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.146255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2590  methyltransferase type 11  29.9 
 
 
260 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205764  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2634  hypothetical protein  23.03 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.167376  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.47 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.92 
 
 
256 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1481  hypothetical protein  23.01 
 
 
279 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  45.28 
 
 
263 aa  50.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1797  flagellar basal-body rod protein  27.54 
 
 
241 aa  50.4  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.119466  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.56 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  28.26 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.92 
 
 
256 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2814  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 
209 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  40.38 
 
 
273 aa  49.3  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.2 
 
 
256 aa  49.3  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.68 
 
 
262 aa  49.7  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1721  hypothetical protein  32.54 
 
 
239 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  31.62 
 
 
261 aa  49.3  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.4 
 
 
256 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4232  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
234 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5352  methyltransferase type 11  33.87 
 
 
268 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  41.79 
 
 
265 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  37.18 
 
 
248 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  26.4 
 
 
256 aa  48.9  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.93 
 
 
266 aa  48.1  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  40.62 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04480  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.52 
 
 
263 aa  47.8  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.110079  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.04 
 
 
229 aa  48.1  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0443  methyltransferase type 12  24.31 
 
 
208 aa  47.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1037  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>