More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1272 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 408 aa  834    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0925  histidyl-tRNA synthetase  68.22 
 
 		 410 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0894  histidyl-tRNA synthetase  67.24 
 
 		 409 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0307852  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  66.01 
 
 		 408 aa  528  1e-149  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  62.35 
 
 		 408 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 408 aa  495  1e-139  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  61.61 
 
 		 408 aa  496  1e-139  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1130  histidyl-tRNA synthetase  58.81 
 
 		 403 aa  476  1e-133  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0629126  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  57.82 
 
 		 402 aa  474  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 414 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 414 aa  342  8e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  41.59 
 
 		 424 aa  339  4e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 415 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 410 aa  339  5.9999999999999996e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 424 aa  333  5e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 419 aa  333  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1510  histidyl-tRNA synthetase  43.49 
 
 		 426 aa  331  1e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.707902  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 424 aa  329  5.0000000000000004e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3311  histidyl-tRNA synthetase  42.36 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 419 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2651  histidyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 		 425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0669  histidyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000705937  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.52 
 
 		 424 aa  325  6e-88  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2838  histidyl-tRNA synthetase  40 
 
 		 417 aa  325  7e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1230  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 425 aa  325  9e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 424 aa  324  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  43.61 
 
 		 418 aa  325  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1229  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 425 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.322745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.33 
 
 		 413 aa  323  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1300  histidyl-tRNA synthetase  42.12 
 
 		 425 aa  323  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 424 aa  323  4e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  323  5e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.36 
 
 		 416 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 413 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0013  histidyl-tRNA synthetase  41.89 
 
 		 419 aa  322  9.000000000000001e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.69 
 
 		 415 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  40.14 
 
 		 424 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 		 416 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1357  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 424 aa  320  3e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000835199 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1257  histidyl-tRNA synthetase  39.8 
 
 		 424 aa  319  6e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0282832  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  41.58 
 
 		 414 aa  318  1e-85  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1117  histidyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 		 424 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.727727  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004348  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01068  histidyl-tRNA synthetase  40.96 
 
 		 422 aa  317  3e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0730  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2364  histidyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 424 aa  317  3e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00827358  normal  0.389731 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1545  histidyl-tRNA synthetase  40.93 
 
 		 424 aa  316  4e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000365747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1433  histidyl-tRNA synthetase  40.44 
 
 		 424 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00243432  normal  0.636484 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1169  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 448 aa  313  1.9999999999999998e-84  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0566185  normal  0.367142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  39.42 
 
 		 424 aa  313  2.9999999999999996e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  39.9 
 
 		 424 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1374  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0595731  normal  0.400844 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3004  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0149184  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2989  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 426 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.212301  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  40.49 
 
 		 423 aa  312  5.999999999999999e-84  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3147  histidyl-tRNA synthetase  40.89 
 
 		 426 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00958807 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  38.76 
 
 		 429 aa  312  7.999999999999999e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  40.48 
 
 		 422 aa  311  1e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  39.95 
 
 		 429 aa  310  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1306  histidyl-tRNA synthetase  40.1 
 
 		 424 aa  311  2e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000890962  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2889  histidyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 422 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  40.34 
 
 		 417 aa  310  2.9999999999999997e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  40.7 
 
 		 424 aa  310  4e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 419 aa  309  5e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  38.44 
 
 		 423 aa  309  5e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  40.24 
 
 		 428 aa  309  5e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 435 aa  309  6.999999999999999e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  40.2 
 
 		 423 aa  309  6.999999999999999e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3303  histidyl-tRNA synthetase  39.11 
 
 		 421 aa  309  6.999999999999999e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.375458 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  38.9 
 
 		 429 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 423 aa  308  9e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1128  histidyl-tRNA synthetase  40.75 
 
 		 424 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  40.53 
 
 		 426 aa  306  3e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20680  histidyl-tRNA synthetase  37.38 
 
 		 464 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  39.56 
 
 		 424 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  40.43 
 
 		 429 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1435  histidyl-tRNA synthetase  40.19 
 
 		 429 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02980  histidyl-tRNA synthetase  40.68 
 
 		 427 aa  304  2.0000000000000002e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.651371  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2195  histidyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  38.92 
 
 		 417 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 429 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 429 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 		 429 aa  302  9e-81  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1788  histidyl-tRNA synthetase  38.05 
 
 		 423 aa  301  1e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 		 429 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>